Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HYQ6

Protein Details
Accession A0A1Y2HYQ6    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35CPASGNKSARPRLPPRCRFFAQHydrophilic
81-111KAPPSSAARNSRNNRNPKNRTKKPTPASATTHydrophilic
142-174TDADAAPRTKRKPRQRTRKPKPKPEHASEPEPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-103NRNPKNRTKK
148-165PRTKRKPRQRTRKPKPKP
724-761SRGESKKFKGLAKTVSKKGERVGKEGAEKVKKDKEKSK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006575  RWD-domain  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR008913  Znf_CHY  
IPR037274  Znf_CHY_sf  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05773  RWD  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50908  RWD  
PS50103  ZF_C3H1  
PS51266  ZF_CHY  
Amino Acid Sequences AAAAAAEAAPATSCPASGNKSARPRLPPRCRFFAQGHCREGDKCRFRHELKPQAQPASKQDKAPTAAATAAANATAGDSPKAPPSSAARNSRNNRNPKNRTKKPTPASATTTRPDSAATNTNSTTQPLPPAEAATADADADTDADAAPRTKRKPRQRTRKPKPKPEHASEPEPAQEAELEPPTPRQSHLAALRSTYPSTTLVTPTSITLSFAPSDPDFPYPLDQVHLSLTLPLDYPTSPPSVLLTNADIPQDVRDIVAKSIAHRLASNQSRLSLVQVVQWIDKNLEKLIKGDLDAPKSTLVFVRPGTGAAAARAPMAKPGSDQRNRDAELKALERRFRASWIQVSQEEMQLTLEPTDPEWSFPGLNVHLGLTLPLAYGSDASVQAQWRVLNTDTSPRLAGKMEQVLREAGEAGIALLQSVNKLDRALVGIVAGLAEEDEQAEDEQIRDVSSDSSLTSDDEDEHEEQQQITSNAQLAVPKSGATQIKFPALALSGISVLECTSLSILLTCVRCKHASEFHAISPLAPGTSLEWQLDSPHAPGMQPCSKCAAPMGIRWTAALMHAAHPVLGYASLLNATPMDLLPSTYSATCAACTSAGQVKVTCRACHAALSVGYEVVRFLRVGSGGLRVKASDEGIVPGQPLPKMGRCTHYSKSAFPCDVCHEKAKSDGHEMVRANRQICGYCSKEQPFSAAGGCAFCHASLVAKSSSGFWEGGKGTRDVVKMSRGESKKFKGLAKTVSKKGERVGKEGAEKVKKDKEKSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.14
3 0.19
4 0.26
5 0.32
6 0.38
7 0.48
8 0.54
9 0.59
10 0.65
11 0.71
12 0.74
13 0.8
14 0.82
15 0.79
16 0.81
17 0.78
18 0.75
19 0.71
20 0.71
21 0.71
22 0.69
23 0.66
24 0.6
25 0.59
26 0.56
27 0.57
28 0.57
29 0.55
30 0.5
31 0.53
32 0.6
33 0.62
34 0.69
35 0.71
36 0.71
37 0.7
38 0.77
39 0.75
40 0.75
41 0.75
42 0.7
43 0.69
44 0.68
45 0.63
46 0.57
47 0.56
48 0.54
49 0.53
50 0.51
51 0.43
52 0.35
53 0.32
54 0.29
55 0.24
56 0.18
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.18
68 0.19
69 0.18
70 0.21
71 0.26
72 0.35
73 0.42
74 0.51
75 0.52
76 0.61
77 0.68
78 0.75
79 0.79
80 0.8
81 0.82
82 0.83
83 0.86
84 0.87
85 0.91
86 0.91
87 0.91
88 0.91
89 0.91
90 0.87
91 0.87
92 0.82
93 0.78
94 0.75
95 0.72
96 0.68
97 0.61
98 0.57
99 0.47
100 0.4
101 0.35
102 0.29
103 0.27
104 0.29
105 0.28
106 0.28
107 0.29
108 0.32
109 0.31
110 0.31
111 0.29
112 0.22
113 0.25
114 0.22
115 0.24
116 0.21
117 0.22
118 0.2
119 0.18
120 0.19
121 0.14
122 0.13
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.08
134 0.13
135 0.2
136 0.26
137 0.35
138 0.46
139 0.57
140 0.67
141 0.76
142 0.83
143 0.88
144 0.94
145 0.95
146 0.96
147 0.96
148 0.96
149 0.95
150 0.95
151 0.93
152 0.9
153 0.89
154 0.84
155 0.8
156 0.71
157 0.63
158 0.54
159 0.46
160 0.37
161 0.26
162 0.21
163 0.15
164 0.16
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.15
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.18
174 0.25
175 0.31
176 0.34
177 0.31
178 0.32
179 0.35
180 0.34
181 0.33
182 0.26
183 0.21
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.15
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.2
