Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HXS8

Protein Details
Accession A0A1Y2HXS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-56PSSSLHRHSGTRKRSRSRSRSRSPPPTANTPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-46TRKRSRSRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10, cyto_nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSRPDISAQKTLPAMNPSTSSSSAPSSSLHRHSGTRKRSRSRSRSRSPPPTANTPDSQQPPEHQPAKDLSKALVLRSPKPLPLSPSRTPSPARSAPLLAKRRAADQSDFDSELATLPDHCPTATYETMPIVDFGLAMLRSMGWQDGDGIGRGRNKKGAEVKPIQYIPRPGRLGLGAQPVPEGEEDAGPVYELPVTKMEIKVRKSLGVKSLVEITGGRHAGMLGVVKELMFNKEVARVELAANGDWVKVEAVDIRVLDEQDTNASGSSKVWVRPGLLVRIISKSLDGGRHYLRKGRIIDVLPGGVCVLEVDDSRRTLLDRVSQDDLETVVPSVRDQVCIVYLPRKLRNDKPYLLGMRGEVTEKDKKNQEVVVMTVEDEVVVCHFDHVCAVARGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.33
6 0.32
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.25
12 0.23
13 0.24
14 0.3
15 0.33
16 0.36
17 0.35
18 0.41
19 0.49
20 0.58
21 0.62
22 0.66
23 0.71
24 0.76
25 0.84
26 0.89
27 0.9
28 0.92
29 0.92
30 0.91
31 0.92
32 0.92
33 0.92
34 0.9
35 0.88
36 0.83
37 0.82
38 0.79
39 0.74
40 0.66
41 0.59
42 0.58
43 0.54
44 0.51
45 0.43
46 0.4
47 0.42
48 0.48
49 0.51
50 0.43
51 0.41
52 0.45
53 0.48
54 0.48
55 0.41
56 0.33
57 0.35
58 0.35
59 0.34
60 0.32
61 0.3
62 0.29
63 0.36
64 0.37
65 0.33
66 0.37
67 0.38
68 0.39
69 0.45
70 0.5
71 0.47
72 0.51
73 0.51
74 0.5
75 0.51
76 0.49
77 0.48
78 0.45
79 0.43
80 0.39
81 0.4
82 0.42
83 0.49
84 0.51
85 0.45
86 0.45
87 0.42
88 0.45
89 0.46
90 0.43
91 0.37
92 0.34
93 0.37
94 0.36
95 0.36
96 0.31
97 0.26
98 0.22
99 0.19
100 0.16
101 0.11
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.16
116 0.14
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.15
138 0.18
139 0.19
140 0.22
141 0.22
142 0.27
143 0.36
144 0.39
145 0.42
146 0.46
147 0.47
148 0.48
149 0.5
150 0.45
151 0.38
152 0.4
153 0.35
154 0.36
155 0.35
156 0.29
157 0.29
158 0.28
159 0.27
160 0.23
161 0.25
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.16
185 0.2
186 0.22
187 0.26
188 0.26
189 0.3
190 0.31
191 0.31
192 0.31
193 0.32
194 0.3
195 0.26
196 0.27
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.1
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.16
258 0.17
259 0.21
260 0.24
261 0.25
262 0.24
263 0.25
264 0.24
265 0.25
266 0.24
267 0.2
268 0.17
269 0.15
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.19
274 0.24
275 0.29
276 0.31
277 0.36
278 0.36
279 0.4
280 0.41
281 0.4
282 0.41
283 0.37
284 0.39
285 0.34
286 0.32
287 0.25
288 0.22
289 0.19
290 0.12
291 0.1
292 0.07
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.09
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.18
304 0.23
305 0.24
306 0.28
307 0.32
308 0.31
309 0.3
310 0.29
311 0.26
312 0.19
313 0.16
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.16
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.19
325 0.21
326 0.21
327 0.25
328 0.3
329 0.37
330 0.44
331 0.5
332 0.57
333 0.64
334 0.67
335 0.66
336 0.64
337 0.65
338 0.61
339 0.56
340 0.48
341 0.4
342 0.34
343 0.31
344 0.28
345 0.21
346 0.23
347 0.3
348 0.32
349 0.38
350 0.43
351 0.45
352 0.48
353 0.48
354 0.47
355 0.41
356 0.4
357 0.36
358 0.3
359 0.27
360 0.22
361 0.2
362 0.15
363 0.11
364 0.1
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.12
373 0.15
374 0.15