Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HQ02

Protein Details
Accession A0A1Y2HQ02    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
487-511HQGSRAHRKVVKQKRKEASREAAYWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
493-502HRKVVKQKRK
Subcellular Location(s) mito 7.5, cyto_mito 7.333, cyto 6, extr 6, cyto_nucl 5.333, nucl 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSSPPPTPPLPHLPQRPPLVAIVGTTGAGKSDLAVHLATRLGHGEIINSDTLQVYRALDIITNKMPLDDRLGVPHHLMDIRAVTESYSVKEFEADAVQLIQRLHQESKPCVLVGGTHYYLQYLLWGDELAVTSNDPQSSSDEGNPVPAPVPIPSDLNLSSLLPAQLHALLAKLDPVAAQQWHVNDTRRVRRSIERYYQRGCVPLPPPPLAASSDRGQLAQLRYPTLVIWVHTDQPVLDQRLDKRVDEMVDRGMFDELWRLRLLLAKDRQAVRVELNDVDDEGRSRGVEQAIGVKEFDEYCALVETVARDAGVNVAGALHASQDGASDLDPDPVVRAIINLATHQEQLQQILALRTASLDAMKLGTRKYARRQISWLRARLSPRIARHSDSAHMLVVDTTHIKSPDDFVASVVDKVYPIARAFVDAFTSHDPPGVEGSTWKVDPASLHPKANQLLKLDKQQHLDQEAGMMECKVCERTFRTRQEWEAHQGSRAHRKVVKQKRKEASREAAYWNSQKSGSGVDKGRDTDTGSDEERGADADRPVKMAKRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.7
3 0.66
4 0.58
5 0.52
6 0.46
7 0.37
8 0.3
9 0.24
10 0.19
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.07
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.14
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.2
52 0.21
53 0.2
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.25
58 0.28
59 0.28
60 0.27
61 0.27
62 0.23
63 0.2
64 0.19
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.18
90 0.21
91 0.23
92 0.28
93 0.28
94 0.33
95 0.33
96 0.3
97 0.26
98 0.23
99 0.22
100 0.2
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.17
108 0.15
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.19
130 0.21
131 0.21
132 0.18
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.13
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.16
170 0.19
171 0.23
172 0.3
173 0.39
174 0.41
175 0.43
176 0.44
177 0.5
178 0.55
179 0.58
180 0.61
181 0.59
182 0.61
183 0.62
184 0.62
185 0.55
186 0.5
187 0.41
188 0.37
189 0.3
190 0.31
191 0.32
192 0.28
193 0.28
194 0.26
195 0.27
196 0.23
197 0.23
198 0.2
199 0.17
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.13
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.12
221 0.15
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.26
228 0.27
229 0.24
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.2
234 0.2
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.14
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.15
249 0.16
250 0.19
251 0.22
252 0.24
253 0.28
254 0.29
255 0.31
256 0.29
257 0.29
258 0.22
259 0.2
260 0.18
261 0.14
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.14
352 0.18
353 0.23
354 0.32
355 0.4
356 0.43
357 0.45
358 0.53
359 0.57
360 0.63
361 0.66
362 0.62
363 0.56
364 0.56
365 0.56
366 0.53
367 0.51
368 0.47
369 0.44
370 0.47
371 0.47
372 0.46
373 0.46
374 0.43
375 0.38
376 0.35
377 0.31
378 0.23
379 0.2
380 0.18
381 0.14
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.17
394 0.15
395 0.18
396 0.19
397 0.18
398 0.16
399 0.13
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.13
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.13
412 0.16
413 0.17
414 0.19
415 0.17
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.19
420 0.17
421 0.13
422 0.12
423 0.16
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.22
431 0.28
432 0.28
433 0.31
434 0.33
435 0.38
436 0.41
437 0.45
438 0.41
439 0.35
440 0.39
441 0.41
442 0.48
443 0.51
444 0.51
445 0.51
446 0.51
447 0.52
448 0.48
449 0.44
450 0.35
451 0.3
452 0.26
453 0.22
454 0.19
455 0.13
456 0.1
457 0.1
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.16
462 0.21
463 0.31
464 0.41
465 0.49
466 0.55
467 0.58
468 0.64
469 0.66
470 0.66
471 0.64
472 0.61
473 0.54
474 0.51
475 0.5
476 0.51
477 0.54
478 0.51
479 0.5
480 0.47
481 0.55
482 0.61
483 0.68
484 0.72
485 0.72
486 0.8
487 0.83
488 0.89
489 0.88
490 0.87
491 0.85
492 0.82
493 0.76
494 0.72
495 0.67
496 0.63
497 0.61
498 0.54
499 0.46
500 0.39
501 0.35
502 0.3
503 0.32
504 0.29
505 0.31
506 0.34
507 0.35
508 0.39
509 0.4
510 0.41
511 0.35
512 0.34
513 0.31
514 0.3
515 0.3
516 0.28
517 0.28
518 0.26
519 0.25
520 0.23
521 0.2
522 0.18
523 0.17
524 0.19
525 0.22
526 0.23
527 0.25
528 0.28