FuNGI

A0A1Y2HX03

Protein Details

Accession

A0A1Y2HX03

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
1176-1197	ASAPQQQQQQQQQQQQRPPPGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSLFRWLQSRYPRVTSKVIEIQPTEINGVTIPVDFSLPNPNGYEFDNLYLDMNGIIHPCCRPSDGRPAPETVDDMFIAIFEYIDRLMAMVRPRKLVYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQDAAMARAVEEEVFARTLEENPFADISAPGEKFDSNCITPGTPFMANLVVALRYYVQHRLNTHPGWRNLKVLMSDASVPGEGEHKVMDYIRRQRCDPHYDPNTHHVLYGLDADLIFLGLATHEPHFFILREDVYEIDRRQRESRGCDRCGQLGHFTFRCNQRPLPANLLKEQQAKNTAMALATKDKSDWIDPYLFFKVSVMREYLQAELYFDGKRVGFDFDFERVLDDWVFICFFVGNDFLPHHPALEIREGAIDLLTDVYRTNLKRMGGYLTEHGILNLERVQYIFEDLARHESDIFHAREHKEREYHDSNRKKQYHRYKDFGYSKDDMDKMLKLYDKVNDLRAAGDLHEAEKIEKKLRKMEVDLANEAEQGIARSESTSKYADDKYMEQQAEEQDEASAADAPVSIAGSGMHVTDIKDKSDNSTLVQFRNATFDVQALAQPLGRKSQSKTEAATAAKRTASEAHIDEEPNELEPPAKKLEGEPTADDDQVDDPMAYVDEPEVEPEDEVEDSDVPDSDVSVVALTKAELLAQNRKFKSGNADLGAPGYIERYYADKFGDSSIDMRRKVGHEYVIGLCWVLHYYIKGCPSWKWYYPYHYAPFASDIMDIDQLGDTVTFELGTPFKPIEQLMGVFPAASKAHIPSVFHDLMTQEDSEIIDFYPTEFVIDLNGKTMLWQGVALLPFIDEKRLLAAMAPLYPLLTEEDRFLNTLGQEVMMVSHANPLFPTMCMAYSKSAKSGTTTVTGADVDGTWIDLPMQQAHIAGQVIADPRACFPGATLLPPFPNHTSTMLPIKNNKAISVVYRHPNYKHSEFVPGLLKGVKTPRSNLSWGEIEGSFRKTRGRNPHVMAEKFTHVRLVPPPGVNGGRGGGYGHGGERDGGYQQHGGGSRNSYEDRGRNSNEDRGRQYDSRGRGGYGGYNDRGHRDQYGGGQQQQTHDRGRYGGGGYQGGYHGDHRQQQQRNSWNGGYSHGNSRGNQPRSNAPSAPAPAPAAAPQFAAPSIPAGGGQQHAQMLALQLQLQQQLLAQRQAQQAQPRGTPIGVPMRPPGPPPTSSASAPQQQQQQQQQQQQRPPPGNLAWSRNLQRGGGPPSGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.62
4	0.65
5	0.6
6	0.58
7	0.59
8	0.56
9	0.54
10	0.5
11	0.48
12	0.44
13	0.42
14	0.35
15	0.26
16	0.23
17	0.17
18	0.16
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.09
25	0.11
26	0.19
27	0.19
28	0.21
29	0.22
30	0.23
31	0.23
32	0.25
33	0.29
34	0.21
35	0.23
36	0.22
37	0.21
38	0.21
39	0.19
40	0.17
41	0.13
42	0.12
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.14
49	0.15
50	0.19
51	0.22
52	0.26
53	0.37
54	0.43
55	0.49
56	0.5
57	0.52
58	0.51
59	0.49
60	0.46
61	0.36
62	0.3
63	0.23
64	0.2
65	0.16
66	0.13
67	0.12
68	0.1
69	0.08
70	0.05
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.07
75	0.06
76	0.07
77	0.1
78	0.18
79	0.24
80	0.27
81	0.31
82	0.32
83	0.34
84	0.35
85	0.35
86	0.32
87	0.32
88	0.31
89	0.27
90	0.27
91	0.25
92	0.26
93	0.24
94	0.19
95	0.12
96	0.15
97	0.21
98	0.29
99	0.39
100	0.47
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.81
106	0.78
107	0.75
108	0.75
109	0.71
110	0.64
111	0.62
112	0.55
113	0.48
114	0.44
115	0.37
116	0.26
117	0.21
118	0.17
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.1
127	0.13
128	0.15
129	0.17
130	0.16
131	0.18
132	0.18
133	0.17
134	0.17
135	0.14
136	0.14
137	0.18
138	0.18
139	0.16
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.22
144	0.25
145	0.19
146	0.2
147	0.22
148	0.22
149	0.22
150	0.23
151	0.22
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.14
157	0.14
158	0.13
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.11
165	0.19
166	0.22
167	0.26
168	0.3
169	0.36
170	0.44
171	0.46
172	0.52
173	0.53
174	0.57
175	0.6
176	0.59
177	0.55
178	0.49
179	0.48
180	0.4
181	0.35
182	0.29
183	0.23
184	0.22
185	0.19
186	0.18
187	0.15
188	0.14
189	0.12
190	0.12
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.08
195	0.09
196	0.11
197	0.16
198	0.22
199	0.32
200	0.4
201	0.43
202	0.44
203	0.51
204	0.57
205	0.62
206	0.58
207	0.58
208	0.59
209	0.61
210	0.63
211	0.61
212	0.59
213	0.5
214	0.45
215	0.35
216	0.28
217	0.23
218	0.21
219	0.15
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.06
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.11
236	0.11
237	0.12
238	0.14
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.15
243	0.16
244	0.21
245	0.2
246	0.26
247	0.28
248	0.31
249	0.33
250	0.4
251	0.44
252	0.47
253	0.56
254	0.56
255	0.57
256	0.58
257	0.58
258	0.54
259	0.51
260	0.45
261	0.42
262	0.38
263	0.41
264	0.36
265	0.35
266	0.37
267	0.42
268	0.46
269	0.44
270	0.41
271	0.42
272	0.48
273	0.51
274	0.54
275	0.52
276	0.48
277	0.47
278	0.49
279	0.47
280	0.47
281	0.44
282	0.39
283	0.39
284	0.37
285	0.34
286	0.32
287	0.28
288	0.2
289	0.2
290	0.19
291	0.19
292	0.18
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.19
297	0.2
298	0.19
299	0.17
300	0.2
301	0.2
302	0.25
303	0.26
304	0.24
305	0.22
306	0.21
307	0.22
308	0.2
309	0.21
310	0.19
311	0.17
312	0.19
313	0.2
314	0.21
315	0.18
316	0.16
317	0.15
318	0.13
319	0.14
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.15
327	0.13
328	0.14
329	0.16
330	0.16
331	0.17
332	0.17
333	0.17
334	0.14
335	0.15
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.09
340	0.1
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.09
350	0.09
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.12
356	0.13
357	0.16
358	0.15
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.12
363	0.11
364	0.08
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.11
372	0.11
373	0.14
374	0.17
375	0.17
376	0.18
377	0.2
378	0.22
379	0.19
380	0.21
381	0.2
382	0.18
383	0.18
384	0.17
385	0.16
386	0.13
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.1
396	0.09
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.14
401	0.14
402	0.14
403	0.12
404	0.12
405	0.14
406	0.2
407	0.2
408	0.17
409	0.22
410	0.24
411	0.3
412	0.34
413	0.36
414	0.33
415	0.35
416	0.42
417	0.44
418	0.5
419	0.53
420	0.59
421	0.62
422	0.69
423	0.74
424	0.7
425	0.73
426	0.76
427	0.77
428	0.75
429	0.73
430	0.67
431	0.7
432	0.72
433	0.65
434	0.6
435	0.5
436	0.44
437	0.43
438	0.38
439	0.29
440	0.24
441	0.23
442	0.18
443	0.18
444	0.18
445	0.15
446	0.17
447	0.19
448	0.22
449	0.22
450	0.24
451	0.22
452	0.21
453	0.21
454	0.19
455	0.17
456	0.12
457	0.12
458	0.1
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.14
464	0.15
465	0.21
466	0.23
467	0.25
468	0.32
469	0.36
470	0.38
471	0.37
472	0.43
473	0.44
474	0.44
475	0.43
476	0.37
477	0.33
478	0.3
479	0.26
480	0.18
481	0.1
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.07
488	0.08
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.15
493	0.16
494	0.17
495	0.18
496	0.19
497	0.2
498	0.25
499	0.25
500	0.21
501	0.22
502	0.21
503	0.21
504	0.19
505	0.16
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.07
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.05
526	0.11
527	0.12
528	0.13
529	0.14
530	0.14
531	0.17
532	0.21
533	0.21
534	0.16
535	0.22
536	0.23
537	0.22
538	0.24
539	0.22
540	0.18
541	0.21
542	0.2
543	0.14
544	0.13
545	0.12
546	0.11
547	0.1
548	0.1
549	0.08
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.11
555	0.12
556	0.14
557	0.14
558	0.23
559	0.26
560	0.27
561	0.28
562	0.27
563	0.31
564	0.3
565	0.32
566	0.25
567	0.23
568	0.21
569	0.2
570	0.18
571	0.16
572	0.15
573	0.14
574	0.14
575	0.13
576	0.14
577	0.15
578	0.14
579	0.13
580	0.12
581	0.1
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.17
592	0.18
593	0.2
594	0.18
595	0.21
596	0.22
597	0.22
598	0.21
599	0.15
600	0.13
601	0.11
602	0.11
603	0.06
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.03
638	0.04
639	0.06
640	0.08
641	0.17
642	0.21
643	0.29
644	0.29
645	0.32
646	0.31
647	0.3
648	0.36
649	0.33
650	0.33
651	0.26
652	0.27
653	0.25
654	0.25
655	0.24
656	0.16
657	0.1
658	0.07
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.07
663	0.08
664	0.09
665	0.1
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.08
671	0.1
672	0.15
673	0.2
674	0.2
675	0.2
676	0.22
677	0.22
678	0.25
679	0.25
680	0.21
681	0.17
682	0.19
683	0.2
684	0.18
685	0.16
686	0.13
687	0.11
688	0.08
689	0.08
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.07
694	0.1
695	0.12
696	0.12
697	0.13
698	0.14
699	0.21
700	0.25
701	0.28
702	0.3
703	0.31
704	0.36
705	0.4
706	0.45
707	0.41
708	0.39
709	0.35
710	0.31
711	0.31
712	0.25
713	0.2
714	0.14
715	0.12
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.07
720	0.06
721	0.06
722	0.05
723	0.05
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.08
733	0.07
734	0.08
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.09
739	0.1
740	0.09
741	0.1
742	0.1
743	0.08
744	0.08
745	0.09
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.12
751	0.13
752	0.14
753	0.14
754	0.21
755	0.21
756	0.2
757	0.2
758	0.16
759	0.17
760	0.17
761	0.15
762	0.08
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.06
768	0.05
769	0.05
770	0.05
771	0.06
772	0.06
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.07
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.09
781	0.09
782	0.09
783	0.11
784	0.09
785	0.07
786	0.07
787	0.06
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.07
792	0.07
793	0.08
794	0.09
795	0.09
796	0.07
797	0.06
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.07
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.09
806	0.08
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.08
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.11
815	0.12
816	0.13
817	0.13
818	0.12
819	0.1
820	0.11
821	0.1
822	0.08
823	0.08
824	0.07
825	0.07
826	0.06
827	0.06
828	0.05
829	0.1
830	0.1
831	0.1
832	0.1
833	0.11
834	0.12
835	0.11
836	0.13
837	0.08
838	0.09
839	0.11
840	0.12
841	0.14
842	0.18
843	0.18
844	0.19
845	0.2
846	0.2
847	0.21
848	0.22
849	0.21
850	0.2
851	0.19
852	0.17
853	0.16
854	0.16
855	0.13
856	0.11
857	0.09
858	0.06
859	0.06
860	0.06
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.06
865	0.07
866	0.08
867	0.09
868	0.09
869	0.09
870	0.09
871	0.11
872	0.09
873	0.08
874	0.07
875	0.08
876	0.09
877	0.1
878	0.1
879	0.09
880	0.1
881	0.12
882	0.12
883	0.1
884	0.09
885	0.17
886	0.16
887	0.18
888	0.19
889	0.18
890	0.2
891	0.21
892	0.24
893	0.19
894	0.2
895	0.2
896	0.21
897	0.21
898	0.22
899	0.3
900	0.29
901	0.3
902	0.34
903	0.37
904	0.4
905	0.39
906	0.36
907	0.3
908	0.28
909	0.28
910	0.29
911	0.3
912	0.32
913	0.35
914	0.39
915	0.38
916	0.43
917	0.47
918	0.44
919	0.43
920	0.37
921	0.41
922	0.37
923	0.39
924	0.38
925	0.31
926	0.29
927	0.26
928	0.25
929	0.2
930	0.27
931	0.3
932	0.27
933	0.31
934	0.35
935	0.37
936	0.4
937	0.38
938	0.36
939	0.31
940	0.3
941	0.29
942	0.24
943	0.22
944	0.22
945	0.25
946	0.21
947	0.2
948	0.26
949	0.27
950	0.35
951	0.43
952	0.49
953	0.54
954	0.57
955	0.66
956	0.68
957	0.66
958	0.61
959	0.53
960	0.51
961	0.43
962	0.39
963	0.33
964	0.25
965	0.27
966	0.28
967	0.31
968	0.3
969	0.29
970	0.3
971	0.31
972	0.32
973	0.29
974	0.26
975	0.19
976	0.15
977	0.14
978	0.13
979	0.09
980	0.09
981	0.09
982	0.09
983	0.09
984	0.09
985	0.09
986	0.09
987	0.1
988	0.1
989	0.1
990	0.12
991	0.12
992	0.12
993	0.15
994	0.17
995	0.17
996	0.18
997	0.21
998	0.2
999	0.23
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.28
1003	0.31
1004	0.36
1005	0.4
1006	0.41
1007	0.44
1008	0.47
1009	0.53
1010	0.54
1011	0.56
1012	0.54
1013	0.51
1014	0.55
1015	0.5
1016	0.52
1017	0.51
1018	0.49
1019	0.5
1020	0.46
1021	0.43
1022	0.37
1023	0.37
1024	0.35
1025	0.33
1026	0.34
1027	0.29
1028	0.32
1029	0.32
1030	0.36
1031	0.37
1032	0.34
1033	0.29
1034	0.26
1035	0.25
1036	0.27
1037	0.35
1038	0.35
1039	0.38
1040	0.4
1041	0.39
1042	0.43
1043	0.46
1044	0.44
1045	0.4
1046	0.38
1047	0.34
1048	0.32
1049	0.32
1050	0.3
1051	0.26
1052	0.25
1053	0.23
1054	0.21
1055	0.2
1056	0.2
1057	0.19
1058	0.17
1059	0.16
1060	0.15
1061	0.18
1062	0.22
1063	0.28
1064	0.34
1065	0.43
1066	0.49
1067	0.55
1068	0.63
1069	0.67
1070	0.68
1071	0.68
1072	0.63
1073	0.57
1074	0.51
1075	0.47
1076	0.44
1077	0.38
1078	0.39
1079	0.4
1080	0.41
1081	0.38
1082	0.47
1083	0.53
1084	0.53
1085	0.53
1086	0.49
1087	0.52
1088	0.56
1089	0.61
1090	0.52
1091	0.45
1092	0.46
1093	0.47
1094	0.44
1095	0.37
1096	0.31
1097	0.26
1098	0.25
1099	0.26
1100	0.21
1101	0.18
1102	0.17
1103	0.16
1104	0.16
1105	0.15
1106	0.14
1107	0.12
1108	0.11
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.11
1114	0.12
1115	0.13
1116	0.13
1117	0.13
1118	0.13
1119	0.13
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.13
1123	0.13
1124	0.12
1125	0.14
1126	0.16
1127	0.17
1128	0.17
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.2
1132	0.23
1133	0.25
1134	0.24
1135	0.3
1136	0.35
1137	0.39
1138	0.42
1139	0.44
1140	0.49
1141	0.49
1142	0.5
1143	0.47
1144	0.44
1145	0.41
1146	0.36
1147	0.33
1148	0.36
1149	0.32
1150	0.32
1151	0.33
1152	0.33
1153	0.34
1154	0.36
1155	0.38
1156	0.33
1157	0.33
1158	0.35
1159	0.38
1160	0.39
1161	0.39
1162	0.43
1163	0.42
1164	0.45
1165	0.46
1166	0.47
1167	0.49
1168	0.51
1169	0.59
1170	0.62
1171	0.66
1172	0.68
1173	0.75
1174	0.79
1175	0.79
1176	0.82
1177	0.82
1178	0.82
1179	0.77
1180	0.72
1181	0.7
1182	0.63
1183	0.63
1184	0.61
1185	0.58
1186	0.53
1187	0.56
1188	0.57
1189	0.56
1190	0.55
1191	0.46
1192	0.44
1193	0.45
1194	0.46

A0A1Y2HX03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer