Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YSW8

Protein Details
Accession A0A1Y1YSW8    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-36LTPPEVSNKELKKKKKKSRSKDKEDEAVNGHydrophilic
63-87TLPEPPSKKEARRAKKAKTKPSADGHydrophilic
306-336SSGDEDTKKPKKDKKPRKWYINKLRGRELRCBasic
342-361STVRYNKRYGKEKEKEKGPABasic
376-401DGGNRGPRPKREPRAKVDPRSIRPGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-28ELKKKKKKSRSKD
68-83PSKKEARRAKKAKTKP
313-329KKPKKDKKPRKWYINKL
352-359KEKEKEKG
377-400GGNRGPRPKREPRAKVDPRSIRPG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASTTVLTPPEVSNKELKKKKKKSRSKDKEDEAVNGEEVPDETRVAKKRKREVLPEELEIDVTLPEPPSKKEARRAKKAKTKPSADGADGDAEAKTAVGSADDKQAGKRSDFGVWIGNLPWSATKETLRTFITENSDITNEQITRVNMPAPREAPNPRWTTKPLNKGFAYVDFSTELAMYSAIALTETKMDGRPLLIKNANSFEGRPEKPATEQEGADGKAVKPGHPPNKRVFVGNLAFDVTKEDLQEHFGQCGEILDIHMATFEDSGKCKGYAWITFADAEIATWAVKGFVFKAETKIKKADSDSSGDEDTKKPKKDKKPRKWYINKLRGRELRCEFAEDSTVRYNKRYGKEKEKEKGPAIEGVHPDRQRHFDGDGGNRGPRPKREPRAKVDPRSIRPGAAHTSAPRASQAIVEAKGKKTTFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.52
3 0.58
4 0.67
5 0.7
6 0.79
7 0.87
8 0.89
9 0.92
10 0.93
11 0.96
12 0.96
13 0.96
14 0.96
15 0.93
16 0.9
17 0.82
18 0.76
19 0.69
20 0.6
21 0.49
22 0.39
23 0.3
24 0.22
25 0.19
26 0.15
27 0.12
28 0.1
29 0.11
30 0.18
31 0.26
32 0.35
33 0.41
34 0.48
35 0.58
36 0.67
37 0.73
38 0.77
39 0.77
40 0.78
41 0.78
42 0.72
43 0.64
44 0.54
45 0.46
46 0.35
47 0.27
48 0.17
49 0.11
50 0.09
51 0.08
52 0.11
53 0.13
54 0.15
55 0.21
56 0.28
57 0.34
58 0.43
59 0.53
60 0.6
61 0.69
62 0.77
63 0.81
64 0.84
65 0.88
66 0.89
67 0.88
68 0.84
69 0.79
70 0.78
71 0.72
72 0.63
73 0.55
74 0.46
75 0.37
76 0.31
77 0.25
78 0.16
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.06
87 0.08
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.25
93 0.26
94 0.25
95 0.27
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.25
100 0.22
101 0.2
102 0.2
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.19
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.21
118 0.23
119 0.27
120 0.25
121 0.24
122 0.21
123 0.22
124 0.2
125 0.19
126 0.19
127 0.13
128 0.13
129 0.17
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.18
135 0.2
136 0.23
137 0.21
138 0.24
139 0.26
140 0.3
141 0.31
142 0.37
143 0.4
144 0.37
145 0.39
146 0.4
147 0.46
148 0.5
149 0.55
150 0.52
151 0.53
152 0.52
153 0.51
154 0.48
155 0.41
156 0.38
157 0.28
158 0.25
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.11
164 0.06
165 0.06
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.13
181 0.13
182 0.18
183 0.2
184 0.2
185 0.22
186 0.24
187 0.25
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.23
192 0.22
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.23
197 0.26
198 0.27
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.18
206 0.13
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.17
211 0.25
212 0.34
213 0.39
214 0.43
215 0.44
216 0.52
217 0.52
218 0.48
219 0.41
220 0.38
221 0.34
222 0.3
223 0.26
224 0.18
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.12
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.09
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.19
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.16
267 0.12
268 0.1
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.08
279 0.11
280 0.12
281 0.19
282 0.27
283 0.3
284 0.34
285 0.38
286 0.37
287 0.38
288 0.41
289 0.41
290 0.35
291 0.36
292 0.35
293 0.33
294 0.33
295 0.3
296 0.29
297 0.26
298 0.31
299 0.35
300 0.39
301 0.44
302 0.52
303 0.62
304 0.72
305 0.8
306 0.82
307 0.86
308 0.91
309 0.94
310 0.95
311 0.95
312 0.95
313 0.94
314 0.9
315 0.85
316 0.84
317 0.8
318 0.73
319 0.71
320 0.64
321 0.61
322 0.54
323 0.53
324 0.44
325 0.38
326 0.4
327 0.31
328 0.3
329 0.31
330 0.33
331 0.29
332 0.3
333 0.35
334 0.37
335 0.45
336 0.51
337 0.53
338 0.6
339 0.69
340 0.77
341 0.8
342 0.8
343 0.8
344 0.75
345 0.73
346 0.63
347 0.6
348 0.53
349 0.5
350 0.47
351 0.45
352 0.47
353 0.44
354 0.45
355 0.42
356 0.45
357 0.42
358 0.4
359 0.37
360 0.33
361 0.37
362 0.4
363 0.44
364 0.42
365 0.42
366 0.41
367 0.46
368 0.48
369 0.49
370 0.52
371 0.55
372 0.63
373 0.7
374 0.77
375 0.8
376 0.85
377 0.87
378 0.88
379 0.88
380 0.87
381 0.82
382 0.82
383 0.74
384 0.66
385 0.58
386 0.54
387 0.49
388 0.42
389 0.4
390 0.33
391 0.39
392 0.38
393 0.37
394 0.33
395 0.28
396 0.25
397 0.23
398 0.25
399 0.24
400 0.25
401 0.31
402 0.34
403 0.36
404 0.42