Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2A0C8

Protein Details
Accession A0A1Y2A0C8    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-90DIPNWDRKPHQPRNPENWSKVHydrophilic
289-309AAPQKRKREEANPFMPKKRKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-309QKRKREEANPFMPKKRKV
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVPSLYEIARKRIITNISLLTDIGDLPYSFLAPVLKHIQNPSQLLELETTCPQLLGETGEIWLRFIKRDIPNWDRKPHQPRNPENWSKVYRKLKRDAEREQEEQEEALREQMRALQKDRSENKTTIVNASVNYNPAVRRRGAGGSSSWGTSTGPPPPPKTGKAVLDKLKRGMFDQKMARPKATHIPAHLLEERRGKVAQAPERLLRLNEGEPKSASMNVPRRSSQSVLGLRNPHPVVQRRAQTSPQPQPQPSSSSSSATPQTKLVRTSLPADKHFSAPKLHAPSTTGAAPQKRKREEANPFMPKKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.35
3 0.38
4 0.36
5 0.32
6 0.31
7 0.3
8 0.24
9 0.2
10 0.18
11 0.13
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.14
22 0.2
23 0.22
24 0.25
25 0.29
26 0.33
27 0.37
28 0.39
29 0.36
30 0.32
31 0.3
32 0.29
33 0.27
34 0.23
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.22
55 0.25
56 0.33
57 0.41
58 0.47
59 0.56
60 0.62
61 0.67
62 0.64
63 0.68
64 0.71
65 0.73
66 0.74
67 0.73
68 0.76
69 0.79
70 0.84
71 0.82
72 0.76
73 0.73
74 0.7
75 0.64
76 0.65
77 0.66
78 0.64
79 0.63
80 0.68
81 0.7
82 0.73
83 0.77
84 0.76
85 0.75
86 0.73
87 0.69
88 0.62
89 0.54
90 0.45
91 0.37
92 0.29
93 0.21
94 0.15
95 0.16
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.26
104 0.27
105 0.37
106 0.42
107 0.44
108 0.44
109 0.41
110 0.41
111 0.4
112 0.38
113 0.31
114 0.27
115 0.21
116 0.17
117 0.19
118 0.18
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.18
142 0.2
143 0.22
144 0.27
145 0.3
146 0.3
147 0.33
148 0.33
149 0.33
150 0.37
151 0.42
152 0.44
153 0.47
154 0.47
155 0.46
156 0.43
157 0.38
158 0.33
159 0.35
160 0.29
161 0.3
162 0.34
163 0.37
164 0.43
165 0.44
166 0.43
167 0.36
168 0.37
169 0.39
170 0.39
171 0.35
172 0.28
173 0.32
174 0.32
175 0.36
176 0.37
177 0.3
178 0.28
179 0.32
180 0.31
181 0.28
182 0.27
183 0.23
184 0.23
185 0.29
186 0.32
187 0.32
188 0.34
189 0.34
190 0.36
191 0.36
192 0.32
193 0.26
194 0.22
195 0.21
196 0.26
197 0.25
198 0.25
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.24
203 0.22
204 0.23
205 0.3
206 0.34
207 0.37
208 0.37
209 0.39
210 0.42
211 0.43
212 0.37
213 0.37
214 0.39
215 0.39
216 0.42
217 0.44
218 0.41
219 0.47
220 0.44
221 0.38
222 0.38
223 0.42
224 0.43
225 0.45
226 0.5
227 0.48
228 0.52
229 0.53
230 0.55
231 0.57
232 0.61
233 0.62
234 0.63
235 0.59
236 0.6
237 0.58
238 0.55
239 0.48
240 0.46
241 0.39
242 0.34
243 0.34
244 0.33
245 0.37
246 0.35
247 0.33
248 0.31
249 0.35
250 0.37
251 0.38
252 0.36
253 0.33
254 0.33
255 0.38
256 0.41
257 0.41
258 0.41
259 0.45
260 0.44
261 0.45
262 0.47
263 0.43
264 0.4
265 0.37
266 0.43
267 0.44
268 0.43
269 0.39
270 0.37
271 0.37
272 0.37
273 0.35
274 0.31
275 0.29
276 0.36
277 0.45
278 0.5
279 0.58
280 0.6
281 0.64
282 0.67
283 0.71
284 0.73
285 0.74
286 0.77
287 0.77
288 0.78
289 0.82