FuNGI

A0A1Y2HBT0

Protein Details

Accession

A0A1Y2HBT0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-41	GKEGEQQKKYPLKKEKQVADPSKI	Hydrophilic
113-134	GASEKAARKLKRRTLRKMLLAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
117-129	KAARKLKRRTLRK
199-211	KGKVQIPRPRKER

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MGMAAAALGTPADDHTKGKEGEQQKKYPLKKEKQVADPSKIAPYGGARVPTAAVADDDADPAATPATTAASAAAPKSSAFQKRTREIRMVDDAVRLARREEITPWVLHGADPGASEKAARKLKRRTLRKMLLAAGKTNEAERLESSEEEEEEEEEAEAATAQDKNGHEHKIRWTWMRNPGRCCGSCRSKWTKVEAQVRKGKVQIPRPRKERARVFGCEGGPTERVLFVYPRYRTRPRHYQRLDGTLQSDARVQLVQVCRTQLARAHHHGRPSGGAHQAQAVSASGQGAPTSAAAKLLHRLNQSDSASGDADGGASGTGRVSIKRAGGGSGSGGAGGKDWGDVDELDFDLTEQFADDEEDVVGDLEDENEGFKSQIKQMFALGLGGEAMDEDFDEDFLVEDTAGAAAGGANAARSGGSGAGTKELSSGGKQMIKLLRSQGYESEDDDDEWFGSDEEGEDGEGPEEGAGQDAAEAPAAGGSRPSDAVMRALAAAATAKAKAAATANGSGQTKRSASAANLDPAPKNGSGGQNPNPPPPPFSRDEIRATLRSRGPLTAGQLIQALPRGQEQIAVYGKEAFVEVLKASMVQKDANKKLHLRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.17
3	0.24
4	0.25
5	0.27
6	0.34
7	0.4
8	0.49
9	0.56
10	0.59
11	0.62
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.78
16	0.77
17	0.79
18	0.82
19	0.81
20	0.82
21	0.86
22	0.84
23	0.8
24	0.75
25	0.67
26	0.63
27	0.54
28	0.44
29	0.35
30	0.3
31	0.29
32	0.27
33	0.27
34	0.21
35	0.22
36	0.22
37	0.21
38	0.18
39	0.13
40	0.11
41	0.09
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.08
49	0.07
50	0.05
51	0.05
52	0.05
53	0.07
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.09
62	0.1
63	0.13
64	0.2
65	0.26
66	0.3
67	0.37
68	0.45
69	0.54
70	0.62
71	0.64
72	0.64
73	0.59
74	0.61
75	0.61
76	0.56
77	0.49
78	0.43
79	0.38
80	0.35
81	0.34
82	0.27
83	0.21
84	0.22
85	0.22
86	0.21
87	0.22
88	0.25
89	0.26
90	0.26
91	0.26
92	0.23
93	0.22
94	0.2
95	0.19
96	0.13
97	0.11
98	0.11
99	0.12
100	0.11
101	0.1
102	0.12
103	0.14
104	0.22
105	0.29
106	0.33
107	0.4
108	0.5
109	0.6
110	0.69
111	0.76
112	0.78
113	0.81
114	0.85
115	0.83
116	0.78
117	0.75
118	0.72
119	0.64
120	0.56
121	0.47
122	0.4
123	0.33
124	0.28
125	0.25
126	0.18
127	0.18
128	0.15
129	0.17
130	0.18
131	0.17
132	0.19
133	0.17
134	0.17
135	0.16
136	0.16
137	0.13
138	0.11
139	0.11
140	0.09
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.11
150	0.11
151	0.16
152	0.2
153	0.25
154	0.26
155	0.29
156	0.37
157	0.39
158	0.43
159	0.45
160	0.46
161	0.48
162	0.57
163	0.63
164	0.62
165	0.59
166	0.6
167	0.62
168	0.58
169	0.55
170	0.53
171	0.52
172	0.51
173	0.56
174	0.59
175	0.6
176	0.62
177	0.65
178	0.64
179	0.64
180	0.7
181	0.67
182	0.67
183	0.67
184	0.65
185	0.6
186	0.56
187	0.52
188	0.48
189	0.51
190	0.52
191	0.55
192	0.61
193	0.64
194	0.7
195	0.72
196	0.75
197	0.74
198	0.73
199	0.7
200	0.64
201	0.65
202	0.61
203	0.54
204	0.46
205	0.38
206	0.31
207	0.25
208	0.21
209	0.17
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.19
216	0.21
217	0.26
218	0.33
219	0.41
220	0.47
221	0.54
222	0.62
223	0.61
224	0.7
225	0.68
226	0.7
227	0.66
228	0.66
229	0.59
230	0.5
231	0.44
232	0.36
233	0.32
234	0.24
235	0.21
236	0.14
237	0.13
238	0.11
239	0.1
240	0.12
241	0.14
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.17
247	0.18
248	0.18
249	0.2
250	0.23
251	0.29
252	0.34
253	0.35
254	0.38
255	0.38
256	0.34
257	0.31
258	0.27
259	0.24
260	0.23
261	0.21
262	0.18
263	0.19
264	0.18
265	0.16
266	0.14
267	0.1
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.11
283	0.12
284	0.16
285	0.16
286	0.18
287	0.18
288	0.24
289	0.24
290	0.21
291	0.19
292	0.17
293	0.16
294	0.15
295	0.13
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.02
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.06
308	0.08
309	0.09
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.06
359	0.08
360	0.13
361	0.17
362	0.17
363	0.18
364	0.18
365	0.19
366	0.17
367	0.15
368	0.11
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.04
373	0.03
374	0.03
375	0.02
376	0.02
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.02
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.09
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.15
416	0.16
417	0.21
418	0.24
419	0.24
420	0.26
421	0.29
422	0.3
423	0.29
424	0.3
425	0.28
426	0.28
427	0.28
428	0.27
429	0.25
430	0.21
431	0.2
432	0.2
433	0.17
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.04
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.08
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.09
486	0.11
487	0.12
488	0.15
489	0.17
490	0.18
491	0.21
492	0.23
493	0.22
494	0.22
495	0.23
496	0.21
497	0.19
498	0.2
499	0.19
500	0.18
501	0.26
502	0.28
503	0.28
504	0.3
505	0.32
506	0.31
507	0.3
508	0.32
509	0.25
510	0.22
511	0.23
512	0.27
513	0.3
514	0.36
515	0.41
516	0.46
517	0.49
518	0.54
519	0.56
520	0.51
521	0.5
522	0.49
523	0.49
524	0.43
525	0.46
526	0.46
527	0.46
528	0.51
529	0.52
530	0.52
531	0.52
532	0.51
533	0.53
534	0.5
535	0.5
536	0.46
537	0.41
538	0.39
539	0.36
540	0.38
541	0.38
542	0.34
543	0.29
544	0.29
545	0.27
546	0.25
547	0.25
548	0.21
549	0.15
550	0.17
551	0.19
552	0.17
553	0.21
554	0.2
555	0.23
556	0.27
557	0.26
558	0.25
559	0.25
560	0.25
561	0.21
562	0.21
563	0.14
564	0.11
565	0.12
566	0.11
567	0.09
568	0.09
569	0.11
570	0.11
571	0.14
572	0.15
573	0.18
574	0.25
575	0.34
576	0.42
577	0.48
578	0.53

A0A1Y2HBT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer