Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HHV7

Protein Details
Accession A0A1Y2HHV7    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138ILFPHVWRKKNPRKQTFHDMYLHydrophilic
159-191DEEFERREKDRERRKEEKFKKNLERLRKATRTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-189RREKDRERRKEEKFKKNLERLRKATR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
Amino Acid Sequences YYEYNLAEMTDSRGGFLTPNAATSADATPSSSSEMHGHPSDPKRARTHYPSLDPDVAVDKCSECSTSTDLDPRYQDHFHINVCWTCKDKVPEKYALLTKTEARQDYLLTDEELKDDILFPHVWRKKNPRKQTFHDMYLYLRMHVEAYAVTKWGSLEKMDEEFERREKDRERRKEEKFKKNLERLRKATRTSLWSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.12
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.16
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.16
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.2
23 0.2
24 0.21
25 0.26
26 0.3
27 0.38
28 0.4
29 0.45
30 0.47
31 0.51
32 0.57
33 0.57
34 0.61
35 0.58
36 0.6
37 0.59
38 0.58
39 0.55
40 0.47
41 0.41
42 0.36
43 0.29
44 0.23
45 0.19
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.1
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.2
56 0.2
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.24
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.22
74 0.24
75 0.29
76 0.34
77 0.36
78 0.39
79 0.38
80 0.4
81 0.4
82 0.37
83 0.32
84 0.26
85 0.23
86 0.22
87 0.24
88 0.21
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.18
108 0.23
109 0.26
110 0.31
111 0.42
112 0.51
113 0.61
114 0.72
115 0.72
116 0.76
117 0.81
118 0.85
119 0.81
120 0.74
121 0.67
122 0.57
123 0.48
124 0.47
125 0.4
126 0.29
127 0.23
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.07
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.09
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.23
149 0.27
150 0.3
151 0.3
152 0.34
153 0.41
154 0.51
155 0.58
156 0.65
157 0.69
158 0.74
159 0.82
160 0.87
161 0.89
162 0.89
163 0.88
164 0.88
165 0.9
166 0.9
167 0.89
168 0.89
169 0.88
170 0.85
171 0.86
172 0.83
173 0.77
174 0.75
175 0.72