Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HCT4

Protein Details
Accession A0A1Y2HCT4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-120GSDSDGGDRIRRRRKQRKRFGEDDDDDESSDDNHTRRHDRNRSRRPGQGHSBasic
213-251SPTSTRKEDKHSPKPAKPTSRRRRNKYKKQQAQQEQEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-88RIRRRRKQRKR
110-116NRSRRPG
219-241KEDKHSPKPAKPTSRRRRNKYKK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSSSDSSPHRSARRPGPGHRTAFGQPLTDARGQAVDYGLDDMDIDQDDDHDHDHDSQRHRYANSSDDQDGSDSDGGDRIRRRRKQRKRFGEDDDDDESSDDNHTRRHDRNRSRRPGQGHSGAGLSRPRPPQPPTRSTPPGAGLGSQQHQPAAVPKSFGQFAGTGGLGLKLLMKMGYTPGQGLGAQGQGIVEPVQAVMRPKGMGISIEEDYNESPTSTRKEDKHSPKPAKPTSRRRRNKYKKQQAQQEQEEDVMDVDLGSTPSHTPIEIVDLRGDSGSAAATSPYLSSPAVLHFFDSLAATATLTQSKLAARQAQRVADQAKLETVKKQLAESKTKHEEDTQRLSKIHTLADRIRSAAAGPSQSVNEEEWLDVVTDAAEFSSIFAPAVASLAVSKLRSQFTPDWDPIADPTFCSSQLERIRSGTSASLTPNGGTFYDSVMWALWIPRHASQSVVDALTLWTSLVSPALHAHVVHQICVPRLRRALDTYSPSTSALDAPPPTHCWVFYTFLPGSPTSSAQPSTRPRAPPAHPTNRLAALLPHASSLATAPVTCRLVNTGVTVPRPALSTHVSECVRIDPAAQDPQPVAHCSHTCLRHVDGVVRVTHAWACAVRDQSASARELAAWWQVWRGYVPSDVWAEPSVKVYLGAGLMVLRALARGEAEVPDPELMVPKSDVERKVQASGAGKGMGGWRPTVKDLVTRELEKVGLGIEAAGKTLARIGRPVYRVVGESGKKKATRAYVYWDQDVVFVRRGLVEGGSGVVDENEDVVALWDPVAIKEVVEMCQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.77
4 0.79
5 0.76
6 0.69
7 0.64
8 0.56
9 0.56
10 0.48
11 0.4
12 0.32
13 0.3
14 0.34
15 0.31
16 0.28
17 0.22
18 0.22
19 0.2
20 0.21
21 0.18
22 0.13
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.12
39 0.16
40 0.23
41 0.3
42 0.35
43 0.41
44 0.46
45 0.5
46 0.5
47 0.51
48 0.48
49 0.47
50 0.47
51 0.45
52 0.41
53 0.37
54 0.36
55 0.32
56 0.28
57 0.25
58 0.21
59 0.15
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.21
64 0.27
65 0.33
66 0.43
67 0.51
68 0.62
69 0.7
70 0.81
71 0.86
72 0.91
73 0.93
74 0.92
75 0.91
76 0.89
77 0.89
78 0.81
79 0.75
80 0.69
81 0.58
82 0.49
83 0.41
84 0.32
85 0.21
86 0.2
87 0.17
88 0.13
89 0.17
90 0.22
91 0.29
92 0.37
93 0.47
94 0.56
95 0.64
96 0.75
97 0.82
98 0.87
99 0.86
100 0.85
101 0.82
102 0.79
103 0.77
104 0.73
105 0.64
106 0.54
107 0.5
108 0.43
109 0.39
110 0.35
111 0.28
112 0.28
113 0.3
114 0.33
115 0.37
116 0.42
117 0.5
118 0.54
119 0.61
120 0.61
121 0.66
122 0.68
123 0.63
124 0.63
125 0.55
126 0.5
127 0.42
128 0.36
129 0.29
130 0.28
131 0.28
132 0.26
133 0.23
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.22
138 0.22
139 0.21
140 0.21
141 0.22
142 0.26
143 0.26
144 0.26
145 0.21
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.14
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.16
203 0.2
204 0.26
205 0.27
206 0.35
207 0.45
208 0.55
209 0.62
210 0.69
211 0.73
212 0.73
213 0.8
214 0.81
215 0.82
216 0.82
217 0.83
218 0.83
219 0.86
220 0.9
221 0.89
222 0.92
223 0.92
224 0.93
225 0.94
226 0.94
227 0.93
228 0.92
229 0.93
230 0.92
231 0.9
232 0.85
233 0.78
234 0.68
235 0.58
236 0.49
237 0.38
238 0.28
239 0.18
240 0.11
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.13
296 0.19
297 0.2
298 0.26
299 0.3
300 0.31
301 0.31
302 0.32
303 0.31
304 0.26
305 0.25
306 0.19
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.23
316 0.27
317 0.34
318 0.34
319 0.4
320 0.44
321 0.44
322 0.44
323 0.43
324 0.45
325 0.43
326 0.49
327 0.45
328 0.4
329 0.4
330 0.4
331 0.37
332 0.32
333 0.29
334 0.21
335 0.22
336 0.23
337 0.28
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.2
342 0.18
