FuNGI

A0A1Y2HJT4

Protein Details

Accession

A0A1Y2HJT4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-85	ADVAKRIEKSRNRFKLRAKLAGA	Hydrophilic
287-313	ADEITIKKSKKKKKSKLRSRTPTHDDD	Basic
584-615	KELSHKFHGRRPGKNKMEKMMRKEEEKRRQMN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
293-306	KKSKKKKKSKLRSR
356-362	RKAVKRR
588-612	HKFHGRRPGKNKMEKMMRKEEEKRR
671-675	NKRAR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MDHLEHDGAQAQVEISLSVEETNALRAKLGLKPLRLAPSDTDTQAQSNFALHQAAQQSKRDAADVAKRIEKSRNRFKLRAKLAGATLADAQDGDDSAAAWAKRQKQKAAAAAKLVTSQYEDEEPTSSRNEYAAKDLSGLAVAHDLNQEMVEGAELVLTLKDKDVLDDDEADELENSALRDKDRLRQTLENRSRKTPYGASLDDDEQVTMGGGNAAGKFKKRSVLAHYDEVIDEGKRGKGKYVLGEDGVKRLAADEDNEEVSPEDLLRAKAMSLDYEKQREVQDFKSADEITIKKSKKKKKSKLRSRTPTHDDDNDADAMQLDSPVTNRDRDPDSFAAADMFVDDDDLQSVLAAARRKAVKRRAAAAPPTLDQVARDLAEHEAAVKSEPGATDQDQDQEGGLVFDETSEFARVLDTEGILAAAAVKSEPGVADIKLEPTHQVGSEDEDEDEDDMDMDMDMDVDMNPDQDVDSDSESSPSHPSSSHNPLADEPALDTMGLGSALEFFRLRGALDAPDHDRLQREHEYKAREAWDATNASAPSGAGKAALKRRAETQIERLKDYKPDVRIEYHDAQGRQLSTKGAFKELSHKFHGRRPGKNKMEKMMRKEEEKRRQMNMASGDKASELASAMMERQKLLGTAGIQLTEGNRPVSAGPTLASASAAAAGAPPKSNKRARHP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.07
3	0.07
4	0.07
5	0.07
6	0.07
7	0.08
8	0.08
9	0.13
10	0.15
11	0.14
12	0.14
13	0.16
14	0.19
15	0.22
16	0.32
17	0.33
18	0.33
19	0.37
20	0.42
21	0.48
22	0.47
23	0.46
24	0.4
25	0.4
26	0.41
27	0.39
28	0.36
29	0.3
30	0.3
31	0.28
32	0.25
33	0.19
34	0.17
35	0.16
36	0.15
37	0.15
38	0.13
39	0.17
40	0.23
41	0.29
42	0.32
43	0.35
44	0.37
45	0.39
46	0.4
47	0.36
48	0.32
49	0.31
50	0.36
51	0.38
52	0.39
53	0.42
54	0.43
55	0.45
56	0.53
57	0.56
58	0.56
59	0.61
60	0.67
61	0.7
62	0.76
63	0.82
64	0.83
65	0.82
66	0.81
67	0.74
68	0.67
69	0.6
70	0.58
71	0.48
72	0.39
73	0.33
74	0.24
75	0.2
76	0.15
77	0.14
78	0.09
79	0.09
80	0.07
81	0.05
82	0.05
83	0.06
84	0.1
85	0.09
86	0.12
87	0.18
88	0.27
89	0.35
90	0.41
91	0.46
92	0.51
93	0.58
94	0.64
95	0.67
96	0.61
97	0.58
98	0.53
99	0.48
100	0.43
101	0.35
102	0.27
103	0.21
104	0.18
105	0.15
106	0.16
107	0.16
108	0.14
109	0.16
110	0.17
111	0.17
112	0.19
113	0.17
114	0.16
115	0.17
116	0.19
117	0.18
118	0.23
119	0.23
120	0.21
121	0.21
122	0.21
123	0.19
124	0.17
125	0.16
126	0.11
127	0.1
128	0.1
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.06
136	0.06
137	0.05
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.12
151	0.14
152	0.15
153	0.17
154	0.17
155	0.15
156	0.15
157	0.14
158	0.11
159	0.09
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.08
164	0.09
165	0.1
166	0.15
167	0.16
168	0.25
169	0.31
170	0.35
171	0.39
172	0.46
173	0.52
174	0.58
175	0.66
176	0.68
177	0.64
178	0.66
179	0.64
180	0.58
181	0.57
182	0.49
183	0.44
184	0.41
185	0.38
186	0.35
187	0.34
188	0.33
189	0.29
190	0.25
191	0.2
192	0.13
193	0.11
194	0.09
195	0.06
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.05
200	0.05
201	0.08
202	0.08
203	0.11
204	0.13
205	0.15
206	0.2
207	0.21
208	0.25
209	0.3
210	0.39
211	0.41
212	0.43
213	0.42
214	0.38
215	0.36
216	0.33
217	0.26
218	0.16
219	0.13
220	0.1
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.15
225	0.18
226	0.2
227	0.25
228	0.28
229	0.27
230	0.26
231	0.3
232	0.28
233	0.26
234	0.24
235	0.18
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.07
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.12
260	0.16
261	0.19
262	0.21
263	0.22
264	0.22
265	0.24
266	0.25
267	0.25
268	0.22
269	0.27
270	0.24
271	0.25
272	0.27
273	0.25
274	0.22
275	0.23
276	0.22
277	0.19
278	0.27
279	0.28
280	0.3
281	0.39
282	0.49
283	0.55
284	0.66
285	0.72
286	0.76
287	0.86
288	0.9
289	0.92
290	0.94
291	0.94
292	0.91
293	0.89
294	0.84
295	0.78
296	0.71
297	0.62
298	0.53
299	0.45
300	0.39
301	0.3
302	0.23
303	0.17
304	0.13
305	0.11
306	0.08
307	0.06
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.12
316	0.16
317	0.17
318	0.22
319	0.2
320	0.21
321	0.19
322	0.19
323	0.16
324	0.13
325	0.12
326	0.06
327	0.05
328	0.03
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.06
339	0.08
340	0.08
341	0.12
342	0.15
343	0.18
344	0.26
345	0.33
346	0.38
347	0.4
348	0.45
349	0.48
350	0.5
351	0.5
352	0.46
353	0.4
354	0.33
355	0.31
356	0.27
357	0.2
358	0.15
359	0.13
360	0.11
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.12
380	0.14
381	0.13
382	0.13
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.08
419	0.09
420	0.11
421	0.12
422	0.12
423	0.11
424	0.12
425	0.13
426	0.11
427	0.12
428	0.1
429	0.13
430	0.15
431	0.14
432	0.13
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.11
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.03
446	0.04
447	0.03
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.07
456	0.07
457	0.09
458	0.1
459	0.1
460	0.12
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.15
468	0.2
469	0.28
470	0.32
471	0.31
472	0.31
473	0.31
474	0.35
475	0.32
476	0.25
477	0.18
478	0.15
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.06
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.03
487	0.05
488	0.05
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.09
497	0.11
498	0.12
499	0.16
500	0.18
501	0.22
502	0.22
503	0.22
504	0.23
505	0.22
506	0.27
507	0.33
508	0.32
509	0.34
510	0.39
511	0.43
512	0.42
513	0.46
514	0.42
515	0.35
516	0.34
517	0.3
518	0.31
519	0.27
520	0.25
521	0.25
522	0.22
523	0.21
524	0.19
525	0.17
526	0.13
527	0.12
528	0.11
529	0.08
530	0.1
531	0.16
532	0.23
533	0.3
534	0.3
535	0.31
536	0.37
537	0.43
538	0.48
539	0.47
540	0.49
541	0.52
542	0.53
543	0.55
544	0.52
545	0.46
546	0.46
547	0.47
548	0.43
549	0.39
550	0.42
551	0.42
552	0.44
553	0.46
554	0.49
555	0.46
556	0.45
557	0.45
558	0.4
559	0.38
560	0.38
561	0.35
562	0.29
563	0.26
564	0.24
565	0.22
566	0.27
567	0.27
568	0.27
569	0.27
570	0.26
571	0.35
572	0.39
573	0.42
574	0.44
575	0.49
576	0.48
577	0.53
578	0.63
579	0.61
580	0.64
581	0.67
582	0.71
583	0.74
584	0.81
585	0.81
586	0.8
587	0.83
588	0.81
589	0.81
590	0.81
591	0.75
592	0.74
593	0.78
594	0.79
595	0.79
596	0.81
597	0.79
598	0.73
599	0.74
600	0.68
601	0.66
602	0.63
603	0.59
604	0.52
605	0.46
606	0.41
607	0.35
608	0.33
609	0.26
610	0.17
611	0.11
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.12
616	0.15
617	0.15
618	0.15
619	0.15
620	0.15
621	0.15
622	0.15
623	0.16
624	0.13
625	0.17
626	0.18
627	0.17
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.19
632	0.2
633	0.16
634	0.15
635	0.16
636	0.16
637	0.18
638	0.18
639	0.14
640	0.13
641	0.14
642	0.15
643	0.14
644	0.13
645	0.1
646	0.09
647	0.1
648	0.09
649	0.07
650	0.08
651	0.09
652	0.11
653	0.14
654	0.19
655	0.25
656	0.34
657	0.42

A0A1Y2HJT4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer