Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HE47

Protein Details
Accession A0A1Y2HE47    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-98AAGRKSNASKQQKHQQQRPPNASSPHydrophilic
148-207ADKGKGKGKGKQQQRNNKKRSNPDNDDQDGASKPKRPRPDRKQAKKDKKKKSQICFSCRQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-169KGKGKGKGKQQQRNNKKRSN
178-198ASKPKRPRPDRKQAKKDKKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRYTLNVTHRNGGHDSSEFVSRPVMPTKSQLAAGTLSSAAAPNSTGPTNHPPSAPSAGSSGSKQSQQQRQGGAAGRKSNASKQQKHQQQRPPNASSPAKTSSVSDSAVASAVSSPVSASPVPHSPPSLAQTGGASAPTDNASASGNADKGKGKGKGKQQQRNNKKRSNPDNDDQDGASKPKRPRPDRKQAKKDKKKKSQICFSCRQPGHSIKECTSVSSSNPSSPTKSSSSSSTPDLSKVKCYLCGASKHTLKDCPARFKAPRDEATGKVILPYAQCFHCNETGHLAGQCPKNERGMYLNGGCCHICGSVQHLAKDCKPSKVEEEMATMVGTVTADQSADADDVFIALHNMDQAKSAKKAVAAAAAPMAAGSRKGVKKVVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.32
4 0.26
5 0.29
6 0.25
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.23
11 0.27
12 0.28
13 0.25
14 0.29
15 0.34
16 0.33
17 0.35
18 0.32
19 0.27
20 0.26
21 0.24
22 0.21
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.17
35 0.25
36 0.31
37 0.33
38 0.32
39 0.3
40 0.34
41 0.39
42 0.34
43 0.27
44 0.22
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.24
49 0.21
50 0.24
51 0.29
52 0.36
53 0.43
54 0.49
55 0.53
56 0.51
57 0.5
58 0.52
59 0.53
60 0.5
61 0.46
62 0.43
63 0.38
64 0.39
65 0.4
66 0.41
67 0.44
68 0.48
69 0.51
70 0.56
71 0.65
72 0.72
73 0.79
74 0.82
75 0.82
76 0.82
77 0.85
78 0.84
79 0.8
80 0.75
81 0.73
82 0.68
83 0.6
84 0.54
85 0.48
86 0.42
87 0.36
88 0.32
89 0.29
90 0.28
91 0.26
92 0.21
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.14
97 0.09
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.1
108 0.14
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.2
114 0.21
115 0.2
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.11
122 0.08
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.31
142 0.4
143 0.47
144 0.56
145 0.63
146 0.67
147 0.72
148 0.8
149 0.85
150 0.84
151 0.83
152 0.81
153 0.82
154 0.83
155 0.82
156 0.77
157 0.73
158 0.72
159 0.66
160 0.59
161 0.49
162 0.41
163 0.32
164 0.27
165 0.22
166 0.21
167 0.24
168 0.28
169 0.38
170 0.45
171 0.55
172 0.63
173 0.72
174 0.77
175 0.84
176 0.89
177 0.9
178 0.93
179 0.93
180 0.94
181 0.93
182 0.93
183 0.92
184 0.91
185 0.88
186 0.87
187 0.86
188 0.83
189 0.79
190 0.73
191 0.72
192 0.63
193 0.57
194 0.53
195 0.5
196 0.5
197 0.5
198 0.48
199 0.39
200 0.45
201 0.42
202 0.38
203 0.33
204 0.27
205 0.2
206 0.24
207 0.23
208 0.19
209 0.23
210 0.22
211 0.23
212 0.23
213 0.26
214 0.23
215 0.25
216 0.24
217 0.24
218 0.27
219 0.27
220 0.28
221 0.27
222 0.25
223 0.26
224 0.29
225 0.26
226 0.26
227 0.27
228 0.25
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.26
233 0.31
234 0.32
235 0.36
236 0.39
237 0.39
238 0.4
239 0.41
240 0.39
241 0.43
242 0.44
243 0.45
244 0.45
245 0.49
246 0.51
247 0.54
248 0.61
249 0.59
250 0.57
251 0.56
252 0.56
253 0.51
254 0.51
255 0.45
256 0.35
257 0.29
258 0.26
259 0.19
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.2
267 0.24
268 0.24
269 0.24
270 0.26
271 0.26
272 0.26
273 0.25
274 0.23
275 0.24
276 0.27
277 0.29
278 0.29
279 0.29
280 0.33
281 0.32
282 0.32
283 0.3
284 0.3
285 0.32
286 0.32
287 0.34
288 0.29
289 0.31
290 0.29
291 0.25
292 0.22
293 0.17
294 0.13
295 0.1
296 0.14
297 0.2
298 0.23
299 0.26
300 0.3
301 0.34
302 0.37
303 0.46
304 0.44
305 0.43
306 0.42
307 0.44
308 0.44
309 0.47
310 0.48
311 0.39
312 0.41
313 0.35
314 0.34
315 0.3
316 0.24
317 0.17
318 0.13
319 0.11
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.09
339 0.09
340 0.13
341 0.16
342 0.21
343 0.24
344 0.26
345 0.25
346 0.26
347 0.29
348 0.27
349 0.3
350 0.26
351 0.24
352 0.23
353 0.21
354 0.19
355 0.15
356 0.14
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.18
361 0.21
362 0.25