Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2I3P7

Protein Details
Accession A0A1Y2I3P7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40SPGTARSRPGKHQYCRNYDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
563-598PPRGGGGMGRGAGRGNGGPPRPPPGGRGNGGPQPPP
788-840RETGRSASSSSVRPAGRAGKARSGGTGRGRGRSRGGGGGRGRGRGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) mito 17, extr 5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000380  Topo_IA  
IPR003601  Topo_IA_2  
IPR023406  Topo_IA_AS  
IPR013497  Topo_IA_cen  
IPR013824  Topo_IA_cen_sub1  
IPR013825  Topo_IA_cen_sub2  
IPR013826  Topo_IA_cen_sub3  
IPR023405  Topo_IA_core_domain  
IPR003602  Topo_IA_DNA-bd_dom  
IPR006171  TOPRIM_domain  
IPR010666  Znf_GRF  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01131  Topoisom_bac  
PF01751  Toprim  
PF06839  zf-GRF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00396  TOPOISOMERASE_I_PROK  
PS50880  TOPRIM  
PS51999  ZF_GRF  
CDD cd00186  TOP1Ac  
Amino Acid Sequences MHFLCVAEKPSIAKAMSQLLSPGTARSRPGKHQYCRNYDLVFKYPTAVLAALPLARPLTSRDPPLTVPCPPEELFHADVRRRVNPTRQNGDMLKVKQNLEAEARKAQVLVIWTDCDREGENIGMEIVQVCQAVNPRLIIKRARFSVVQQRELQHAMLNLVDMDLRQALAVDVRTELDLRIGAALTRFLSLRFQPKFNDLQESVISYGSCQFPTLGFVVDAYNKVAAFVPEPFWKIHVSVTRPSAAGTPLPCAFHWTRDRVFDELVCTTLFESCVTSPLAKQMETLPLTTVELQKMGTRYLRMSSDRVMAIAERLYQSGLVSYPRTETNEFDPAMDLAASANLVDGNMFERPRNGGKNDKAHPPIHPTKAAPPNLPADDRKGSETRATIEIAGETFTASGLVVLERNYLDVYPYDKWTGNEIPKCLMQAGQTSPPALLTEADLIGLMDANGIGTDATIHEHIKKVMDRNYVFKQGAHLVPSTLGIALVEGMDRVTLQSLAKPHLRAEMERELVEICEGRVEPGIVVRRAVDKYREVYRRTVVRAWVIEGVLSEKLGGNGGNGGPPRGGGGMGRGAGRGNGGPPRPPPGGRGNGGPQPPPGGTGFGRGNGGNGGPPPPPPPGFGGPYQPPPPDPLHGGNGWAQRPPAPGPGPGIGFGFGGPLPPPPPPHMANSDFKPTTAPPPARLAHGANTGSAGRYISRSHAGTSSASSFMGGPPAPPPSSPPAVKCQCNLHAKLLTAGPTSKNPGRQFFKCPNAAQQCSFFAWADETGVPLPAQNTFGDDGGRGRGRETGRSASSSSVRPAGRAGKARSGGTGRGRGRSRGGGGGRGRGRGRGRGRGRGGGTGQWEETGGGHDDEDEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.29
3 0.29
4 0.27
5 0.26
6 0.22
7 0.24
8 0.22
9 0.23
10 0.2
11 0.22
12 0.26
13 0.32
14 0.38
15 0.45
16 0.55
17 0.62
18 0.66
19 0.73
20 0.79
21 0.8
22 0.8
23 0.76
24 0.68
25 0.64
26 0.62
27 0.57
28 0.51
29 0.42
30 0.38
31 0.33
32 0.31
33 0.27
34 0.21
35 0.15
36 0.13
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.36
50 0.39
51 0.46
52 0.44
53 0.4
54 0.4
55 0.36
56 0.39
57 0.36
58 0.35
59 0.31
60 0.33
61 0.32
62 0.34
63 0.38
64 0.36
65 0.4
66 0.43
67 0.45
68 0.46
69 0.49
70 0.54
71 0.57
72 0.63
73 0.66
74 0.64
75 0.64
76 0.6
77 0.6
78 0.58
79 0.53
80 0.51
81 0.49
82 0.47
83 0.45
84 0.44
85 0.41
86 0.4
87 0.41
88 0.36
89 0.36
90 0.36
91 0.32
92 0.31
93 0.27
94 0.22
95 0.2
96 0.18
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.08
118 0.12
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.19
123 0.23
124 0.28
125 0.33
126 0.35
127 0.41
128 0.42
129 0.44
130 0.41
131 0.44
132 0.51
133 0.51
134 0.51
135 0.48
136 0.47
137 0.47
138 0.48
139 0.42
140 0.33
141 0.26
142 0.21
143 0.17
144 0.15
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.13
176 0.16
177 0.25
178 0.27
179 0.28
180 0.3
181 0.35
182 0.41
183 0.39
184 0.42
185 0.34
186 0.34
187 0.32
188 0.32
189 0.28
190 0.22
191 0.2
192 0.13
193 0.16
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.11
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.15
217 0.17
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.17
222 0.2
223 0.23
224 0.24
225 0.27
226 0.3
227 0.3
228 0.29
229 0.29
230 0.26
231 0.21
232 0.2
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.23
239 0.22
240 0.27
241 0.31
242 0.33
243 0.33
244 0.37
245 0.4
246 0.35
247 0.36
248 0.29
249 0.27
250 0.22
251 0.21
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.07
258 0.09
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.16
265 0.17
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.17
273 0.16
274 0.17
275 0.19
276 0.18
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.15
286 0.17
287 0.21
288 0.21
289 0.22
290 0.22
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.19
295 0.15
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.12
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.19
315 0.24
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.18
320 0.17
321 0.14
322 0.1
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.11
