FuNGI

A0A1Y2HWA2

Protein Details

Accession

A0A1Y2HWA2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-93	QARKKPMVIRRVINKHERKSNF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MVYSFSEFKMHPALNMIIGPNGTGKSTIVCALAVGLATNPKVTGRGNEVWDYVRNGAEDGIATVDIELSMGQARKKPMVIRRVINKHERKSNFFIDGKSASVSSVGVQLKQLNVQVENICQFLPQERVSALAAMSDVELLKEVQKAAGPLDMLGKHEQLVQLDDDVRALEHNVQHLVQEIETLVGKNSAIEAQYTRIQNRAQIRKKFNLTRAALASAKYDLIKERIRVAFASKQEHEANVTQLRELLEPLDAQLSTLRDQFNVHKNKGQEPARALADQLGELASIKRDVGRMEQTIDRIIQDIEDAKSELVVAQRGLDKIEADIRGLEAQLADIPDNLQEQQEEASRLRREQAGIDDQIARLRVESQAVENNTHDLLSNEREMSREQDYARRQIHDFQNEQNPRWKLLQQIDHGEPARMFGWIRANRGNFHGQVRGPLLMEMDLEDRQLAHLVEATLNPMLLTRTYLIEDPRDHELLCQQFIDDGAPMKARINLAEHHESPIDWPYAPEMLHQLGFQGVLLDLVKADNYILSYLANQAGLNRTPYSQSNRPIDPQLAWRHHIQRYIFDRVLFNSRSHPSSPDDIVTTTNQIHRSNFLHTESGDDLRRKIEDLQAKVDELDERIAEVRHKREKSEREVADLKMALTEKNSERVAIAQRIKNLSHASQARADLQRKLAAARQRLEKEAQKPIGLQRKVDRLETDKAKVHKERVFRVAEIRSLAAKIPKILNDKRIGCLQAAVSSHIFKAALDKAAHLKDELARATDDLKRATDAVADYRRQATDIKSEWQTAAVEVDENVDTVRAQVTQLRTELELVDKPLDDQVNFLHNKVDELEATLDMASATDDSIVQQYENRQAMIDDKQAKLEEEQNKLADKTQERDELKNDWLPTLEAFLETVSNNFSAYFSYIRCAGEVSLKKADMFKDYALEIRVKFRATQELQVLEKSRQSGGERAVTTILFLLSLQEHSKAPFRLVDEINQGMDEINERMVHKLLVESASKPGSPQYFLITPKLLCGLYYSDKMRVHCVYNGPDVDPLLSANDADFGEEEDIDVPEEPITVSAFIAKMRELRSANGGPRVQASA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.25
4	0.19
5	0.18
6	0.18
7	0.15
8	0.15
9	0.13
10	0.12
11	0.12
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.13
16	0.13
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.1
21	0.09
22	0.08
23	0.1
24	0.1
25	0.11
26	0.11
27	0.11
28	0.14
29	0.15
30	0.18
31	0.23
32	0.29
33	0.33
34	0.35
35	0.37
36	0.37
37	0.38
38	0.38
39	0.32
40	0.28
41	0.24
42	0.22
43	0.2
44	0.17
45	0.15
46	0.11
47	0.11
48	0.09
49	0.08
50	0.08
51	0.07
52	0.06
53	0.06
54	0.05
55	0.05
56	0.09
57	0.11
58	0.14
59	0.18
60	0.22
61	0.26
62	0.3
63	0.37
64	0.41
65	0.49
66	0.55
67	0.59
68	0.65
69	0.72
70	0.76
71	0.79
72	0.8
73	0.79
74	0.81
75	0.79
76	0.76
77	0.74
78	0.72
79	0.69
80	0.63
81	0.56
82	0.52
83	0.47
84	0.41
85	0.35
86	0.28
87	0.2
88	0.18
89	0.16
90	0.11
91	0.17
92	0.17
93	0.16
94	0.18
95	0.2
96	0.2
97	0.23
98	0.25
99	0.21
100	0.21
101	0.24
102	0.23
103	0.25
104	0.25
105	0.23
106	0.2
107	0.17
108	0.17
109	0.17
110	0.2
111	0.18
112	0.18
113	0.17
114	0.2
115	0.2
116	0.2
117	0.16
118	0.12
119	0.11
120	0.09
121	0.09
122	0.08
123	0.07
124	0.06
125	0.07
126	0.07
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.15
135	0.13
136	0.12
137	0.17
138	0.17
139	0.18
140	0.2
141	0.19
142	0.17
143	0.2
144	0.21
145	0.17
146	0.18
147	0.16
148	0.16
149	0.17
150	0.16
151	0.14
152	0.13
153	0.12
