Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HJ17

Protein Details
Accession A0A1Y2HJ17    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-444GSSSGKSDDKQPPKKKAKTAANEPNSLASSSALKKRKTRARTSEWKKGHEQKKRKAAKALPRKLAKKAKKLAAQPGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-76PKAASAPAPSKAKATKLAKPQKR
361-444AKPAKKGSSSGKSDDKQPPKKKAKTAANEPNSLASSSALKKRKTRARTSEWKKGHEQKKRKAAKALPRKLAKKAKKLAAQPGKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MSFVNDLFKSATVDKELDSLFAKSKGPATKPAALTATPIAVPTTARTNQNKPAPKAASAPAPSKAKATKLAKPQKRAAPESDSESNEESDAESDSEDAESDSDDDQEDASGSGSDAAEEADSDAEADGVAPAADSAAAPKKPQSEKQAEREKLQRTVFVGNVTIRASEKEIYKEFRAKFAEHGHVESIRFRSITFTDALPRKLNFKLKNFHPERDSCNAYVVFSTAEAAKKAAAAINASTFEGKHLRCDYLGKTDGSEGRVGARRDVKRCVFVGNVPFDIEDEALWTFFAQAGEVESVRVIRDKKVGLGKGFAYVQFKERSTVPLALKLHETDFKGKPIRVFKCHKLDDNNTTSSAKSSSAKPAKKGSSSGKSDDKQPPKKKAKTAANEPNSLASSSALKKRKTRARTSEWKKGHEQKKRKAAKALPRKLAKKAKKLAAQPGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.24
4 0.21
5 0.22
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.23
10 0.21
11 0.27
12 0.32
13 0.34
14 0.41
15 0.44
16 0.5
17 0.5
18 0.53
19 0.49
20 0.42
21 0.41
22 0.34
23 0.29
24 0.21
25 0.19
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.18
31 0.21
32 0.29
33 0.35
34 0.4
35 0.48
36 0.57
37 0.64
38 0.61
39 0.66
40 0.62
41 0.58
42 0.57
43 0.52
44 0.51
45 0.46
46 0.45
47 0.42
48 0.43
49 0.41
50 0.41
51 0.41
52 0.36
53 0.42
54 0.44
55 0.45
56 0.52
57 0.62
58 0.65
59 0.7
60 0.74
61 0.72
62 0.75
63 0.72
64 0.67
65 0.63
66 0.58
67 0.57
68 0.55
69 0.48
70 0.43
71 0.39
72 0.34
73 0.27
74 0.24
75 0.18
76 0.13
77 0.12
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.05
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.15
127 0.22
128 0.27
129 0.33
130 0.39
131 0.45
132 0.51
133 0.61
134 0.69
135 0.64
136 0.64
137 0.65
138 0.61
139 0.57
140 0.51
141 0.44
142 0.36
143 0.37
144 0.34
145 0.27
146 0.25
147 0.18
148 0.19
149 0.17
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.2
158 0.23
159 0.26
160 0.32
161 0.31
162 0.35
163 0.35
164 0.32
165 0.33
166 0.35
167 0.38
168 0.32
169 0.33
170 0.28
171 0.27
172 0.26
173 0.25
174 0.21
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.18
184 0.21
185 0.23
186 0.23
187 0.22
188 0.24
189 0.27
190 0.35
191 0.34
192 0.37
193 0.42
194 0.44
195 0.54
196 0.54
197 0.53
198 0.5
199 0.47
200 0.46
201 0.44
202 0.43
203 0.32
204 0.32
205 0.28
206 0.24
207 0.21
208 0.16
209 0.11
210 0.08
211 0.08
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.12
230 0.12
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.23
243 0.21
244 0.2
245 0.13
246 0.15
247 0.2
248 0.19
249 0.21
250 0.27
251 0.31
252 0.34
253 0.41
254 0.39
255 0.37
256 0.38
257 0.36
258 0.29
259 0.28
260 0.31
261 0.26
262 0.25
263 0.21
264 0.21
265 0.18
266 0.17
267 0.14
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.16
290 0.17
291 0.22
292 0.29
293 0.32
294 0.3
295 0.32
296 0.3
297 0.28
298 0.29
299 0.26
300 0.22
301 0.19
302 0.22
303 0.23
304 0.23
305 0.22
306 0.22
307 0.23
308 0.24
309 0.29
310 0.26
311 0.3
312 0.31
313 0.3
314 0.31
315 0.29
316 0.27
317 0.25
318 0.26
319 0.25
320 0.27
321 0.32
322 0.35
323 0.36
324 0.39
325 0.45
326 0.49
327 0.51
328 0.57
329 0.59
330 0.64
331 0.67
332 0.68
333 0.66
334 0.67
335 0.67
336 0.65
337 0.59
338 0.51
339 0.47
340 0.41
341 0.34
342 0.28
343 0.22
344 0.19
345 0.2
346 0.28
347 0.37
348 0.41
349 0.45
350 0.52
351 0.55
352 0.56
353 0.6
354 0.58
355 0.58
356 0.6
357 0.61
358 0.61
359 0.57
360 0.62
361 0.65
362 0.67
363 0.68
364 0.72
365 0.77
366 0.78
367 0.85
368 0.85
369 0.85
370 0.85
371 0.84
372 0.86
373 0.86
374 0.82
375 0.77
376 0.69
377 0.63
378 0.53
379 0.44
380 0.33
381 0.23
382 0.22
383 0.24
384 0.32
385 0.35
386 0.39
387 0.46
388 0.56
389 0.65
390 0.69
391 0.74
392 0.76
393 0.79
394 0.85
395 0.87
396 0.88
397 0.85
398 0.82
399 0.81
400 0.81
401 0.81
402 0.81
403 0.82
404 0.82
405 0.85
406 0.89
407 0.86
408 0.86
409 0.85
410 0.85
411 0.86
412 0.86
413 0.85
414 0.85
415 0.83
416 0.83
417 0.85
418 0.84
419 0.83
420 0.82
421 0.82
422 0.8
423 0.83
424 0.84