338 0.15
339 0.19
340 0.21
341 0.27
342 0.33
343 0.41
344 0.44
345 0.49
346 0.5
347 0.47
348 0.46
349 0.46
350 0.47
351 0.43
352 0.42
353 0.35
354 0.39
355 0.45
356 0.46
357 0.38
358 0.34
359 0.34
360 0.34
361 0.35
362 0.27
363 0.24
364 0.24
365 0.24
366 0.25
367 0.22
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.19
372 0.18
373 0.18
374 0.14
375 0.13
376 0.12
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.18
404 0.22
405 0.25
406 0.26
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.24
411 0.2
412 0.16
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.1
423 0.08
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.03
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.03
442 0.04
443 0.05
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.11
449 0.13
450 0.17
451 0.22
452 0.29
453 0.29
454 0.33
455 0.37
456 0.4
457 0.38
458 0.33
459 0.3
460 0.26
461 0.26
462 0.23
463 0.19
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.11
468 0.07
469 0.06
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.05
483 0.07
484 0.09
485 0.12
486 0.15
487 0.16
488 0.16
489 0.2
490 0.21
491 0.2
492 0.25
493 0.27
494 0.26
495 0.26
496 0.25
497 0.2
498 0.19
499 0.19
500 0.13
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.1
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.14
513 0.17
514 0.18
515 0.21
516 0.2
517 0.19
518 0.22
519 0.31
520 0.36
521 0.35
522 0.37
523 0.41
524 0.42
525 0.43
526 0.43
527 0.37
528 0.35
529 0.33
530 0.31
531 0.27
532 0.22
533 0.18
534 0.15
535 0.14
536 0.1
537 0.09
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.07
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.05
555 0.07
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.13
566 0.14
567 0.16
568 0.18
569 0.23
570 0.25
571 0.25
572 0.27
573 0.3
574 0.35
575 0.34
576 0.36
577 0.35
578 0.38
579 0.39
580 0.36
581 0.29
582 0.25
583 0.24
584 0.22
585 0.18
586 0.16
587 0.14
588 0.18
589 0.18
590 0.17
591 0.18
592 0.16
593 0.16
594 0.14
595 0.14
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.1
600 0.11
601 0.13
602 0.17
603 0.17
604 0.18
605 0.22
606 0.24
607 0.26
608 0.27
609 0.3
610 0.3
611 0.35
612 0.37
613 0.33
614 0.29
615 0.3
616 0.31
617 0.28
618 0.29
619 0.26
620 0.26
621 0.26
622 0.27
623 0.28
624 0.3
625 0.29
626 0.26
627 0.23
628 0.22
629 0.24
630 0.24
631 0.26
632 0.23
633 0.23
634 0.26
635 0.28
636 0.26
637 0.24
638 0.22
639 0.16
640 0.14
641 0.13
642 0.11
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.08
647 0.09
648 0.11
649 0.14
650 0.17
651 0.22
652 0.23
653 0.27
654 0.32
655 0.36
656 0.39
657 0.4
658 0.45
659 0.4
660 0.38
661 0.37
662 0.32
663 0.34
664 0.38
665 0.36
666 0.31
667 0.37
668 0.39
669 0.38
670 0.4
671 0.35
672 0.3
673 0.34
674 0.32
675 0.25
676 0.26
677 0.23
678 0.2
679 0.19
680 0.15
681 0.1
682 0.11
683 0.13
684 0.14
685 0.19
686 0.19
687 0.2
688 0.22
689 0.23
690 0.22
691 0.23
692 0.22
693 0.18
694 0.17
695 0.16
696 0.15
697 0.13
698 0.16
699 0.13
700 0.11
701 0.12
702 0.17
703 0.17
704 0.16
705 0.2
706 0.23
707 0.29
708 0.31
709 0.32
710 0.38
711 0.45
712 0.47
713 0.47
714 0.48
715 0.49
716 0.55
717 0.55
718 0.52
719 0.49
720 0.46
721 0.46
722 0.41
723 0.35
724 0.29
725 0.29
726 0.24
727 0.24
728 0.3
729 0.32
730 0.38
731 0.4
732 0.47
733 0.52
734 0.54
735 0.59
736 0.61
737 0.66
738 0.64
739 0.62
740 0.63
741 0.65
742 0.65
743 0.59
744 0.53
745 0.48
746 0.43
747 0.43
748 0.33
749 0.24
750 0.22
751 0.2
752 0.19
753 0.15
754 0.15
755 0.13
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.11
761 0.12
762 0.11
763 0.13
764 0.14
765 0.14
766 0.14
767 0.14
768 0.14
769 0.19
770 0.23
771 0.2
772 0.19
773 0.25
774 0.27
775 0.33
776 0.37
777 0.37
778 0.37
779 0.4
780 0.41
781 0.39
782 0.41
783 0.37
784 0.35
785 0.35
786 0.32
787 0.3
788 0.34
789 0.36
790 0.4
791 0.45
792 0.46
793 0.48
794 0.51
795 0.51
796 0.51
797 0.48
798 0.48
799 0.46
800 0.51
801 0.46
802 0.51
803 0.53
804 0.52
805 0.53
806 0.53
807 0.49
808 0.48
809 0.47
810 0.47
811 0.47
812 0.52
813 0.5
814 0.51
815 0.49
816 0.48
817 0.5
818 0.51
819 0.55
820 0.57
821 0.61
822 0.65
823 0.69
824 0.7
825 0.68
826 0.65
827 0.6
828 0.54
829 0.52
830 0.45
831 0.4
832 0.32
833 0.3
834 0.23
835 0.21
836 0.19
837 0.16
838 0.13
839 0.13