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.13
158	0.15
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.14
165	0.12
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.11
179	0.13
180	0.19
181	0.22
182	0.23
183	0.25
184	0.26
185	0.3
186	0.39
187	0.46
188	0.5
189	0.56
190	0.63
191	0.67
192	0.76
193	0.78
194	0.75
195	0.74
196	0.68
197	0.64
198	0.59
199	0.54
200	0.46
201	0.39
202	0.34
203	0.25
204	0.23
205	0.18
206	0.16
207	0.15
208	0.19
209	0.23
210	0.23
211	0.29
212	0.29
213	0.31
214	0.3
215	0.33
216	0.34
217	0.34
218	0.4
219	0.33
220	0.37
221	0.36
222	0.36
223	0.34
224	0.29
225	0.3
226	0.27
227	0.27
228	0.22
229	0.23
230	0.23
231	0.2
232	0.19
233	0.14
234	0.11
235	0.1
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.16
245	0.15
246	0.17
247	0.23
248	0.3
249	0.37
250	0.38
251	0.39
252	0.41
253	0.46
254	0.53
255	0.51
256	0.47
257	0.42
258	0.45
259	0.43
260	0.4
261	0.35
262	0.29
263	0.24
264	0.19
265	0.15
266	0.11
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.14
277	0.19
278	0.2
279	0.22
280	0.24
281	0.24
282	0.25
283	0.24
284	0.2
285	0.16
286	0.14
287	0.11
288	0.1
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.09
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.15
308	0.14
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.11
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.09
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.19
333	0.2
334	0.21
335	0.23
336	0.23
337	0.22
338	0.22
339	0.26
340	0.25
341	0.24
342	0.26
343	0.24
344	0.22
345	0.23
346	0.22
347	0.16
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.16
355	0.17
356	0.19
357	0.18
358	0.19
359	0.17
360	0.16
361	0.14
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.13
366	0.12
367	0.12
368	0.14
369	0.14
370	0.17
371	0.18
372	0.18
373	0.18
374	0.24
375	0.28
376	0.35
377	0.36
378	0.36
379	0.34
380	0.39
381	0.45
382	0.44
383	0.43
384	0.39
385	0.47
386	0.47
387	0.48
388	0.48
389	0.42
390	0.38
391	0.38
392	0.35
393	0.31
394	0.35
395	0.4
396	0.36
397	0.4
398	0.39
399	0.4
400	0.39
401	0.33
402	0.26
403	0.21
404	0.18
405	0.13
406	0.12
407	0.1
408	0.19
409	0.2
410	0.24
411	0.27
412	0.28
413	0.29
414	0.33
415	0.34
416	0.27
417	0.27
418	0.27
419	0.23
420	0.24
421	0.24
422	0.21
423	0.18
424	0.16
425	0.14
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.06
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.1
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.18
459	0.18
460	0.17
461	0.16
462	0.19
463	0.18
464	0.18
465	0.15
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.17
482	0.21
483	0.21
484	0.21
485	0.2
486	0.2
487	0.18
488	0.19
