Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PED6

Protein Details
Accession B8PED6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-31AQRGGRRGWRDWEKNNRSREASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 7.5, pero 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007783  eIF3d  
Gene Ontology GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_39481  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05091  eIF-3_zeta  
Amino Acid Sequences RLHGGRGGGAQRGGRRGWRDWEKNNRSREASVAISPDWAMLEEIEFHRLAKLRLEVDDPEDLDDYGRLYAYEKTYDRITTKSEKPLQILDRIKYNTTTSDDPVIQELASKDTATVYTTDVILSGLMCAPRSVYPWDIVVVREGNKLFFDKRDGGPFDTVTVNENAADPPQDPQAVNPNNPNEKVAVPETPSINTATSLSLEATYINQNFAFQTVIENPPPAAVEFSKPNPFYGPEETEPLASCGYRYRVFDLGVTEDEDIKLCVRTEVDGYTPGQDNPRAGQGLVTIRALNEFDSRSPGAGGAPDWRTKLDSQRGAVVATEMKNNSCKLAKWTVQSVLAGAELLKIGFISRVNPRDNTRHVILSTTSTRPMDFAAQLNVSLANGWGIVRTVTDMCMKQPEGKYVLVKDPNKPVLRLYAVPANAFTGEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.42
4 0.49
5 0.56
6 0.61
7 0.66
8 0.75
9 0.79
10 0.81
11 0.83
12 0.8
13 0.74
14 0.67
15 0.61
16 0.54
17 0.47
18 0.43
19 0.38
20 0.31
21 0.27
22 0.25
23 0.22
24 0.17
25 0.14
26 0.11
27 0.08
28 0.08
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.21
38 0.25
39 0.24
40 0.26
41 0.29
42 0.27
43 0.28
44 0.31
45 0.26
46 0.23
47 0.22
48 0.2
49 0.17
50 0.16
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.08
56 0.13
57 0.14
58 0.2
59 0.2
60 0.22
61 0.25
62 0.29
63 0.29
64 0.27
65 0.31
66 0.32
67 0.37
68 0.45
69 0.5
70 0.5
71 0.5
72 0.55
73 0.53
74 0.54
75 0.54
76 0.47
77 0.47
78 0.46
79 0.45
80 0.39
81 0.38
82 0.32
83 0.31
84 0.32
85 0.26
86 0.28
87 0.27
88 0.26
89 0.25
90 0.22
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.06
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.19
136 0.2
137 0.22
138 0.28
139 0.29
140 0.29
141 0.3
142 0.28
143 0.25
144 0.22
145 0.2
146 0.16
147 0.14
148 0.12
149 0.1
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.2
161 0.22
162 0.24
163 0.27
164 0.31
165 0.33
166 0.34
167 0.33
168 0.25
169 0.22
170 0.23
171 0.2
172 0.16
173 0.15
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.05
199 0.07
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.11
212 0.14
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.21
219 0.23
220 0.25
221 0.21
222 0.23
223 0.23
224 0.23
225 0.21
226 0.19
227 0.15
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.21
296 0.29
297 0.33
298 0.35
299 0.34
300 0.38
301 0.38
302 0.36
303 0.34
304 0.27
305 0.21
306 0.18
307 0.2
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.2
312 0.22
313 0.2
314 0.21
315 0.23
316 0.31
317 0.34
318 0.35
319 0.39
320 0.39
321 0.39
322 0.38
323 0.32
324 0.24
325 0.19
326 0.15
327 0.11
328 0.08
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.1
337 0.18
338 0.24
339 0.28
340 0.32
341 0.37
342 0.43
343 0.48
344 0.51
345 0.46
346 0.44
347 0.41
348 0.4
349 0.36
350 0.34
351 0.33
352 0.3
353 0.3
354 0.27
355 0.27
356 0.25
357 0.26
358 0.24
359 0.21
360 0.21
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.19
366 0.15
367 0.13
368 0.1
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.16
380 0.17
381 0.19
382 0.25
383 0.26
384 0.32
385 0.34
386 0.38
387 0.37
388 0.4
389 0.42
390 0.4
391 0.48
392 0.49
393 0.5
394 0.5
395 0.56
396 0.62
397 0.6
398 0.57
399 0.51
400 0.49
401 0.51
402 0.46
403 0.42
404 0.4
405 0.38
406 0.38
407 0.35
408 0.3
409 0.25
410 0.23