FuNGI

A0A1Y2HXC0

Protein Details

Accession

A0A1Y2HXC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
562-583	AKEAPASKSKKRKRAVALLAEQ	Hydrophilic
653-680	NMVSKSRRVAGKKKTSLKEKTRAMRADI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
260-284	TKKSRANARKLAKLVTAAKKSNKPK
565-575	APASKSKKRKR
621-687	AGREGREKFGSRKGKKEGKSTSNTEKRRTKDFNMVSKSRRVAGKKKTSLKEKTRAMRADIEKRKRAH

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGRQRSRAEHTLATNLPQLQNLIKRDPASYTNEFQQQLRFLQAQLQIVAAAPHQPPQKALPELLSFIAHTVPSYSATLDAAKAIPTTLTDLLKSRHGPAPGPAPPARDKQLRETLHAFIVNDIKLANAKHVNNKLNKATQNLLYSILTPPAGYSLAASADGSTAAGQESESGWSPVAAQKSLQICIELYKKNIWTDAKTVNVIAQACFSPVAKIMATAVHFFLGADKDEEQGDADDDGEFPGGGVDTAAVQAAQHQAKITKKSRANARKLAKLVTAAKKSNKPKNQDAGNGKVHFSALSLIYDPQAFAEKLFSRVKSSHFAFDTKLLLLNLTSRLIASHKLFLLGFYTYMQKYLQPHQRDVTSLLAYTAQASHDLVPPDVLAPVLRVIADQFVSDHASREVISAGINSIREICARCPLAMDKDLLSDLVLYKDHRDKSVVMAARSLIGLFREVNPSLCQRASAARRRVAAATRVAGAELLERSVAEQGWSGSEDGSDDDSDGEWQEVASDDGQEFIRLDDWSSDDSSSDSDSDSDSDEDEDATRFLTPADFARMAELRSLAAKEAPASKSKKRKRAVALLAEQQAAGQMAEFSEFVDETSLVPLRKKPKSDYEERMASIAAGREGREKFGSRKGKKEGKSTSNTEKRRTKDFNMVSKSRRVAGKKKTSLKEKTRAMRADIEKRKRAH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.41
3	0.36
4	0.32
5	0.3
6	0.28
7	0.34
8	0.36
9	0.35
10	0.36
11	0.36
12	0.37
13	0.39
14	0.38
15	0.39
16	0.39
17	0.39
18	0.41
19	0.46
20	0.46
21	0.43
22	0.44
23	0.4
24	0.36
25	0.37
26	0.32
27	0.26
28	0.31
29	0.34
30	0.31
31	0.28
32	0.26
33	0.21
34	0.2
35	0.2
36	0.14
37	0.15
38	0.13
39	0.18
40	0.22
41	0.22
42	0.24
43	0.28
44	0.35
45	0.33
46	0.34
47	0.34
48	0.32
49	0.33
50	0.32
51	0.28
52	0.21
53	0.19
54	0.19
55	0.13
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.12
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.12
66	0.13
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.13
74	0.15
75	0.15
76	0.16
77	0.19
78	0.21
79	0.27
80	0.28
81	0.29
82	0.3
83	0.31
84	0.31
85	0.32
86	0.39
87	0.37
88	0.42
89	0.39
90	0.39
91	0.42
92	0.46
93	0.48
94	0.46
95	0.45
96	0.47
97	0.55
98	0.52
99	0.54
100	0.52
101	0.48
102	0.45
103	0.43
104	0.35
105	0.28
106	0.29
107	0.24
108	0.2
109	0.17
110	0.14
111	0.15
112	0.15
113	0.18
114	0.21
115	0.23
116	0.32
117	0.4
118	0.47
119	0.51
120	0.57
121	0.57
122	0.58
123	0.59
124	0.54
125	0.5
126	0.48
127	0.44
128	0.39
129	0.36
130	0.28
131	0.27
132	0.23
133	0.2
134	0.15
135	0.12
136	0.11
137	0.1
138	0.1
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.07
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.12
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.16
167	0.19
168	0.2
169	0.19
170	0.17
171	0.15
172	0.19
173	0.25
174	0.21
175	0.21
176	0.24
177	0.26
178	0.27
179	0.32
180	0.3
181	0.27
182	0.3
183	0.32
184	0.31
185	0.29
186	0.28
187	0.24
188	0.24
189	0.22
190	0.17
191	0.14
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.08
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.11
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.09
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.15
244	0.19
245	0.28
246	0.31
247	0.35
248	0.39
249	0.45
250	0.55
251	0.61
252	0.65
253	0.66
254	0.67
255	0.65
256	0.63
257	0.59
258	0.49
259	0.44