343 0.16
344 0.14
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.16
385 0.18
386 0.23
387 0.28
388 0.27
389 0.26
390 0.25
391 0.25
392 0.2
393 0.21
394 0.15
395 0.1
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.12
400 0.11
401 0.16
402 0.21
403 0.23
404 0.22
405 0.23
406 0.24
407 0.22
408 0.23
409 0.17
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.09
432 0.11
433 0.13
434 0.13
435 0.14
436 0.14
437 0.16
438 0.16
439 0.14
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.04
451 0.05
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.15
462 0.17
463 0.22
464 0.23
465 0.21
466 0.24
467 0.26
468 0.26
469 0.29
470 0.33
471 0.32
472 0.35
473 0.34
474 0.33
475 0.31
476 0.29
477 0.26
478 0.21
479 0.18
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.14
485 0.16
486 0.18
487 0.17
488 0.16
489 0.15
490 0.17
491 0.2
492 0.18
493 0.22
494 0.2
495 0.21
496 0.23
497 0.21
498 0.2
499 0.18
500 0.19
501 0.14
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.22
506 0.26
507 0.32
508 0.36
509 0.38
510 0.4
511 0.46
512 0.49
513 0.52
514 0.57
515 0.59
516 0.58
517 0.58
518 0.57
519 0.51
520 0.48
521 0.38
522 0.29
523 0.22
524 0.2
525 0.17
526 0.14
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.14
541 0.15
542 0.16
543 0.17
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.18
548 0.17
549 0.17
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.16
554 0.17
555 0.24
556 0.23
557 0.23
558 0.23
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.17
563 0.12
564 0.15
565 0.21
566 0.2
567 0.2
568 0.18
569 0.21
570 0.22
571 0.22
572 0.2
573 0.18
574 0.19
575 0.21
576 0.28
577 0.28
578 0.29
579 0.3
580 0.31
581 0.3
582 0.31
583 0.31
584 0.28
585 0.28
586 0.26
587 0.24
588 0.22
589 0.19
590 0.19
591 0.16
592 0.13
593 0.11
594 0.13
595 0.15
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.19
600 0.21
601 0.23
602 0.22
603 0.18
604 0.17
605 0.15
606 0.15
607 0.16
608 0.16
609 0.13
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.13
617 0.15
618 0.15
619 0.16
620 0.18
621 0.18
622 0.19
623 0.19
624 0.18
625 0.17
626 0.19
627 0.16
628 0.13
629 0.13
630 0.12
631 0.11
632 0.1
633 0.09
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.05
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.05
645 0.07
646 0.08
647 0.1
648 0.1
649 0.11
650 0.11
651 0.11
652 0.11
653 0.14
654 0.13
655 0.13
656 0.14
657 0.14
658 0.19
659 0.25
660 0.27
661 0.28
662 0.34
663 0.35
664 0.37
665 0.36
666 0.36
667 0.34
668 0.35
669 0.32
670 0.26
671 0.23
672 0.21
673 0.23
674 0.22
675 0.19
676 0.19
677 0.19
678 0.22
679 0.24
680 0.26
681 0.23
682 0.26
683 0.29
684 0.34
685 0.36
686 0.35
687 0.35
688 0.34
689 0.33
690 0.26
691 0.23
692 0.16
693 0.11
694 0.09
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.12
703 0.14
704 0.12
705 0.15
706 0.19
707 0.26
708 0.28
709 0.31
710 0.3
711 0.3
712 0.31
713 0.31
714 0.36
715 0.34
716 0.37
717 0.41
718 0.45
719 0.45
720 0.45
721 0.48
722 0.48
723 0.5
724 0.49
725 0.51
726 0.54
727 0.57
728 0.58
729 0.53
730 0.44
731 0.39
732 0.4
733 0.35
734 0.28
735 0.24
736 0.22
737 0.21
738 0.22
739 0.2
740 0.15
741 0.13
742 0.1
743 0.1
744 0.09
745 0.09
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.06
750 0.06
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.09
761 0.12
762 0.1
763 0.09
764 0.13
765 0.15