Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HSS7

Protein Details
Accession A0A1Y2HSS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50APAAPKSGSKKPKPAARKASELSHydrophilic
813-836GSEPSKAKLRRQKQKAKDEAERAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-17KKQKA
26-45SAAPAAPKSGSKKPKPAARK
78-104KRAKTDAAPAREQPAKKGTGKKDGSRK
378-398GKKAGKKGGAKAGAKKGAAGK
552-581KAAKKMEVEEKKAAAKETKKRELKSEKMIK
820-827KLRRQKQK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 12.333, cyto 6, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR045209  Rrp5  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR008847  Suf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PF05843  Suf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05693  S1_Rrp5_repeat_hs1_sc1  
Amino Acid Sequences MSSANSASFPRGKKQKASAPSSSSSSAAPAAPKSGSKKPKPAARKASELSDGENDDEVDVTGSGSSSPVATSTRPASKRAKTDAAPAREQPAKKGTGKKDGSRKESAATAAADDSFSILKAFTNKRAVVGVVKDIKELDVVIALPEKQFGFVSITEISPHISKLVEQYAEEGEEGDDSDNDDEAGKELPNLRKYFTKGQLVMVKVNQIHIKDGSAAKRVELTLQPKTVSHPLSSSDLKPGMFVPGSIASEQDHGLMIDLGLADSKAAGTSVFMPHSAIPAGVEYLEGQTALFKVHKVDGRVVTVHPVPSDATFESIATSNVKWPDHCIVKPFQMDLGVQRPPPPIAVGEIVRGVVLEHTPAGMMVGLVLPEDEDADGGKKAGKKGGAKAGAKKGAAGKSGADDDKKDVPQYRGLVPTHHISDITLLSPEKRFPEGSKHKFRVLNVDGMRFALTAKKTLVSSDLPIISDYARERVGTIGHGTIVTVRDNGCVVQFFNNVRAFVPISDMSHEFLKSTNDFKRGQPVKCRVFYANPDEGKMKVSFLLEDPRAEAKAAKKMEVEEKKAAAKETKKRELKSEKMIKKLDFAALNNPGGKQITAMDDLHVDMDVEGYVLNVREKAGVFVALSPTVIGRIKIAELSDDFVRDWQTLVKQGDKVKCRVTSLEGNRVELSRKSRAQVGGRNKAADADADMSSEDEESDDDEDMEVDVVDAGADVSDSDDDEDGDDEIVIDGGDDSDADDVDVVLDTNAIAKAGPKSGASGIQVTQGFSWSNSLSDDEDAGADSDSDDDDESSGAAAQADGDEADAMDVDGDGSEPSKAKLRRQKQKAKDEAERAIQQRQAALLNEPQLATDFERLLVGSPNSSFLWIKYMAFQLKLADITKARQVAERAIQTIHYREEQEKLNVWVAWLNLENQFGDRDSLEALFKRAVQYNDPKTVYLHLASIYARSDKHELAREVHNEMLSKFKDSTTVWTRFATYLFEQNQPEDARALLPRGLKSLPKSKHIATITQFALLEFKMGDAERGRTIFEGILASYPKRVDLWSVFLDMEVKSRDLDAARRLFDRIITLKFSAKKIKFFFKKYLEFEKKFGDDSRVEYVKQRAVEYVEALNRGDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.67
3 0.71
4 0.75
5 0.74
6 0.7
7 0.68
8 0.65
9 0.58
10 0.49
11 0.4
12 0.34
13 0.28
14 0.23
15 0.22
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.25
20 0.3
21 0.38
22 0.46
23 0.51
24 0.6
25 0.66
26 0.74
27 0.79
28 0.83
29 0.84
30 0.81
31 0.82
32 0.75
33 0.73
34 0.7
35 0.61
36 0.54
37 0.48
38 0.43
39 0.35
40 0.32
41 0.26
42 0.19
43 0.19
44 0.15
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.09
57 0.1
58 0.15
59 0.21
60 0.3
61 0.32
62 0.38
63 0.46
64 0.51
65 0.59
66 0.62
67 0.64
68 0.56
69 0.65
70 0.68
71 0.66
72 0.63
73 0.57
74 0.55
75 0.54
76 0.53
77 0.48
78 0.46
79 0.46
80 0.48
81 0.55
82 0.56
83 0.6
84 0.66
85 0.69
86 0.73
87 0.76
88 0.75
89 0.73
90 0.68
91 0.6
92 0.56
93 0.49
94 0.42
95 0.33
96 0.28
97 0.21
98 0.2
99 0.17
100 0.13
101 0.13
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.16
108 0.2
109 0.26
110 0.34
111 0.34
112 0.35
113 0.37
114 0.36
115 0.34
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.33
120 0.32
121 0.31
122 0.29
123 0.25
124 0.22
125 0.14
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.2
152 0.19
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.16
175 0.23
176 0.29
177 0.3
178 0.32
179 0.36
180 0.42
181 0.49
182 0.5
183 0.52
184 0.47
185 0.52
186 0.56
187 0.53
188 0.51
189 0.43
190 0.4
191 0.32
192 0.34
193 0.31
194 0.25
195 0.26
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.26
200 0.26
201 0.28
202 0.28
203 0.25
204 0.27
205 0.26
206 0.26
207 0.27
208 0.29
