Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HD47

Protein Details
Accession A0A1Y2HD47    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31DHDSNDTGRPPKRRRTRSPSPLTAVAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-19PKRRR
559-575AGERPVKESKARGGKGK
Subcellular Location(s) mito 8, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5, plas 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
Amino Acid Sequences MPNRDHDSNDTGRPPKRRRTRSPSPLTAVAMAEAKRQAEMDAMDVGDEEFEFDEDDNDGAEEEFAQEMDEHDDDEDVLEFEDIALPPAPQGDTHPLDADTVVDEGEDEDDDLAFEDITIPPTNPPPMPASDFSIPIPTNLSTIEFTLPLNPSDSQASSNSQKKRRAITKADRIARLTLHRMHLLSLLSSAHLAHKAVSVDDTVHALVLSLIPPPVATAMRLGSDHVRLGPLITWLRSEFTADPMLPWPDGADTVAIAITNRVGHPCTLVLAVAALLWHVVGVKARLVAGLNPIPLTFQGQTAQPSVNDSADPQSSTAAPSSTTAKSCREVLVEKAATIYPLAFALEVPKGHGEWTPLHFNWTVIDHMTPTTTSAYARATASSRSSVTSDTQPHPFDTLKSSGGPYFTSPYVVALAHPPRLSRTSIPRAKDVSVRYLTGLRGGRPVEDPKFRVPLDDPWWSQLVSTGAAGSTAGATAGGVEDQYMLEQLLVNAPFPTRLADYKDHRVYALERHLRKDEVVYPKEPVLGKIKGEMIYPRANVKQVRSERVWVRQFGRQVKAGERPVKESKARGGKGKGADIEQESQETQAGTVALFGEWQTEPYVATAEVDPVTGEVPTNEHGNVELFHPCMVPKGGVHVTGMSLRVPDSFPFVHF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.75
4 0.79
5 0.82
6 0.85
7 0.89
8 0.9
9 0.92
10 0.9
11 0.86
12 0.8
13 0.72
14 0.64
15 0.53
16 0.44
17 0.38
18 0.29
19 0.26
20 0.23
21 0.21
22 0.19
23 0.19
24 0.18
25 0.16
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.09
69 0.08
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.13
78 0.18
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.23
85 0.19
86 0.12
87 0.1
88 0.08
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.15
109 0.19
110 0.17
111 0.19
112 0.19
113 0.22
114 0.27
115 0.27
116 0.3
117 0.28
118 0.3
119 0.28
120 0.3
121 0.27
122 0.22
123 0.23
124 0.18
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.12
129 0.14
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.15
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.21
144 0.26
145 0.33
146 0.4
147 0.45
148 0.51
149 0.54
150 0.62
151 0.66
152 0.68
153 0.71
154 0.73
155 0.76
156 0.78
157 0.79
158 0.73
159 0.67
160 0.59
161 0.52
162 0.46
163 0.41
164 0.36
165 0.33
166 0.32
167 0.3
168 0.29
169 0.28
170 0.24
171 0.19
172 0.15
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.16
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.06
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.14
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.21
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.15
342 0.19
343 0.19
344 0.21
345 0.21
346 0.2
347 0.19
348 0.17
349 0.15
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.15
374 0.19
375 0.22
376 0.23
377 0.27
378 0.27
379 0.26
380 0.27
381 0.26
382 0.22
383 0.21
384 0.21
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.16
389 0.17
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.11
400 0.13
401 0.16
402 0.17
403 0.18
404 0.17
405 0.19
406 0.21
407 0.23
408 0.22
409 0.29
410 0.36
411 0.41
412 0.43
413 0.45
414 0.46
415 0.45
416 0.46
417 0.4
418 0.37
419 0.34
420 0.32
421 0.28
422 0.28
423 0.26
424 0.27
425 0.26
426 0.19
427 0.21
428 0.21
429 0.21
430 0.22
431 0.28
432 0.27
433 0.31
434 0.33
435 0.32
436 0.37
437 0.36
438 0.35
439 0.32
440 0.33
441 0.34
442 0.37
443 0.34
444 0.32
445 0.33
446 0.3
447 0.27
448 0.23
449 0.19
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.06
457 0.04
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.12
483 0.1
484 0.13
485 0.18
486 0.24
487 0.3
488 0.4
489 0.43
490 0.42
491 0.4
492 0.39
493 0.36
494 0.37
495 0.41
496 0.4
497 0.39
498 0.43
499 0.46
500 0.45
501 0.44
502 0.4
503 0.38
504 0.39
505 0.41
506 0.38
507 0.37
508 0.37
509 0.41
510 0.37
511 0.32
512 0.29
513 0.27
514 0.26
515 0.27
516 0.3
517 0.26
518 0.27
519 0.27
520 0.25
521 0.28
522 0.28
523 0.3
524 0.29
525 0.33
526 0.35
527 0.36
528 0.41
529 0.42
530 0.48
531 0.47
532 0.52
533 0.53
534 0.59
535 0.61
536 0.57
537 0.54
538 0.52
539 0.57
540 0.57
541 0.56
542 0.51
543 0.49
544 0.49
545 0.53
546 0.57
547 0.57
548 0.51
549 0.54
550 0.55
551 0.59
552 0.57
553 0.53
554 0.54
555 0.56
556 0.58
557 0.58
558 0.57
559 0.57
560 0.57
561 0.59
562 0.52
563 0.44
564 0.44
565 0.4
566 0.39
567 0.33
568 0.3
569 0.25
570 0.23
571 0.22
572 0.17
573 0.14
574 0.11
575 0.11
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.13
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.08
600 0.08
601 0.06
602 0.09
603 0.1
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.13
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.15
614 0.15
615 0.14
616 0.16
617 0.17
618 0.17
619 0.14
620 0.21
621 0.23
622 0.23
623 0.25
624 0.22
625 0.22
626 0.23
627 0.23
628 0.16
629 0.15
630 0.14
631 0.15
632 0.16
633 0.15
634 0.18