Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZJJ6

Protein Details
Accession A0A1Y1ZJJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-307DILPPRRKKRPSKATGVAKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-219KARDRRRKTMGFEQREKRKSDA
291-300PPRRKKRPSK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.333, cyto 10, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR018996  MSC  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MADRDEYWYLDDSVDVSRITVPELRSILLKHGVTYPSSAKKPVLVALFNDRVLPQAAKIHRATARTKPSARGIVDVPSSQESTTTDDVEDETLLAPPPSARRTSRRTARASTEELRAEPAPGRRGNSAARHVPTKHARGSDAEVEEQPPVRRTRKSVTPAVKEDSPDPEAWHRHDAESPFTQENPFQGGSSPPAPDSKARDRRRKTMGFEQREKRKSDAYRRKSAMPNVEQLDEGIVVPTRRTFDMPASRVKKEESEFETDGVEAGEEFTPEEQMELVRENAVAGKADILPPRRKKRPSKATGVAKGLTLAVATTLLAAFGGAWSQEKFAVGYCGIGRESTSLGGIEVPDWADFLLPQCEQCPAHATCYPHLDLDCDDDFIKKPHPLSLGGALPLSATCEPDSEKTRRITLVADKSVQILRERRARYECGEPGPDGQVFESPEVKETELKEELSSMRRKGMSQEEFEDLWRSALGEITTREEIVEGSDGFIAAATESQADSTEPLLQTRSQSSVSSAASSAPSDKRLDDIFGSLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.16
7 0.19
8 0.18
9 0.22
10 0.24
11 0.24
12 0.24
13 0.25
14 0.27
15 0.3
16 0.29
17 0.25
18 0.29
19 0.3
20 0.29
21 0.32
22 0.34
23 0.34
24 0.37
25 0.38
26 0.34
27 0.35
28 0.36
29 0.38
30 0.36
31 0.3
32 0.3
33 0.36
34 0.39
35 0.36
36 0.34
37 0.29
38 0.26
39 0.26
40 0.23
41 0.17
42 0.22
43 0.24
44 0.29
45 0.3
46 0.35
47 0.36
48 0.4
49 0.43
50 0.45
51 0.52
52 0.54
53 0.57
54 0.55
55 0.59
56 0.62
57 0.58
58 0.52
59 0.44
60 0.4
61 0.39
62 0.35
63 0.3
64 0.25
65 0.25
66 0.21
67 0.21
68 0.17
69 0.2
70 0.21
71 0.19
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.15
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.13
85 0.16
86 0.21
87 0.25
88 0.32
89 0.4
90 0.5
91 0.58
92 0.62
93 0.65
94 0.66
95 0.69
96 0.68
97 0.67
98 0.61
99 0.57
100 0.5
101 0.44
102 0.41
103 0.34
104 0.29
105 0.26
106 0.27
107 0.28
108 0.28
109 0.31
110 0.28
111 0.31
112 0.36
113 0.38
114 0.4
115 0.4
116 0.41
117 0.43
118 0.43
119 0.48
120 0.5
121 0.5
122 0.48
123 0.43
124 0.42
125 0.39
126 0.43
127 0.41
128 0.36
129 0.32
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.26
134 0.22
135 0.2
136 0.24
137 0.26
138 0.29
139 0.33
140 0.38
141 0.45
142 0.5
143 0.55
144 0.59
145 0.61
146 0.63
147 0.62
148 0.57
149 0.49
150 0.45
151 0.4
152 0.34
153 0.27
154 0.25
155 0.26
156 0.27
157 0.29
158 0.33
159 0.29
160 0.28
161 0.31
162 0.3
163 0.29
164 0.29
165 0.29
166 0.25
167 0.25
168 0.24
169 0.21
170 0.21
171 0.2
172 0.17
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.18
183 0.24
184 0.31
185 0.4
186 0.49
187 0.58
188 0.62
189 0.69
190 0.75
191 0.74
192 0.7
193 0.71
194 0.72
195 0.71
196 0.74
197 0.75
198 0.76
199 0.74
200 0.71
201 0.62
202 0.59
203 0.58
204 0.61
205 0.63
206 0.61
207 0.65
208 0.65
209 0.69
210 0.67
211 0.64
212 0.62
213 0.54
214 0.52
215 0.44
216 0.42
217 0.36
218 0.3
219 0.25
220 0.16
221 0.13
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.16
232 0.24
233 0.26
234 0.34
235 0.37
236 0.37
237 0.37
238 0.36
239 0.34
240 0.27
241 0.31
242 0.26
243 0.28
244 0.28
245 0.27
246 0.27
247 0.23
248 0.21
249 0.15
250 0.11
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.09
275 0.12
276 0.16
277 0.24
278 0.33
279 0.41
280 0.48
281 0.57
282 0.64
283 0.72
284 0.79
285 0.78
286 0.79
287 0.8
288 0.8
289 0.78
290 0.71
291 0.61
292 0.49
293 0.43
294 0.33
295 0.23
296 0.14
297 0.08
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.02
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.18
350 0.16
351 0.2
352 0.23
353 0.25
354 0.24
355 0.28
356 0.28
357 0.24
358 0.23
359 0.2
360 0.18
361 0.2
362 0.18
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.17
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.2
372 0.22
373 0.22
374 0.24
375 0.27
376 0.25
377 0.23
378 0.22
379 0.18
380 0.15
381 0.13
382 0.14
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.16
389 0.22
390 0.23
391 0.29
392 0.3
393 0.33
394 0.33
395 0.32
396 0.32
397 0.35
398 0.4
399 0.39
400 0.38
401 0.35
402 0.36
403 0.37
404 0.35
405 0.31
406 0.27
407 0.29
408 0.37
409 0.39
410 0.42
411 0.46
412 0.48
413 0.46
414 0.5
415 0.48
416 0.45
417 0.45
418 0.4
419 0.37
420 0.36
421 0.33
422 0.25
423 0.21
424 0.18
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.16
429 0.18
430 0.19
431 0.2
432 0.21
433 0.21
434 0.25
435 0.24
436 0.25
437 0.23
438 0.23
439 0.25
440 0.29
441 0.33
442 0.28
443 0.32
444 0.33
445 0.33
446 0.37
447 0.44
448 0.43
449 0.42
450 0.44
451 0.42
452 0.42
453 0.42
454 0.39
455 0.29
456 0.23
457 0.18
458 0.15
459 0.11
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.19
465 0.2
466 0.19
467 0.19
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.15
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.08
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.14
490 0.14
491 0.16
492 0.18
493 0.19
494 0.22
495 0.24
496 0.26
497 0.23
498 0.23
499 0.25
500 0.28
501 0.28
502 0.26
503 0.23
504 0.22
505 0.21
506 0.22
507 0.24
508 0.22
509 0.24
510 0.24
511 0.25
512 0.27
513 0.27
514 0.29
515 0.25