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.2
252 0.25
253 0.29
254 0.31
255 0.26
256 0.25
257 0.26
258 0.26
259 0.26
260 0.2
261 0.16
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.19
279 0.2
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.19
285 0.19
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.16
307 0.25
308 0.31
309 0.33
310 0.35
311 0.4
312 0.42
313 0.44
314 0.38
315 0.31
316 0.29
317 0.3
318 0.31
319 0.28
320 0.29
321 0.26
322 0.29
323 0.27
324 0.27
325 0.26
326 0.24
327 0.26
328 0.26
329 0.28
330 0.25
331 0.28
332 0.26
333 0.24
334 0.21
335 0.16
336 0.14
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.08
341 0.06
342 0.07
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.17
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.11
388 0.17
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.17
395 0.14
396 0.08
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.03
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.12
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.14
468 0.16
469 0.16
470 0.18
471 0.18
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.16
476 0.14
477 0.13
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.13
497 0.16
498 0.18
499 0.19
500 0.24
501 0.27
502 0.28
503 0.34
504 0.34
505 0.32
506 0.35
507 0.33
508 0.28
509 0.22
510 0.2
511 0.13
512 0.11
513 0.1
514 0.07
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.14
522 0.13
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.18
529 0.23
530 0.23
531 0.23
532 0.27
533 0.26
534 0.26
535 0.26
536 0.26
537 0.21
538 0.25
539 0.29
540 0.26
541 0.26
542 0.26
543 0.25
544 0.19
545 0.17
546 0.16
547 0.12
548 0.11
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.04
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.09
580 0.09
581 0.12
582 0.15
583 0.17
584 0.17
585 0.18
586 0.2
587 0.28
588 0.31
589 0.29
590 0.26
591 0.28
592 0.28
593 0.28
594 0.27
595 0.23
596 0.2
597 0.23
598 0.2
599 0.17
600 0.17
601 0.14
602 0.14
603 0.1
604 0.1
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.18
612 0.19
613 0.2
614 0.2
615 0.18
616 0.2
617 0.2
618 0.2
619 0.14
620 0.13
621 0.14
622 0.15
623 0.15
624 0.14
625 0.14
626 0.16
627 0.14
628 0.16
629 0.18
630 0.22
631 0.27
632 0.3
633 0.34
634 0.36
635 0.43
636 0.45
637 0.51
638 0.48
639 0.49
640 0.54
641 0.56
642 0.54
643 0.48
644 0.47
645 0.45
646 0.48
647 0.45
648 0.44
649 0.38
650 0.37
651 0.43
652 0.44
653 0.41
654 0.41
655 0.44
656 0.4
657 0.45
658 0.45
659 0.44
660 0.48
661 0.49
662 0.43
663 0.39
664 0.38
665 0.34
666 0.35
667 0.37
668 0.33
669 0.34
670 0.41
671 0.43
672 0.45
673 0.43
674 0.44
675 0.37
676 0.35
677 0.31
678 0.24
679 0.21
680 0.17
681 0.17
682 0.15
683 0.14
684 0.12
685 0.11
686 0.1
687 0.12
688 0.13
689 0.17
690 0.16
691 0.16
692 0.16
693 0.17
694 0.19
695 0.18
696 0.17
697 0.14
698 0.19
699 0.2
700 0.24
701 0.25
702 0.24
703 0.23
704 0.28
705 0.29
706 0.27
707 0.29
708 0.31
709 0.31
710 0.33
711 0.41
712 0.4
713 0.46
714 0.52
715 0.55
716 0.56
717 0.59
718 0.62
719 0.61
720 0.64
721 0.66
722 0.68
723 0.71
724 0.7
725 0.74
726 0.72
727 0.66
728 0.67
729 0.66
730 0.59
731 0.56
732 0.55
733 0.52
734 0.54
735 0.58
736 0.6
737 0.59
738 0.58
739 0.6
740 0.63
741 0.65