Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HLT1

Protein Details
Accession A0A1Y2HLT1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-123ASTTTQPNPQKPKTKTPRDYSAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025986  RPAP3-like_C  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13877  RPAP3_C  
PF13414  TPR_11  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MMSRPAPAPTPTSTARLPTVGPAPPKTLTSASSSAKNDNTSIADIQLHIRRNAEEYRQVLDDLADWESHIKAAPLPSTSSLASASASSRPLPPVRGTAPLASTTTQPNPQKPKTKTPRDYSAWDKIDVDSLLQEMENQDYAEYHANSTPLANPTPTTAAQRNPQLALIEKDTGNVYFKKQKFQKAIKHYSKAIELDPLNPVLYLNRAAAFLKLDPPIHTEALEDCTRALDLDHGKNVKALFRRAMAKKVGGDRNGAIDDLKRAQVLEPTNAEVKRELLLLDPPKPKPVTNSPDGPLPAPLPGPQVKVPKRRKLVVREFSSAPVAQEPVAAKAIGAQEEELMTAVKTTTIANQGGFSPSRRRIRSRDQTGEGEEGPMLDAPLILASCPPPESAPEVATATPSEPAPADPPASPSQPGTITSTPKPETTSVPSPPSVMPSLPVPQAAYEFSMAISHLTRHAHLPAAAGQRHAVSVANVSDTARAYLLSIPPKHLLALFSTAGVDTEAIGWIVVMLRSLPPATDQKSAALKYNYLHYLSQCARFGVARRLLAKVYVDMVAEVAGEIRSMFDKEGKREAVEKVDKVKAVWGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.32
4 0.29
5 0.27
6 0.3
7 0.31
8 0.35
9 0.34
10 0.36
11 0.35
12 0.36
13 0.36
14 0.32
15 0.29
16 0.3
17 0.33
18 0.32
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.42
23 0.42
24 0.36
25 0.33
26 0.33
27 0.29
28 0.27
29 0.23
30 0.21
31 0.2
32 0.25
33 0.27
34 0.28
35 0.27
36 0.28
37 0.27
38 0.31
39 0.35
40 0.35
41 0.37
42 0.35
43 0.37
44 0.37
45 0.36
46 0.32
47 0.27
48 0.22
49 0.17
50 0.16
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.14
60 0.16
61 0.16
62 0.19
63 0.2
64 0.23
65 0.22
66 0.21
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.26
80 0.3
81 0.3
82 0.34
83 0.34
84 0.32
85 0.31
86 0.3
87 0.29
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.24
92 0.3
93 0.33
94 0.4
95 0.47
96 0.55
97 0.63
98 0.64
99 0.72
100 0.74
101 0.81
102 0.82
103 0.8
104 0.81
105 0.77
106 0.77
107 0.73
108 0.72
109 0.64
110 0.56
111 0.49
112 0.4
113 0.38
114 0.32
115 0.25
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.07
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.14
140 0.16
141 0.19
142 0.19
143 0.22
144 0.22
145 0.25
146 0.29
147 0.34
148 0.34
149 0.31
150 0.32
151 0.28
152 0.27
153 0.26
154 0.24
155 0.21
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.18
163 0.25
164 0.26
165 0.35
166 0.4
167 0.48
168 0.55
169 0.63
170 0.68
171 0.69
172 0.79
173 0.78
174 0.77
175 0.71
176 0.64
177 0.59
178 0.51
179 0.41
180 0.37
181 0.28
182 0.25
183 0.23
184 0.21
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.17
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.15
207 0.14
208 0.17
209 0.17
210 0.14
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.13
218 0.15
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.19
228 0.22
229 0.3
230 0.3
231 0.35
232 0.33
233 0.32
234 0.33
235 0.39
236 0.4
237 0.33
238 0.33
239 0.28
240 0.29
241 0.27
242 0.23
243 0.15
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.16
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.16
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.07
265 0.12
266 0.14
267 0.21
268 0.24
269 0.24
270 0.28
271 0.29
272 0.28
273 0.28
274 0.35
275 0.34
276 0.33
277 0.36
278 0.33
279 0.36
280 0.36
281 0.31
282 0.23
283 0.18
284 0.15
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.14
290 0.17
291 0.25
292 0.31
293 0.41
294 0.49
295 0.54
296 0.57
297 0.61
298 0.64
299 0.66
300 0.7
301 0.69
302 0.66
303 0.61
304 0.58
305 0.53
306 0.48
307 0.38
308 0.28
309 0.19
310 0.14
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.07
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.15
342 0.15
343 0.18
344 0.25
345 0.33
346 0.36
347 0.41
348 0.46
349 0.56
350 0.64
351 0.68
352 0.68
353 0.64
354 0.64
355 0.61
356 0.56
357 0.45
358 0.35
359 0.25
360 0.18
361 0.13
362 0.1
363 0.07
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.15
384 0.14
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.11
395 0.16
396 0.18
397 0.2
398 0.2
399 0.18
400 0.19
401 0.18
402 0.2
403 0.22
404 0.22
405 0.25
406 0.26
407 0.32
408 0.31
409 0.31
410 0.32
411 0.28
412 0.28
413 0.31
414 0.35
415 0.33
416 0.35
417 0.35
418 0.34
419 0.33
420 0.32
421 0.26
422 0.2
423 0.17
424 0.16
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.13
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.11
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.22
450 0.27
451 0.27
452 0.26
453 0.25
454 0.23
455 0.23
456 0.21
457 0.15
458 0.09
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.13
471 0.17
472 0.23
473 0.24
474 0.26
475 0.28
476 0.28
477 0.28
478 0.26
479 0.22
480 0.17
481 0.21
482 0.18
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.14
487 0.13
488 0.1
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.12
505 0.18
506 0.22
507 0.26
508 0.26
509 0.3
510 0.36
511 0.38
512 0.41
513 0.36
514 0.35
515 0.32
516 0.38
517 0.36
518 0.32
519 0.33
520 0.27
521 0.33
522 0.35
523 0.39
524 0.34
525 0.31
526 0.3
527 0.31
528 0.34
529 0.35
530 0.37
531 0.36
532 0.37
533 0.39
534 0.38
535 0.39
536 0.36
537 0.28
538 0.24
539 0.2
540 0.19
541 0.16
542 0.15
543 0.12
544 0.1
545 0.08
546 0.07
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.08
552 0.09
553 0.11
554 0.17
555 0.23
556 0.28
557 0.37
558 0.38
559 0.39
560 0.42
561 0.45
562 0.48
563 0.5
564 0.49
565 0.48
566 0.51
567 0.5
568 0.46