FuNGI

A0A1Y2ABB1

Protein Details

Accession

A0A1Y2ABB1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
99-118	AQRAQDKKPKGPPEPPKFRF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
106-110	KPKGP

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045146 SF3A1 IPR022030 SF3A1_dom IPR000061 Surp IPR035967 SWAP/Surp_sf
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF12230 PRP21_like_P PF01805 Surp
PROSITE	View protein in PROSITE PS50128 SURP

Amino Acid Sequences

MATTASSGADASNGDGDLTAKPPADVVIPPKQVRDDIARTAEFVHRRGEGTEHHLRERSGHLQKFAFLNKEDAYNPYYVWYLSELHQGRGPTAGDGNAAQRAQDKKPKGPPEPPKFRFSARMPNISAKDLEILRLTAAYTARNGESWLKELRGRESANFQFDFLRPNHSFFQFFRSLVDQYKILLEDEETVQARLDELTLNIQNRFHVLDRAKARAEYVKYQAQQKQQEEKKVEDERKEYASIDWHDFSIIATVTFDELDDQAELPPPTSLNDLQSASLEQKAMVSLSAGRLEEAAPDDETYYNVSQQVPYAPPPMAPPAQAPMPFSMAPPAQPAYQPQPPAVQDYRTPAHIAREEEEERNIRERQAERERAAQAQAAAKGAGGPMRIRTDYVPRAGVKKQNVPMALCPNCKQQFPANELEDHIRIELLDPRWKEQRSKMESRYSSSNLSTVDVANNLKRFASQRDDVFDGVSGMPISDEEQARRKKAAMSYDGQPDPTKDAVRLQEMQSMNLQDQLKRISEKHGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.1
4	0.11
5	0.12
6	0.13
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.16
13	0.2
14	0.27
15	0.35
16	0.36
17	0.39
18	0.4
19	0.39
20	0.4
21	0.42
22	0.38
23	0.37
24	0.42
25	0.39
26	0.38
27	0.4
28	0.43
29	0.38
30	0.34
31	0.31
32	0.27
33	0.28
34	0.29
35	0.29
36	0.26
37	0.3
38	0.38
39	0.38
40	0.41
41	0.42
42	0.41
43	0.41
44	0.43
45	0.45
46	0.45
47	0.45
48	0.46
49	0.44
50	0.47
51	0.49
52	0.47
53	0.42
54	0.34
55	0.35
56	0.31
57	0.33
58	0.31
59	0.29
60	0.26
61	0.23
62	0.21
63	0.18
64	0.18
65	0.15
66	0.15
67	0.14
68	0.13
69	0.14
70	0.23
71	0.23
72	0.24
73	0.26
74	0.26
75	0.24
76	0.25
77	0.24
78	0.16
79	0.16
80	0.15
81	0.13
82	0.14
83	0.15
84	0.16
85	0.15
86	0.14
87	0.18
88	0.23
89	0.28
90	0.35
91	0.39
92	0.43
93	0.53
94	0.62
95	0.64
96	0.69
97	0.74
98	0.76
99	0.82
100	0.78
101	0.74
102	0.68
103	0.64
104	0.62
105	0.56
106	0.56
107	0.51
108	0.54
109	0.52
110	0.57
111	0.56
112	0.49
113	0.45
114	0.34
115	0.32
116	0.25
117	0.23
118	0.16
119	0.14
120	0.13
121	0.12
122	0.12
123	0.1
124	0.11
125	0.1
126	0.1
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.14
131	0.16
132	0.16
133	0.19
134	0.2
135	0.2
136	0.22
137	0.24
138	0.26
139	0.28
140	0.28
141	0.27
142	0.33
143	0.35
144	0.37
145	0.35
146	0.32
147	0.28
148	0.27
149	0.3
150	0.23
151	0.27
152	0.23
153	0.26
154	0.29
155	0.28
156	0.31
157	0.27
158	0.33
159	0.28
160	0.27
161	0.25
162	0.24
163	0.24
164	0.24
165	0.25
166	0.18
167	0.16
168	0.17
169	0.16
170	0.13
171	0.11
172	0.09
173	0.09
174	0.1
175	0.12
176	0.11
177	0.11
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.08
