FuNGI

A0A1Y2HTC9

Protein Details

Accession

A0A1Y2HTC9

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
289-309	RSAPRSRSRSRSRDRGPRREW	Basic
335-361	REYYRSSRYRSRSRDRRDRHRDRDGGS	Basic
456-477	YSGSNSSRRRSRSPRDRGGDSY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
287-336	AARSAPRSRSRSRSRDRGPRREWADRDRDRDRDREYRRDYRDRDRDRDRE
338-355	YRSSRYRSRSRDRRDRHR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004882 Luc7-rel
Gene Ontology	GO:0005685 C:U1 snRNP GO:0003729 F:mRNA binding GO:0006376 P:mRNA splice site selection
Pfam	View protein in Pfam PF03194 LUC7

Amino Acid Sequences

MADWMRDMISKMMSEQGLDQGTLTEVQFDDPKVCRGFLEDVCLAELFVNTKLDQGECKNMHSIKLKDEYQAAHTDKGHGHPGVNRVMNDLERELAALVSDCDRRIRIANDRVAATQASRNLINLRQAIAEMEQKLTDLDKESDQLASDGKVEEMMAVVTQIEDIKKEKSEKEAELKNMIGHDSTAEQGMCVCDICGALLASEDATDRRVADHFTGKMHIGYDKVRTALRSLRDRLRQRPGAPLSRASSTSITTPATSHAPHPATGPRSTSSHSGSVHRDRSSGPMGAARSAPRSRSRSRSRDRGPRREWADRDRDRDRDREYRRDYRDRDRDRDREYYRSSRYRSRSRDRRDRHRDRDGGSRDGYSSSSSSRRNERGSSASLPNAAPAVATGEVDGAVAAPSTGDAMDITPTTTAEASAAPRSRSRDPRSSSDAYYPDYPRGGGGGGGPSNGDHYYSGSNSSRRRSRSPRDRGGDSYYGSGGSYRDRDHHHQYSVRDRERDRDSRDYRRGEREGSSGRGAVSAEYINMTRPMNDLVAAHAVERNLLSAVVSGTAPAGRRASTSGGVMSPGARGEGDKEEGEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.19
3	0.22
4	0.21
5	0.2
6	0.19
7	0.14
8	0.15
9	0.16
10	0.15
11	0.11
12	0.1
13	0.13
14	0.15
15	0.15
16	0.19
17	0.2
18	0.26
19	0.25
20	0.26
21	0.24
22	0.26
23	0.31
24	0.27
25	0.32
26	0.28
27	0.27
28	0.28
29	0.27
30	0.23
31	0.17
32	0.16
33	0.11
34	0.12
35	0.13
36	0.12
37	0.14
38	0.15
39	0.15
40	0.19
41	0.22
42	0.29
43	0.29
44	0.32
45	0.37
46	0.37
47	0.42
48	0.46
49	0.45
50	0.42
51	0.48
52	0.47
53	0.43
54	0.45
55	0.41
56	0.37
57	0.42
58	0.38
59	0.35
60	0.34
61	0.35
62	0.34
63	0.35
64	0.37
65	0.29
66	0.29
67	0.29
68	0.33
69	0.37
70	0.38
71	0.35
72	0.32
73	0.33
74	0.32
75	0.3
76	0.26
77	0.19
78	0.16
79	0.16
80	0.13
81	0.11
82	0.09
83	0.07
84	0.07
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.14
89	0.14
90	0.16
91	0.2
92	0.25
93	0.31
94	0.38
95	0.43
96	0.45
97	0.46
98	0.44
99	0.41
100	0.37
101	0.29
102	0.24
103	0.21
104	0.2
105	0.18
106	0.19
107	0.21
108	0.23
109	0.27
110	0.24
111	0.23
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.14
121	0.15
122	0.14
123	0.13
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.15
131	0.14
132	0.12
133	0.1
134	0.1
135	0.09
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.05
149	0.07
150	0.09
151	0.11
152	0.15
153	0.19
154	0.2
155	0.26
156	0.31
157	0.34
158	0.41
159	0.44
160	0.44
161	0.43
162	0.42
163	0.36
164	0.31
165	0.27
166	0.19
167	0.13
168	0.11
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.12
198	0.16
199	0.16
200	0.17
201	0.19
202	0.18
203	0.18
204	0.17
205	0.16
206	0.12
207	0.13
208	0.16
209	0.15
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.18
214	0.21
215	0.26
216	0.29
217	0.33
218	0.39
219	0.47
220	0.53
221	0.57
222	0.61
223	0.61
224	0.56
225	0.6
226	0.59
227	0.57
228	0.53
229	0.49
230	0.42
231	0.38
232	0.38
233	0.3
234	0.26
235	0.19
236	0.18
237	0.16
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.17
246	0.17
247	0.17
248	0.18
249	0.21
250	0.22
251	0.23
252	0.24
253	0.19
254	0.2
255	0.21
256	0.23
257	0.21
258	0.22
259	0.22
260	0.24
261	0.27
262	0.32
263	0.35
264	0.32
265	0.31
266	0.27
267	0.3
268	0.29
269	0.24
270	0.18
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.14
276	0.16
277	0.16
278	0.19
279	0.23
280	0.28
281	0.32
282	0.4
283	0.49
284	0.54
285	0.6
286	0.68
287	0.69
288	0.74
289	0.8
290	0.81
291	0.76
292	0.74
293	0.73
294	0.71
295	0.67
296	0.64
297	0.64
298	0.59
299	0.62
300	0.58
301	0.59
302	0.54
303	0.55
304	0.53
305	0.53
306	0.53
307	0.57
308	0.6
309	0.62
310	0.66
311	0.7
312	0.69
313	0.7
314	0.75
315	0.72
316	0.72
317	0.72
318	0.71
319	0.67
320	0.71
321	0.64
322	0.61
323	0.59
324	0.59
325	0.58
326	0.58
327	0.57
328	0.56
329	0.6
330	0.63
331	0.66
332	0.69
333	0.72
334	0.75
335	0.82
336	0.83
337	0.86
338	0.88
339	0.89
340	0.87
341	0.87
342	0.82
343	0.75
344	0.76
345	0.69
346	0.62
347	0.53
348	0.45
349	0.35
350	0.31
351	0.28
352	0.19
353	0.16
354	0.14
355	0.18
356	0.21
357	0.24
358	0.3
359	0.35
360	0.37
361	0.39
362	0.4
363	0.39
364	0.39
365	0.4
366	0.36
367	0.32
368	0.3
369	0.27
370	0.24
371	0.19
372	0.15
373	0.1
374	0.07
375	0.08
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.09
405	0.14
406	0.17
407	0.18
408	0.21
409	0.26
410	0.34
411	0.42
412	0.48
413	0.51
414	0.54
415	0.6
416	0.64
417	0.63
418	0.58
419	0.54
420	0.5
421	0.44
422	0.44
423	0.39
424	0.34
425	0.3
426	0.28
427	0.21
428	0.19
429	0.16
430	0.11
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.1
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.08
441	0.1
442	0.12
443	0.13
444	0.18
445	0.2
446	0.26
447	0.3
448	0.38
449	0.43
450	0.46
451	0.55
452	0.6
453	0.68
454	0.73
455	0.78
456	0.8
457	0.8
458	0.8
459	0.75
460	0.72
461	0.65
462	0.56
463	0.47
464	0.37
465	0.3
466	0.25
467	0.21
468	0.15
469	0.15
470	0.16
471	0.16
472	0.2
473	0.27
474	0.34
475	0.42
476	0.47
477	0.5
478	0.52
479	0.56
480	0.62
481	0.66
482	0.66
483	0.63
484	0.59
485	0.6
486	0.64
487	0.67
488	0.64
489	0.64
490	0.65
491	0.69
492	0.76
493	0.77
494	0.75
495	0.75
496	0.72
497	0.66
498	0.61
499	0.58
500	0.55
501	0.51
502	0.46
503	0.38
504	0.34
505	0.31
506	0.28
507	0.2
508	0.17
509	0.13
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.15
515	0.15
516	0.13
517	0.15
518	0.17
519	0.16
520	0.16
521	0.15
522	0.15
523	0.18
524	0.17
525	0.16
526	0.16
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.13
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.1
541	0.11
542	0.14
543	0.15
544	0.14
545	0.16
546	0.19
547	0.22
548	0.22
549	0.23
550	0.22
551	0.21
552	0.21
553	0.2
554	0.18
555	0.15
556	0.13
557	0.12
558	0.1
559	0.1
560	0.13
561	0.17
562	0.2

A0A1Y2HTC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer