Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HR60

Protein Details
Accession A0A1Y2HR60    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-58HEEAAPSEKKNHNKYRRDKRTWDTDDIDHydrophilic
261-289RFLPKFRKRNVQTKKPKDAKKPKVSEEEKBasic
414-433GEEDQQPARKKAKKAKSKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-284LPKFRKRNVQTKKPKDAKKPKV
360-362KRK
421-433ARKKAKKAKSKKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MSEIDQHSRSHDKDDDNESLAGDNQGSDHDHEEAAPSEKKNHNKYRRDKRTWDTDDIDKWKIESFKPEDNPLPFLEESSFATLFPKYRETYLREVWPHVTKALESHGVKCELNLIEGSMTVATTRKTYDPYIILKARDLIKLLARSVPFPQAVKILEDGQAMDIVKIGNIVRNKQRFVKRRQRLIGPNGNTLKAIELLTGCYVLVQGNTVSVMGEHKGLKAVRRIVIDCINNIHPIYHIKELMIKRELARDPKLKEENWDRFLPKFRKRNVQTKKPKDAKKPKVSEEEKPLFPPAQLPRKIDLQLESGEYFLKPSERARREAQAKAEAAVERKQERMAERNKDFVAPEEASGDQARKELKRKRELEVHEAKKQEAGRLDELKQKFMAGKSDLHAIASAASSSSAPASAPPTGAGEEDQQPARKKAKKAKSKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.46
4 0.45
5 0.39
6 0.34
7 0.29
8 0.24
9 0.17
10 0.12
11 0.09
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.17
20 0.17
21 0.2
22 0.23
23 0.22
24 0.29
25 0.36
26 0.45
27 0.53
28 0.62
29 0.68
30 0.74
31 0.83
32 0.87
33 0.91
34 0.91
35 0.9
36 0.87
37 0.88
38 0.85
39 0.81
40 0.75
41 0.7
42 0.69
43 0.65
44 0.59
45 0.48
46 0.42
47 0.39
48 0.38
49 0.33
50 0.34
51 0.35
52 0.41
53 0.44
54 0.49
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.41
59 0.41
60 0.31
61 0.29
62 0.24
63 0.2
64 0.19
65 0.21
66 0.2
67 0.15
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.19
74 0.23
75 0.28
76 0.32
77 0.38
78 0.41
79 0.46
80 0.44
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.41
85 0.35
86 0.31
87 0.23
88 0.22
89 0.23
90 0.26
91 0.23
92 0.25
93 0.27
94 0.29
95 0.29
96 0.27
97 0.29
98 0.21
99 0.21
100 0.18
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.1
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.19
116 0.22
117 0.25
118 0.32
119 0.33
120 0.32
121 0.3
122 0.33
123 0.31
124 0.28
125 0.26
126 0.2
127 0.21
128 0.23
129 0.23
130 0.23
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.21
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.11
157 0.15
158 0.23
159 0.27
160 0.29
161 0.36
162 0.45
163 0.5
164 0.59
165 0.66
166 0.67
167 0.73
168 0.76
169 0.76
170 0.75
171 0.75
172 0.74
173 0.66
174 0.64
175 0.56
176 0.52
177 0.43
178 0.35
179 0.27
180 0.19
181 0.16
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.17
208 0.2
209 0.21
210 0.23
211 0.24
212 0.24
213 0.29
214 0.27
215 0.23
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.16
221 0.11
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.13
227 0.2
228 0.2
229 0.24
230 0.24
231 0.22
232 0.2
233 0.27
234 0.3
235 0.28
236 0.34
237 0.35
238 0.35
239 0.42
240 0.45
241 0.39
242 0.43
243 0.47
244 0.49
245 0.47
246 0.48
247 0.42
248 0.4
249 0.49
250 0.51
251 0.5
252 0.51
253 0.52
254 0.6
255 0.64
256 0.72
257 0.73
258 0.76
259 0.78
260 0.8
261 0.86
262 0.84
263 0.87
264 0.87
265 0.88
266 0.88
267 0.88
268 0.85
269 0.81
270 0.82
271 0.78
272 0.74
273 0.72
274 0.67
275 0.58
276 0.52
277 0.48
278 0.38
279 0.34
280 0.33
281 0.31
282 0.35
283 0.38
284 0.4
285 0.4
286 0.44
287 0.45
288 0.41
289 0.35
290 0.28
291 0.25
292 0.24
293 0.21
294 0.17
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.16
302 0.26
303 0.29
304 0.34
305 0.38
306 0.46
307 0.51
308 0.54
309 0.53
310 0.5
311 0.47
312 0.43
313 0.42
314 0.34
315 0.32
316 0.3
317 0.3
318 0.25
319 0.26
320 0.27
321 0.28
322 0.3
323 0.37
324 0.41
325 0.46
326 0.47
327 0.51
328 0.5
329 0.48
330 0.44
331 0.38
332 0.36
333 0.27
334 0.25
335 0.21
336 0.2
337 0.2
338 0.21
339 0.19
340 0.13
341 0.15
342 0.19
343 0.22
344 0.32
345 0.38
346 0.47
347 0.57
348 0.6
349 0.65
350 0.69
351 0.7
352 0.71
353 0.73
354 0.7
355 0.66
356 0.64
357 0.57
358 0.53
359 0.48
360 0.43
361 0.39
362 0.37
363 0.38
364 0.41
365 0.44
366 0.47
367 0.47
368 0.45
369 0.39
370 0.35
371 0.32
372 0.3
373 0.33
374 0.27
375 0.29
376 0.28
377 0.34
378 0.33
379 0.29
380 0.27
381 0.21
382 0.19
383 0.16
384 0.14
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.24
404 0.27
405 0.31
406 0.35
407 0.41
408 0.49
409 0.52
410 0.58
411 0.64
412 0.71
413 0.76