Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HW62

Protein Details
Accession A0A1Y2HW62    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-45MPPKKENKKQAEAKVKKVVEDKTFGMKNKNKSKKVQKFVEEVKKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-34KKENKKQAEAKVKKVVEDKTFGMKNKNKSKK
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKENKKQAEAKVKKVVEDKTFGMKNKNKSKKVQKFVEEVKKQAQNAVVQKKGADPAAAAPSKKEIQAQRKAELAEIFKPVQTQKVPFGVDPKTVLCAFFKQGLCTKGAKCKFSHDLNVERKGAKIDVYADKRDQEKEGDTMDNWDQSKLETVISSKHGNPRTTTDIVCKHFLNAIEDNKYGWFWVCPNGGDQCKYRHALPPGYVLKKKDAKKDASEEETMSLEEFLESERHKFLGDNLTPVTLETFTAWKKRRIEQQEQSDADALKAKTDALKAGRRQGLSGRDLFTLDDSMQDGDDDGVDDGFDLAQYRQDNERADLEAEEEAKRQAEDARNAMGGGGEAAGEFMGDEAPRGASSSSSQELAQGMEALTVEDVDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.75
3 0.7
4 0.67
5 0.64
6 0.58
7 0.56
8 0.5
9 0.49
10 0.53
11 0.51
12 0.55
13 0.54
14 0.59
15 0.65
16 0.72
17 0.71
18 0.76
19 0.84
20 0.84
21 0.88
22 0.87
23 0.83
24 0.82
25 0.85
26 0.85
27 0.79
28 0.73
29 0.71
30 0.67
31 0.6
32 0.55
33 0.48
34 0.45
35 0.49
36 0.53
37 0.48
38 0.43
39 0.43
40 0.42
41 0.41
42 0.35
43 0.26
44 0.18
45 0.19
46 0.27
47 0.29
48 0.26
49 0.24
50 0.28
51 0.29
52 0.29
53 0.32
54 0.32
55 0.39
56 0.49
57 0.53
58 0.51
59 0.53
60 0.52
61 0.48
62 0.44
63 0.37
64 0.3
65 0.3
66 0.28
67 0.24
68 0.26
69 0.24
70 0.26
71 0.26
72 0.25
73 0.26
74 0.3
75 0.31
76 0.3
77 0.34
78 0.31
79 0.29
80 0.28
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.21
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.27
92 0.28
93 0.29
94 0.3
95 0.31
96 0.34
97 0.38
98 0.39
99 0.35
100 0.4
101 0.44
102 0.44
103 0.49
104 0.45
105 0.5
106 0.53
107 0.58
108 0.53
109 0.47
110 0.43
111 0.38
112 0.33
113 0.24
114 0.18
115 0.18
116 0.23
117 0.27
118 0.3
119 0.29
120 0.32
121 0.33
122 0.33
123 0.3
124 0.24
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.2
129 0.18
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.19
134 0.17
135 0.15
136 0.13
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.23
147 0.29
148 0.29
149 0.3
150 0.33
151 0.36
152 0.36
153 0.34
154 0.32
155 0.34
156 0.35
157 0.35
158 0.3
159 0.25
160 0.25
161 0.25
162 0.23
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.19
169 0.18
170 0.14
171 0.1
172 0.08
173 0.06
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.22
184 0.23
185 0.23
186 0.25
187 0.27
188 0.28
189 0.28
190 0.32
191 0.35
192 0.39
193 0.4
194 0.36
195 0.39
196 0.44
197 0.47
198 0.48
199 0.49
200 0.48
201 0.51
202 0.56
203 0.54
204 0.5
205 0.47
206 0.39
207 0.33
208 0.28
209 0.23
210 0.17
211 0.12
212 0.08
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.2
225 0.21
226 0.22
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.1
236 0.12
237 0.2
238 0.23
239 0.29
240 0.33
241 0.39
242 0.48
243 0.54
244 0.62
245 0.63
246 0.7
247 0.72
248 0.69
249 0.64
250 0.57
251 0.49
252 0.39
253 0.36
254 0.26
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.19
261 0.19
262 0.27
263 0.29
264 0.37
265 0.42
266 0.39
267 0.4
268 0.41
269 0.42
270 0.38
271 0.39
272 0.32
273 0.29
274 0.29
275 0.28
276 0.23
277 0.18
278 0.14
279 0.12
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.1
298 0.11
299 0.13
300 0.17
301 0.21
302 0.23
303 0.25
304 0.27
305 0.25
306 0.25
307 0.23
308 0.21
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.18
318 0.24
319 0.28
320 0.3
321 0.32
322 0.31
323 0.31
324 0.3
325 0.23
326 0.16
327 0.11
328 0.08
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.12
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.2
353 0.18
354 0.14
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.09