209 0.29
210 0.32
211 0.32
212 0.3
213 0.34
214 0.37
215 0.33
216 0.28
217 0.24
218 0.25
219 0.29
220 0.32
221 0.29
222 0.27
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.23
227 0.22
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.15
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.07
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.14
282 0.17
283 0.19
284 0.25
285 0.26
286 0.28
287 0.29
288 0.28
289 0.27
290 0.26
291 0.24
292 0.19
293 0.17
294 0.15
295 0.14
296 0.16
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.2
311 0.25
312 0.29
313 0.3
314 0.3
315 0.3
316 0.35
317 0.36
318 0.32
319 0.27
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.23
324 0.2
325 0.19
326 0.21
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.18
331 0.14
332 0.14
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.08
366 0.11
367 0.12
368 0.15
369 0.2
370 0.22
371 0.27
372 0.36
373 0.41
374 0.42
375 0.47
376 0.51
377 0.51
378 0.47
379 0.44
380 0.41
381 0.36
382 0.34
383 0.28
384 0.21
385 0.18
386 0.21
387 0.21
388 0.17
389 0.15
390 0.17
391 0.21
392 0.22
393 0.23
394 0.24
395 0.24
396 0.28
397 0.3
398 0.3
399 0.31
400 0.3
401 0.29
402 0.27
403 0.28
404 0.25
405 0.23
406 0.19
407 0.14
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.1
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.26
421 0.35
422 0.44
423 0.52
424 0.53
425 0.57
426 0.59
427 0.58
428 0.57
429 0.49
430 0.48
431 0.39
432 0.38
433 0.32
434 0.3
435 0.29
436 0.19
437 0.17
438 0.13
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.16
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.11
481 0.11
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.16
488 0.13
489 0.16
490 0.11
491 0.1
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.1
498 0.1
499 0.12
500 0.11
501 0.16
502 0.18
503 0.21
504 0.23
505 0.24
506 0.33
507 0.37
508 0.4
509 0.44
510 0.49
511 0.51
512 0.51
513 0.53
514 0.45
515 0.42
516 0.43
517 0.41
518 0.39
519 0.33
520 0.32
521 0.31
522 0.29
523 0.27
524 0.23
525 0.16
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.1
530 0.15
531 0.13
532 0.13
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.15
538 0.12
539 0.18
540 0.19
541 0.18
542 0.18
543 0.19
544 0.28
545 0.31
546 0.33
547 0.28
548 0.29
549 0.3
550 0.3
551 0.3
552 0.26
553 0.29
554 0.32
555 0.39
556 0.47
557 0.51
558 0.51
559 0.59
560 0.62
561 0.61
562 0.63
563 0.65
564 0.6
565 0.62
566 0.65
567 0.56
568 0.5
569 0.46
570 0.39
571 0.3
572 0.26
573 0.24
574 0.23
575 0.23
576 0.21
577 0.2
578 0.17
579 0.15
580 0.14
581 0.09
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.09
591 0.06
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.07
624 0.07
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.1
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.15
636 0.16
637 0.18
638 0.21
639 0.27
640 0.33
641 0.35
642 0.37
643 0.36
644 0.36
645 0.35
646 0.33
647 0.32
648 0.35
649 0.36
650 0.42
651 0.38
652 0.38
653 0.37
654 0.36
655 0.33
656 0.27
657 0.27
658 0.24
659 0.26
660 0.25
661 0.29
662 0.33
663 0.37
664 0.42
665 0.46
666 0.49
667 0.49
668 0.48
669 0.43
670 0.39
671 0.34
672 0.26
673 0.18
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.07
682 0.04
683 0.04
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.06
690 0.06
691 0.05
692 0.04
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.03
698 0.02
699 0.02
700 0.02
701 0.02
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.03
731 0.03
732 0.03
733 0.03
734 0.04
735 0.04
736 0.04
737 0.04
738 0.06
739 0.07
740 0.09
741 0.1
742 0.09
743 0.11
744 0.12
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.13
749 0.17
750 0.18
751 0.16
752 0.15
753 0.14
754 0.14
755 0.12
756 0.14
757 0.09
758 0.09
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.11
764 0.09
765 0.09
766 0.08
767 0.08
768 0.07
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.04
782 0.04
783 0.04
784 0.04
785 0.04
786 0.04
787 0.04
788 0.04
789 0.03
790 0.03
791 0.03
792 0.03
793 0.03
794 0.03
795 0.03
796 0.03
797 0.03
798 0.03
799 0.03
800 0.04
801 0.05
802 0.05
803 0.07
804 0.14
805 0.17
806 0.26
807 0.36
808 0.46
809 0.56
810 0.67
811 0.76
812 0.79
813 0.87
814 0.89
815 0.86
816 0.85
817 0.81
818 0.75
819 0.71
820 0.67
821 0.58
822 0.53
823 0.47
824 0.39
825 0.33
826 0.29
827 0.26
828 0.2
829 0.2
830 0.19
831 0.2
832 0.2
833 0.19
834 0.17
835 0.16
836 0.16
837 0.16
838 0.15
839 0.12
840 0.12
841 0.12
842 0.12
843 0.12
844 0.13
845 0.12
846 0.11
847 0.11
848 0.14
849 0.13
850 0.16
851 0.15
852 0.12
853 0.16
854 0.15
855 0.16
856 0.16
857 0.21
858 0.21
859 0.22
860 0.22
861 0.19
862 0.19
863 0.21
864 0.19
865 0.17
866 0.16
867 0.18
868 0.22
869 0.23
870 0.23
871 0.24
872 0.25
873 0.27
874 0.32
875 0.32
876 0.29
877 0.27
878 0.28
879 0.27
880 0.29
881 0.26
882 0.23
883 0.23
884 0.23
885 0.27
886 0.29
887 0.3
888 0.3
889 0.3
890 0.31
891 0.28
892 0.27
893 0.25
894 0.2
895 0.19
896 0.17
897 0.16
898 0.14
899 0.15
900 0.15
901 0.14
902 0.15
903 0.13
904 0.14
905 0.12
906 0.11
907 0.11
908 0.12
909 0.13
910 0.13
911 0.14
912 0.14
913 0.15
914 0.18
915 0.22
916 0.23
917 0.28
918 0.37
919 0.42
920 0.49
921 0.49
922 0.46
923 0.42
924 0.43
925 0.39
926 0.31
927 0.25
928 0.17
929 0.18
930 0.17
931 0.18
932 0.17
933 0.16
934 0.16
935 0.18
936 0.22
937 0.22
938 0.28
939 0.34
940 0.35
941 0.36
942 0.43
943 0.42
944 0.41
945 0.41
946 0.37
947 0.3
948 0.28
949 0.32
950 0.26
951 0.26
952 0.24
953 0.22
954 0.25
955 0.24
956 0.33
957 0.34
958 0.38
959 0.37
960 0.37
961 0.39
962 0.35
963 0.35
964 0.31
965 0.25
966 0.29
967 0.3
968 0.34
969 0.33
970 0.33
971 0.38
972 0.34
973 0.32
974 0.24
975 0.22
976 0.19
977 0.19
978 0.2
979 0.19
980 0.21
981 0.21
982 0.24
983 0.26
984 0.28
985 0.33
986 0.41
987 0.42
988 0.44
989 0.48
990 0.47
991 0.53
992 0.51
993 0.52
994 0.46
995 0.49
996 0.43
997 0.41
998 0.39
999 0.3
1000 0.29
1001 0.22
1002 0.19
1003 0.12
1004 0.11
1005 0.11
1006 0.11
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.18
1010 0.2
1011 0.21
1012 0.22
1013 0.2
1014 0.21
1015 0.18
1016 0.17
1017 0.15
1018 0.12
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.16
1022 0.18
1023 0.18
1024 0.18
1025 0.18
1026 0.18
1027 0.2
1028 0.21
1029 0.27
1030 0.26
1031 0.28
1032 0.26
1033 0.26
1034 0.27
1035 0.21
1036 0.22
1037 0.18
1038 0.16
1039 0.15
1040 0.15
1041 0.18
1042 0.19
1043 0.24
1044 0.28
1045 0.32
1046 0.34
1047 0.35
1048 0.36
1049 0.34
1050 0.33
1051 0.35
1052 0.32
1053 0.29
1054 0.31
1055 0.32
1056 0.37
1057 0.41
1058 0.45
1059 0.49
1060 0.48
1061 0.53
1062 0.55
1063 0.64
1064 0.66
1065 0.68
1066 0.72
1067 0.71
1068 0.76
1069 0.74
1070 0.79
1071 0.78
1072 0.73
1073 0.7
1074 0.68
1075 0.61
1076 0.55
1077 0.51
1078 0.47
1079 0.38
1080 0.39
1081 0.45
1082 0.39
1083 0.38
1084 0.4
1085 0.44
1086 0.43
1087 0.43
1088 0.39
1089 0.34
1090 0.35
1091 0.36
1092 0.33
1093 0.33
1094 0.32
1095 0.31