182	0.08
183	0.05
184	0.05
185	0.09
186	0.11
187	0.13
188	0.14
189	0.14
190	0.13
191	0.14
192	0.16
193	0.13
194	0.17
195	0.17
196	0.23
197	0.26
198	0.29
199	0.29
200	0.27
201	0.28
202	0.27
203	0.29
204	0.26
205	0.27
206	0.3
207	0.31
208	0.37
209	0.41
210	0.43
211	0.48
212	0.49
213	0.54
214	0.53
215	0.58
216	0.54
217	0.51
218	0.51
219	0.51
220	0.51
221	0.45
222	0.43
223	0.39
224	0.38
225	0.37
226	0.3
227	0.23
228	0.23
229	0.21
230	0.21
231	0.19
232	0.16
233	0.16
234	0.15
235	0.14
236	0.1
237	0.08
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.1
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.13
296	0.11
297	0.13
298	0.14
299	0.13
300	0.13
301	0.14
302	0.17
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.14
311	0.17
312	0.16
313	0.16
314	0.17
315	0.14
316	0.14
317	0.15
318	0.15
319	0.12
320	0.13
321	0.16
322	0.18
323	0.22
324	0.23
325	0.21
326	0.24
327	0.24
328	0.3
329	0.28
330	0.25
331	0.23
332	0.27
333	0.27
334	0.24
335	0.25
336	0.2
337	0.24
338	0.26
339	0.26
340	0.22
341	0.27
342	0.29
343	0.28
344	0.31
345	0.28
346	0.26
347	0.29
348	0.28
349	0.23
350	0.27
351	0.28
352	0.34
353	0.41
354	0.46
355	0.43
356	0.49
357	0.49
358	0.45
359	0.44
360	0.36
361	0.28
362	0.25
363	0.24
364	0.18
365	0.16
366	0.14
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.09
371	0.08
372	0.11
373	0.15
374	0.15
375	0.16
376	0.18
377	0.25
378	0.28
379	0.3
380	0.31
381	0.3
382	0.33
383	0.37
384	0.42
385	0.4
386	0.44
387	0.46
388	0.46
389	0.47
390	0.45
391	0.45
392	0.48
393	0.48
394	0.43
395	0.41
396	0.45
397	0.45
398	0.44
399	0.42
400	0.4
401	0.4
402	0.42
403	0.48
404	0.4
405	0.39
406	0.4
407	0.41
408	0.34
409	0.28
410	0.23
411	0.15
412	0.13
413	0.13
414	0.18
415	0.18
416	0.24
417	0.24
418	0.28
419	0.36
420	0.39
421	0.43
422	0.46
423	0.53
424	0.55
425	0.63
426	0.66
427	0.68
428	0.69
429	0.68
430	0.66
431	0.59
432	0.54
433	0.46
434	0.42
435	0.32
436	0.31
437	0.27
438	0.21
439	0.19
440	0.18
441	0.2
442	0.22
443	0.23
444	0.22
445	0.21
446	0.22
447	0.24
448	0.27
449	0.32
450	0.32
451	0.34
452	0.39
453	0.41
454	0.39
455	0.37
456	0.31
457	0.25
458	0.2
459	0.17
460	0.12
461	0.09
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.12
466	0.14
467	0.17
468	0.26
469	0.33
470	0.36
471	0.38
472	0.39
473	0.4
474	0.43
475	0.49
476	0.47
477	0.45
478	0.48
479	0.54
480	0.54
481	0.5
482	0.46
483	0.39
484	0.37
485	0.36
486	0.32
487	0.25
488	0.3
489	0.33
490	0.37
491	0.4
492	0.37
493	0.41
494	0.39
495	0.4
496	0.38
497	0.35
498	0.3
499	0.32
500	0.32
501	0.26
502	0.29
503	0.32
504	0.32
505	0.34
506	0.35
507	0.38

A0A1Y2ABB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer