Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HPL3

Protein Details
Accession A0A1Y2HPL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
513-535ATLTAKERLKRERRDKRNTYLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-127SKKRK
845-958LGGRGGRGGSGEMRGRGGSRGGSSGGFRGRGGAAGGDARGRGGSRGGSAGFRGANSSSSGAGRGRGGNSRGGGSFGRGGGSSRGGSAGGRGGNAGARGGGRGGRGGRGGGRGGS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.333, cyto 12, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12414  RRM2_RBM28_like  
Amino Acid Sequences MSDPGPAPTASSTAAAPAADAATAAPAAPKPTTTLYVKGLPTSAQSADLEAFFSEYGPVRQCFVVQDSSDKSKNRGFGFVHFAVPEDALSALQQAKERPFLESGKTLTLELAKPREKLEDRTSKKRKGAPTDSETAGASSAAERADDGAANKKIKTGTEQFTNTPAVASTAPNNVSSSSSSSSSLAKAATVLPDAKKPKITPATTARLIVRNLSFKCTPATLRTTFGAYGTVTECTMPRKFEPSGPYRGFGIVQFAKRAEAQRAIDHMNEKEICGRQVAVDWCIPQAQFLVAEGVDKDEVARRLKDKFEKGKGRLDTDLGIVEQDDDDEDDQSGSDDDSDHVSDDDDANSDGSDDEDTMSVDGDNKPSATRTQRHPMPALDAGTTVFIRNVPFEATEDDLIQCFSTFGPLVYAKITKDKHTGKSKGTAFACYTTKAHADACLEEASKTNDMAYAMTTTASIGSSTGGPAASAPMTSSNSLLTPDLPSTLSTSTLILSGRLLNVTRAVSRDLAATLTAKERLKRERRDKRNTYLLSEGWQGDLADRRAALEGNHALYVSRTRVALRRVPLHVGDVALRAFATAAARGYLERIVKRGKDREWPLPADEIESGVLDPNKVREWPEEVAKIKTVVRQAKVVRAKDRVGTDGQLRSKGFGFVEFADELAALACVRALAKPELARVRKLVLEHLVEKEEEDETKEGESKEGDDKMEVDEEVEDAVERANALAEQDDDEAQQKQDESGSGSNSDSDEDLAAADSTSDAAESSNPSDDEDDDEEDEDVPTHTLAGKPIPEIIVEFAIENRQVVNMRDAKLKRLQKAQQVQRANVTDRQSQGRRGGSNSPGAALGGRGGRGGSGEMRGRGGSRGGSSGGFRGRGGAAGGDARGRGGSRGGSAGFRGANSSSSGAGRGRGGNSRGGGSFGRGGGSSRGGSAGGRGGNAGARGGGRGGRGGRGGGRGGSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.08
7 0.08
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.15
18 0.19
19 0.24
20 0.26
21 0.29
22 0.31
23 0.38
24 0.38
25 0.36
26 0.34
27 0.29
28 0.29
29 0.28
30 0.24
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.19
36 0.17
37 0.13
38 0.13
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.14
44 0.18
45 0.18
46 0.2
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.24
51 0.27
52 0.23
53 0.29
54 0.32
55 0.38
56 0.44
57 0.42
58 0.43
59 0.42
60 0.48
61 0.44
62 0.46
63 0.41
64 0.41
65 0.47
66 0.44
67 0.42
68 0.35
69 0.34
70 0.28
71 0.26
72 0.2
73 0.12
74 0.11
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.15
81 0.18
82 0.21
83 0.28
84 0.28
85 0.29
86 0.31
87 0.32
88 0.34
89 0.35
90 0.34
91 0.32
92 0.32
93 0.29
94 0.26
95 0.27
96 0.26
97 0.27
98 0.33
99 0.33
100 0.34
101 0.35
102 0.43
103 0.43
104 0.47
105 0.51
106 0.54
107 0.58
108 0.68
109 0.75
110 0.75
111 0.79
112 0.79
113 0.78
114 0.77
115 0.79
116 0.78
117 0.75
118 0.72
119 0.66
120 0.6
121 0.51
122 0.4
123 0.31
124 0.21
125 0.14
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.18
136 0.23
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.28
142 0.34
143 0.34
144 0.34
145 0.4
146 0.43
147 0.42
148 0.43
149 0.44
150 0.36
151 0.29
152 0.23
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.2
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.19
172 0.15
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.23
181 0.27
182 0.29
183 0.32
184 0.32
185 0.39
186 0.45
187 0.45
188 0.45
189 0.49
190 0.54
191 0.51
192 0.53
193 0.47
194 0.42
195 0.41
196 0.38
197 0.33
198 0.33
199 0.32
200 0.35
201 0.33
202 0.29
203 0.31
204 0.29
205 0.28
206 0.25
207 0.31
208 0.27
209 0.29
210 0.29
211 0.29
212 0.26
213 0.24
214 0.21
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.14
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.22
227 0.24
228 0.28
229 0.35
230 0.36
231 0.44
232 0.42
233 0.42
234 0.38
235 0.37
236 0.33
237 0.26
238 0.28
239 0.23
240 0.22
241 0.23
242 0.22
243 0.22
244 0.24
245 0.27
246 0.23
247 0.25
248 0.25
249 0.26
250 0.29
251 0.3
252 0.29
253 0.3
254 0.27
255 0.26
256 0.25
257 0.22
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.2
262 0.19
263 0.14
264 0.19
265 0.2
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.1
286 0.14
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.24
291 0.31
292 0.38
293 0.43
294 0.49
295 0.56
296 0.63
297 0.64
298 0.69
299 0.66
300 0.62
301 0.54
302 0.46
303 0.37
304 0.29
305 0.26
306 0.17
307 0.13
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.15
356 0.19
357 0.24
358 0.29
359 0.37
360 0.41
361 0.45
362 0.47
363 0.43
364 0.4
365 0.38
366 0.33
367 0.24
368 0.2
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.1
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.17
402 0.18
403 0.19
404 0.27
405 0.31
406 0.38
407 0.46
408 0.5
409 0.46
410 0.53
411 0.53
412 0.51
413 0.47
414 0.42
415 0.34
416 0.32
417 0.31
418 0.24
419 0.23
420 0.17
421 0.17
422 0.15
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.11
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.12
504 0.13
505 0.15
506 0.19
507 0.29
508 0.37
509 0.46
510 0.56
511 0.63
512 0.72
513 0.8
514 0.84
515 0.81
516 0.82
517 0.74
518 0.66
519 0.59
520 0.49
521 0.4
522 0.35
523 0.28
524 0.18
525 0.17
526 0.13
527 0.1
528 0.13
529 0.12
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.12
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.12
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.14
549 0.19
550 0.23
551 0.25
552 0.29
553 0.3
554 0.32
555 0.31
556 0.28
557 0.25
558 0.2
559 0.17
560 0.13
561 0.11
562 0.09
563 0.08
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.09
575 0.12
576 0.12
577 0.15
578 0.19
579 0.23
580 0.29
581 0.34
582 0.34
583 0.41
584 0.45
585 0.51
586 0.52
587 0.51
588 0.46
589 0.43
590 0.4
591 0.32
592 0.27
593 0.19
594 0.14
595 0.12
596 0.1
597 0.08
598 0.09
599 0.07
600 0.07
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.12
605 0.13
606 0.17
607 0.19
608 0.23
609 0.27
610 0.28
611 0.29
612 0.28
613 0.28
614 0.24
615 0.25
616 0.29
617 0.29
618 0.28
619 0.33
620 0.34
621 0.41
622 0.47
623 0.49
624 0.47
625 0.46
626 0.46
627 0.44
628 0.44
629 0.38
630 0.32
631 0.29
632 0.28
633 0.3
634 0.3
635 0.3
636 0.28
637 0.27
638 0.26
639 0.25
640 0.21
641 0.16
642 0.16
643 0.12
644 0.15
645 0.13
646 0.13
647 0.11
648 0.1
649 0.09
650 0.07
651 0.07
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.04
657 0.04
658 0.07
659 0.08
660 0.12
661 0.13
662 0.19
663 0.27
664 0.29
665 0.31
666 0.29
667 0.3
668 0.29
669 0.29
670 0.28
671 0.24
672 0.25
673 0.25
674 0.26
675 0.25
676 0.23
677 0.22
678 0.2
679 0.16
680 0.13
681 0.13
682 0.12
683 0.11
684 0.12
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.14
689 0.14
690 0.17
691 0.19
692 0.18
693 0.16
694 0.16
695 0.17
696 0.17
697 0.15
698 0.11
699 0.09
700 0.09
701 0.08
702 0.07
703 0.06
704 0.05
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.05
712 0.05
713 0.06
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.09
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.12
722 0.11
723 0.1
724 0.11
725 0.11
726 0.14
727 0.14
728 0.16
729 0.16
730 0.16
731 0.16
732 0.16
733 0.16
734 0.12
735 0.1
736 0.09
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.05
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.07
751 0.09
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.14
757 0.17
758 0.18
759 0.18
760 0.16
761 0.17
762 0.16
763 0.16
764 0.15
765 0.11
766 0.1
767 0.08
768 0.07
769 0.07
770 0.08
771 0.08
772 0.1
773 0.13
774 0.13
775 0.13
776 0.15
777 0.15
778 0.14
779 0.14
780 0.14
781 0.12
782 0.11
783 0.11
784 0.1
785 0.12
786 0.12
787 0.11
788 0.09
789 0.1
790 0.12
791 0.14
792 0.21
793 0.24
794 0.26
795 0.35
796 0.35
797 0.39
798 0.46
799 0.52
800 0.5
801 0.55
802 0.59
803 0.61
804 0.71
805 0.74
806 0.75
807 0.74
808 0.7
809 0.68
810 0.67
811 0.6
812 0.56
813 0.51
814 0.46
815 0.44
816 0.5
817 0.46
818 0.47
819 0.5
820 0.5
821 0.48
822 0.47
823 0.5
824 0.45
825 0.48
826 0.43
827 0.37
828 0.3
829 0.28
830 0.24
831 0.17
832 0.16
833 0.11
834 0.11
835 0.1
836 0.1
837 0.09
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.14
842 0.18
843 0.18
844 0.2
845 0.21
846 0.21
847 0.21
848 0.21
849 0.18
850 0.17
851 0.18
852 0.18
853 0.18
854 0.19
855 0.22
856 0.24
857 0.22
858 0.2
859 0.21
860 0.2
861 0.2
862 0.19
863 0.14
864 0.12
865 0.12
866 0.13
867 0.12
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.11
872 0.11
873 0.11
874 0.12
875 0.13
876 0.15
877 0.16
878 0.17
879 0.17
880 0.2
881 0.18
882 0.17
883 0.18
884 0.16
885 0.16
886 0.17
887 0.18
888 0.16
889 0.16
890 0.18
891 0.17
892 0.18
893 0.19
894 0.21
895 0.23
896 0.28
897 0.29
898 0.32
899 0.32
900 0.33
901 0.31
902 0.3
903 0.28
904 0.24
905 0.25
906 0.2
907 0.2
908 0.17
909 0.19
910 0.19
911 0.21
912 0.19
913 0.16
914 0.16
915 0.16
916 0.15
917 0.15
918 0.17
919 0.15
920 0.15
921 0.14
922 0.14
923 0.16
924 0.16
925 0.15
926 0.11
927 0.1
928 0.11
929 0.12
930 0.14
931 0.13
932 0.17
933 0.18
934 0.2
935 0.21
936 0.23
937 0.24
938 0.26
939 0.27