489	0.15
490	0.1
491	0.1
492	0.09
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.08
526	0.09
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.11
531	0.14
532	0.2
533	0.23
534	0.29
535	0.31
536	0.32
537	0.34
538	0.34
539	0.32
540	0.27
541	0.28
542	0.3
543	0.28
544	0.29
545	0.31
546	0.35
547	0.36
548	0.39
549	0.33
550	0.33
551	0.35
552	0.4
553	0.37
554	0.32
555	0.31
556	0.28
557	0.33
558	0.27
559	0.22
560	0.21
561	0.22
562	0.23
563	0.23
564	0.24
565	0.21
566	0.23
567	0.24
568	0.2
569	0.19
570	0.17
571	0.17
572	0.16
573	0.14
574	0.12
575	0.15
576	0.17
577	0.17
578	0.17
579	0.19
580	0.2
581	0.21
582	0.22
583	0.21
584	0.19
585	0.18
586	0.2
587	0.18
588	0.2
589	0.2
590	0.18
591	0.17
592	0.17
593	0.17
594	0.15
595	0.16
596	0.19
597	0.22
598	0.23
599	0.27
600	0.27
601	0.27
602	0.25
603	0.24
604	0.19
605	0.13
606	0.12
607	0.07
608	0.07
609	0.08
610	0.08
611	0.11
612	0.14
613	0.21
614	0.28
615	0.3
616	0.33
617	0.41
618	0.47
619	0.52
620	0.58
621	0.51
622	0.49
623	0.51
624	0.48
625	0.42
626	0.36
627	0.27
628	0.2
629	0.2
630	0.14
631	0.11
632	0.15
633	0.13
634	0.17
635	0.17
636	0.15
637	0.15
638	0.18
639	0.21
640	0.24
641	0.29
642	0.27
643	0.3
644	0.32
645	0.32
646	0.32
647	0.3
648	0.24
649	0.26
650	0.26
651	0.25
652	0.25
653	0.26
654	0.28
655	0.32
656	0.33
657	0.28
658	0.28
659	0.28
660	0.26
661	0.26
662	0.25
663	0.26
664	0.29
665	0.31
666	0.37
667	0.36
668	0.38
669	0.41
670	0.43
671	0.42
672	0.45
673	0.43
674	0.36
675	0.35
676	0.4
677	0.46
678	0.41
679	0.38
680	0.35
681	0.41
682	0.42
683	0.42
684	0.38
685	0.33
686	0.39
687	0.4
688	0.4
689	0.37
690	0.38
691	0.43
692	0.44
693	0.46
694	0.44
695	0.45
696	0.46
697	0.48
698	0.48
699	0.43
700	0.44
701	0.39
702	0.36
703	0.32
704	0.27
705	0.21
706	0.19
707	0.19
708	0.17
709	0.15
710	0.16
711	0.17
712	0.21
713	0.28
714	0.31
715	0.36
716	0.4
717	0.41
718	0.41
719	0.42
720	0.38
721	0.31
722	0.29
723	0.23
724	0.19
725	0.18
726	0.18
727	0.16
728	0.16
729	0.15
730	0.14
731	0.14
732	0.1
733	0.13
734	0.13
735	0.17
736	0.16
737	0.18
738	0.22
739	0.23
740	0.24
741	0.2
742	0.19
743	0.17
744	0.21
745	0.2
746	0.16
747	0.15
748	0.15
749	0.18
750	0.2
751	0.2
752	0.17
753	0.17
754	0.17
755	0.17
756	0.16
757	0.15
758	0.13
759	0.18
760	0.22
761	0.22
762	0.23
763	0.25
764	0.25
765	0.24
766	0.25
767	0.2
768	0.23
769	0.25
770	0.28
771	0.28
772	0.29
773	0.28
774	0.28
775	0.25
776	0.18
777	0.16
778	0.11
779	0.09
780	0.08
781	0.1
782	0.08
783	0.08
784	0.07
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.07
789	0.05
790	0.06
791	0.1
792	0.13
793	0.15
794	0.16
795	0.17
796	0.17
797	0.18
798	0.18
799	0.17
800	0.16