260	0.44
261	0.42
262	0.42
263	0.39
264	0.42
265	0.48
266	0.56
267	0.6
268	0.6
269	0.59
270	0.61
271	0.65
272	0.65
273	0.65
274	0.62
275	0.59
276	0.59
277	0.53
278	0.46
279	0.38
280	0.33
281	0.25
282	0.2
283	0.14
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.11
296	0.11
297	0.16
298	0.19
299	0.19
300	0.19
301	0.21
302	0.24
303	0.26
304	0.26
305	0.26
306	0.25
307	0.26
308	0.24
309	0.24
310	0.23
311	0.17
312	0.17
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.12
329	0.11
330	0.12
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.1
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.13
340	0.21
341	0.28
342	0.28
343	0.31
344	0.32
345	0.32
346	0.31
347	0.31
348	0.26
349	0.19
350	0.16
351	0.14
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.09
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.1
399	0.1
400	0.15
401	0.16
402	0.15
403	0.17
404	0.18
405	0.21
406	0.21
407	0.21
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.13
412	0.11
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.07
418	0.11
419	0.17
420	0.18
421	0.19
422	0.2
423	0.2
424	0.23
425	0.3
426	0.3
427	0.24
428	0.24
429	0.23
430	0.21
431	0.2
432	0.16
433	0.1
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.09
438	0.12
439	0.12
440	0.14
441	0.15
442	0.17
443	0.19
444	0.18
445	0.17
446	0.14
447	0.22
448	0.28
449	0.36
450	0.4
451	0.42
452	0.43
453	0.45
454	0.46
455	0.42
456	0.39
457	0.33
458	0.27
459	0.24
460	0.23
461	0.21
462	0.18
463	0.14
464	0.12
465	0.09
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.07
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.06
498	0.08
499	0.08
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.09
507	0.11
508	0.12
509	0.13
510	0.13
511	0.11
512	0.12
513	0.12
514	0.12
515	0.11
516	0.09
517	0.08
518	0.09
519	0.1
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.09
536	0.15
537	0.15
538	0.15
539	0.19
540	0.2
541	0.2
542	0.2
543	0.19
544	0.13
545	0.15
546	0.15
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.13
551	0.19
552	0.2
553	0.25
554	0.31
555	0.39
556	0.49
557	0.58
558	0.65
559	0.67
560	0.74
561	0.76
562	0.81
563	0.81
564	0.8
565	0.77
566	0.75
567	0.71
568	0.61
569	0.52
570	0.41
571	0.32
572	0.22
573	0.16
574	0.08
575	0.05
576	0.05
577	0.07
578	0.07
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.12
587	0.15
588	0.14
589	0.17
590	0.23
591	0.31
592	0.37
593	0.42
594	0.46
595	0.53
596	0.61
597	0.68
598	0.71
599	0.7
600	0.7
601	0.65
602	0.59
603	0.49
604	0.41
605	0.33
606	0.26
607	0.21
608	0.16
609	0.16
610	0.22
611	0.22
612	0.26
613	0.28
614	0.3
615	0.32
616	0.41
617	0.51
618	0.5
619	0.59
620	0.65
621	0.7
622	0.72
623	0.78
624	0.78
625	0.76
626	0.79
627	0.77
628	0.78
629	0.79
630	0.79
631	0.79
632	0.77
633	0.72
634	0.74
635	0.74
636	0.69
637	0.7
638	0.73
639	0.73
640	0.74
641	0.77
642	0.72
643	0.72
644	0.69
645	0.63
646	0.62
647	0.6
648	0.6
649	0.64
650	0.7
651	0.72
652	0.79
653	0.83
654	0.85
655	0.88
656	0.88
657	0.87
658	0.86
659	0.85
660	0.85
661	0.8
662	0.75
663	0.74
664	0.73
665	0.74
666	0.75
667	0.76

A0A1Y2HXC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer