FuNGI

A0A1Y2HC07

Protein Details

Accession

A0A1Y2HC07

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
499-522	MPAPKKAAGGKKKGGKQQQAQQGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
502-530	PKKAAGGKKKGGKQQQAQQGPARKKARRG

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9.5, cyto_mito 8, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MLLTNLGKRLAAIEKKDRDTAFAALSQWLPAQSTTVSDLDLLKLCKALYYSFWLSDKPLVQQELAENDDGGDQGDEPVDPYTAAAIVGLRYIHAFWQIIIAEWPSLDKHRINKYYYLFRQLHKSTFAVLEKTEWSEDVLDVFMSMMVEGPLNATESRIPDSIRYHTIEVYMDMLEQTVTTTVPPHVFTTLMMPFVFMLGESRNRKIHERIQECVIDRLTQLVDREASECSSASSDSDDEDDDAPPVLKSTHLQIYFPDIVSLMFDVASHPETPVGNRKRLYGLVKAITERYDISLVDGEAFEAMDQGADLMALMAAAGSSKQRSGRKRAHEDEDDESDEDEAVEGAGAHGKDARWEDLPDLVEEPEEEGDESSDSGMEDGKAHGADAKWEDLPSCSSDEETPEDYLVDELIAPEPGSDQEAEEDEAPEPGARNSAKSPAKAKAEAAPPAAAETSPAKSVQFCLDRNEVKPFNKAEPTSRLSLTRVVKEPFPAPELLPTMPAPKKAAGGKKKGGKQQQAQQGPARKKARRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.55
3	0.61
4	0.57
5	0.52
6	0.49
7	0.45
8	0.37
9	0.32
10	0.29
11	0.25
12	0.25
13	0.22
14	0.2
15	0.17
16	0.16
17	0.13
18	0.14
19	0.12
20	0.13
21	0.16
22	0.15
23	0.15
24	0.15
25	0.16
26	0.16
27	0.2
28	0.19
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.18
34	0.17
35	0.16
36	0.22
37	0.25
38	0.27
39	0.28
40	0.28
41	0.29
42	0.32
43	0.31
44	0.28
45	0.3
46	0.28
47	0.27
48	0.28
49	0.29
50	0.28
51	0.28
52	0.24
53	0.19
54	0.17
55	0.17
56	0.15
57	0.13
58	0.08
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.07
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.11
81	0.11
82	0.09
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.14
87	0.14
88	0.11
89	0.11
90	0.12
91	0.09
92	0.12
93	0.16
94	0.19
95	0.26
96	0.35
97	0.42
98	0.44
99	0.5
100	0.53
101	0.59
102	0.59
103	0.6
104	0.54
105	0.5
106	0.56
107	0.52
108	0.5
109	0.43
110	0.4
111	0.33
112	0.35
113	0.35
114	0.27
115	0.24
116	0.23
117	0.21
118	0.22
119	0.2
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.13
124	0.11
125	0.1
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.1
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.16
147	0.2
148	0.23
149	0.25
150	0.26
151	0.24
152	0.23
153	0.24
154	0.21
155	0.18
156	0.16
157	0.12
158	0.1
159	0.08
160	0.08
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.06
168	0.07
169	0.09
170	0.1
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.14
176	0.13
177	0.14
178	0.12
179	0.11
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.13
187	0.16
188	0.19
189	0.22
190	0.24
191	0.28
192	0.33
193	0.39
194	0.42
195	0.43
196	0.42
197	0.43
198	0.45
199	0.42
200	0.4
201	0.33
202	0.23
203	0.19
204	0.19
205	0.15
206	0.13
207	0.12
208	0.1
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.06
236	0.09
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.15
241	0.21
242	0.21
243	0.21
244	0.17
245	0.12
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.18
261	0.21
262	0.25
263	0.25
264	0.26
265	0.28
266	0.31
267	0.33
268	0.28
269	0.28
270	0.27
271	0.27
272	0.27
273	0.25
274	0.22
275	0.2
276	0.16
277	0.13
278	0.1
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.04
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.02
293	0.02
294	0.02
295	0.02
296	0.02
297	0.02
298	0.02
299	0.02
300	0.02
301	0.02
302	0.02
303	0.02
304	0.02
305	0.03
306	0.04
307	0.06
308	0.12
309	0.19
310	0.24
311	0.33
312	0.42
313	0.51
314	0.6
315	0.65
316	0.66
317	0.65
318	0.63
319	0.58
320	0.53
321	0.45
322	0.36
323	0.3
324	0.23
325	0.18
326	0.14
327	0.1
328	0.06
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.07
337	0.07
338	0.1
339	0.12
340	0.14
341	0.13
342	0.14
343	0.15
344	0.17
345	0.18
346	0.16
347	0.15
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.12
373	0.13
374	0.15
375	0.14
376	0.15
377	0.15
378	0.14
379	0.16
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.13
384	0.14
385	0.16
386	0.19
387	0.19
388	0.18
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.14
393	0.11
394	0.08
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.1
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.13
418	0.12
419	0.15
420	0.17
421	0.26
422	0.29
423	0.33
424	0.37
425	0.4
426	0.45
427	0.45
428	0.45
429	0.43
430	0.44
431	0.44
432	0.42
433	0.35
434	0.29
435	0.28
436	0.27
437	0.19
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.18
446	0.23
447	0.27
448	0.26
449	0.31
450	0.38
451	0.42
452	0.44
453	0.5
454	0.49
455	0.45
456	0.5
457	0.48
458	0.47
459	0.5
460	0.5
461	0.48
462	0.49
463	0.51
464	0.49
465	0.47
466	0.43
467	0.38
468	0.43
469	0.43
470	0.42
471	0.43
472	0.42
473	0.42
474	0.43
475	0.45
476	0.4
477	0.37
478	0.32
479	0.27
480	0.3
481	0.31
482	0.27
483	0.26
484	0.24
485	0.29
486	0.3
487	0.32
488	0.3
489	0.29
490	0.34
491	0.39
492	0.48
493	0.5
494	0.56
495	0.62
496	0.68
497	0.74
498	0.78
499	0.81
500	0.8
501	0.8
502	0.8
503	0.81
504	0.8
505	0.78
506	0.76
507	0.76
508	0.73
509	0.73
510	0.74

A0A1Y2HC07

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer