Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HJR3

Protein Details
Accession A0A1Y2HJR3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-85TTTTANNKPSKRKKSSADPNPNPNPTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-74SKRKKSS
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, mito 7, nucl 6.5, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MTFLDEASSMIPANMSSQTDNGRTTAAAPALGADPIVSDSASIGPPAHAHSESSGSSATTTTANNKPSKRKKSSADPNPNPNPTKRSKSVAKHTNTNTLPIHRGKFKSRFLQKHAFLTRRADPPVGLLVSCASAAETRALGQVRKFMDDKMVELFPEVVPVWREVQKSSEVDMRFVVDDEGKPVAVGDKALADLTPTDDGKEPLRDHAGDEVPGDGQEVSSSPSATSEVGATEGKQGRQALFQMYDSGCAGLLFMRFRNSVDPKEFVLRLFDHISNSPDKAKYQSADLSFCHRFVPIHHVCSAATEHDIVCSFGPLVKDIEALGSSVAIVFESRNAPAIERKSFIPKLAAELPSTMKVDLVNPEVVVFVTVFKGVAGMTIVSGDEYRRTKRFNVQQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.17
5 0.21
6 0.24
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.2
11 0.2
12 0.22
13 0.18
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.12
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.06
25 0.05
26 0.06
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.13
34 0.16
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.16
49 0.21
50 0.28
51 0.34
52 0.41
53 0.51
54 0.6
55 0.69
56 0.72
57 0.75
58 0.76
59 0.8
60 0.85
61 0.85
62 0.86
63 0.83
64 0.85
65 0.85
66 0.84
67 0.77
68 0.7
69 0.66
70 0.62
71 0.63
72 0.57
73 0.56
74 0.58
75 0.63
76 0.69
77 0.71
78 0.69
79 0.7
80 0.69
81 0.71
82 0.62
83 0.59
84 0.51
85 0.45
86 0.46
87 0.42
88 0.43
89 0.4
90 0.43
91 0.46
92 0.52
93 0.55
94 0.59
95 0.64
96 0.68
97 0.68
98 0.74
99 0.69
100 0.7
101 0.71
102 0.64
103 0.57
104 0.55
105 0.54
106 0.49
107 0.48
108 0.39
109 0.31
110 0.29
111 0.3
112 0.25
113 0.18
114 0.14
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.09
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.2
133 0.17
134 0.23
135 0.22
136 0.22
137 0.2
138 0.19
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.17
153 0.2
154 0.2
155 0.21
156 0.24
157 0.2
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.18
195 0.18
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.19
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.19
246 0.22
247 0.26
248 0.28
249 0.29
250 0.29
251 0.33
252 0.33
253 0.26
254 0.26
255 0.22
256 0.22
257 0.24
258 0.23
259 0.2
260 0.22
261 0.24
262 0.22
263 0.23
264 0.23
265 0.21
266 0.21
267 0.23
268 0.25
269 0.23
270 0.25
271 0.29
272 0.27
273 0.29
274 0.29
275 0.32
276 0.3
277 0.29
278 0.26
279 0.21
280 0.19
281 0.18
282 0.27
283 0.25
284 0.27
285 0.28
286 0.28
287 0.27
288 0.29
289 0.28
290 0.19
291 0.15
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.07
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.21
325 0.27
326 0.28
327 0.28
328 0.3
329 0.36
330 0.38
331 0.38
332 0.36
333 0.31
334 0.34
335 0.38
336 0.38
337 0.3
338 0.31
339 0.32
340 0.3
341 0.31
342 0.25
343 0.19
344 0.18
345 0.19
346 0.21
347 0.21
348 0.19
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.14
354 0.1
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.15
372 0.2
373 0.26
374 0.31
375 0.35
376 0.4
377 0.5