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.14
805	0.17
806	0.17
807	0.14
808	0.14
809	0.14
810	0.2
811	0.21
812	0.21
813	0.2
814	0.19
815	0.2
816	0.2
817	0.2
818	0.12
819	0.14
820	0.15
821	0.12
822	0.12
823	0.11
824	0.1
825	0.08
826	0.08
827	0.06
828	0.04
829	0.04
830	0.04
831	0.04
832	0.05
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.09
837	0.12
838	0.2
839	0.21
840	0.2
841	0.19
842	0.19
843	0.22
844	0.24
845	0.29
846	0.26
847	0.25
848	0.28
849	0.29
850	0.3
851	0.29
852	0.33
853	0.32
854	0.33
855	0.36
856	0.35
857	0.36
858	0.36
859	0.37
860	0.36
861	0.33
862	0.31
863	0.34
864	0.41
865	0.42
866	0.44
867	0.44
868	0.41
869	0.42
870	0.43
871	0.37
872	0.29
873	0.27
874	0.25
875	0.21
876	0.2
877	0.16
878	0.11
879	0.11
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.1
884	0.09
885	0.09
886	0.08
887	0.09
888	0.09
889	0.08
890	0.11
891	0.12
892	0.11
893	0.13
894	0.16
895	0.16
896	0.16
897	0.16
898	0.14
899	0.21
900	0.25
901	0.29
902	0.31
903	0.31
904	0.32
905	0.34
906	0.35
907	0.3
908	0.29
909	0.24
910	0.22
911	0.22
912	0.24
913	0.23
914	0.25
915	0.22
916	0.24
917	0.26
918	0.25
919	0.26
920	0.26
921	0.34
922	0.33
923	0.38
924	0.38
925	0.4
926	0.4
927	0.42
928	0.42
929	0.34
930	0.34
931	0.3
932	0.26
933	0.26
934	0.28
935	0.29
936	0.31
937	0.36
938	0.34
939	0.33
940	0.34
941	0.29
942	0.26
943	0.22
944	0.17
945	0.09
946	0.08
947	0.09
948	0.08
949	0.11
950	0.12
951	0.13
952	0.14
953	0.16
954	0.22
955	0.22
956	0.23
957	0.24
958	0.26
959	0.31
960	0.32
961	0.35
962	0.34
963	0.34
964	0.33
965	0.29
966	0.26
967	0.19
968	0.17
969	0.15
970	0.1
971	0.1
972	0.12
973	0.13
974	0.15
975	0.16
976	0.16
977	0.14
978	0.15
979	0.16
980	0.17
981	0.18
982	0.18
983	0.22
984	0.24
985	0.23
986	0.22
987	0.25
988	0.25
989	0.25
990	0.25
991	0.26
992	0.29
993	0.32
994	0.36
995	0.34
996	0.31
997	0.3
998	0.32
999	0.26
1000	0.2
1001	0.21
1002	0.22
1003	0.23
1004	0.29
1005	0.3
1006	0.34
1007	0.37
1008	0.39
1009	0.43
1010	0.4
1011	0.39
1012	0.39
1013	0.43
1014	0.41
1015	0.44
1016	0.45
1017	0.4
1018	0.38
1019	0.34
1020	0.3
1021	0.24
1022	0.19
1023	0.14
1024	0.12
1025	0.11
1026	0.09
1027	0.11
1028	0.1
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.11
1032	0.12
1033	0.11
1034	0.12
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.1
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.08
1043	0.08
1044	0.09
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.1
1048	0.11
1049	0.12
1050	0.13
1051	0.14
1052	0.18
1053	0.2
1054	0.27
1055	0.27
1056	0.29
1057	0.36
1058	0.41
1059	0.45
1060	0.48
1061	0.47
1062	0.41

A0A1Y2HWA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer