Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YKQ6

Protein Details
Accession A0A1Y1YKQ6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35QAPAPRASAPPKKKTKPGHSDSNLQLHydrophilic
348-383EGGEVATKKHKKHRTPEEKKSRKERKRSKGSAKEKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-26PAPRASAPPKKKTKP
354-383TKKHKKHRTPEEKKSRKERKRSKGSAKEKQ
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MKKPRRSDVQAPAPRASAPPKKKTKPGHSDSNLQLSTEFVQVSDDSGTEAMPRPKPSAKPTTQKTPVTIGVHRPGANGALKKAPTTSTVPPASASSSSSSDASHVSSSDSSSKDSDDEEAPAALQPSAEKQPTAPQSHAVEFRPALPYVPPKGFTAVPPPTNTSSRALRMFENLQGKQIWHITAPADVSMSELKEVALDIASKGEAILRQKGADYGFAPGGVDEEATRRVLIPGAAGYKAVSTPITQTLHLQQLPRLPELARRQADINTGSAAAASITASTTRAPRPQVKGLRMRFFPSGFGDQDPGIIGSSDSEGEAPSTVGHGVPSGVHAAQRPEKRKHDQVNGAEGGEVATKKHKKHRTPEEKKSRKERKRSKGSAKEKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.49
3 0.48
4 0.47
5 0.48
6 0.53
7 0.62
8 0.68
9 0.76
10 0.83
11 0.85
12 0.85
13 0.84
14 0.84
15 0.79
16 0.8
17 0.76
18 0.75
19 0.64
20 0.53
21 0.46
22 0.36
23 0.33
24 0.26
25 0.21
26 0.11
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.13
31 0.11
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.15
37 0.2
38 0.24
39 0.27
40 0.31
41 0.37
42 0.43
43 0.49
44 0.54
45 0.56
46 0.62
47 0.66
48 0.71
49 0.74
50 0.71
51 0.66
52 0.61
53 0.59
54 0.54
55 0.51
56 0.47
57 0.45
58 0.46
59 0.43
60 0.38
61 0.32
62 0.31
63 0.33
64 0.28
65 0.24
66 0.25
67 0.25
68 0.26
69 0.26
70 0.23
71 0.22
72 0.25
73 0.27
74 0.29
75 0.3
76 0.3
77 0.3
78 0.29
79 0.28
80 0.24
81 0.21
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.13
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.2
119 0.27
120 0.3
121 0.27
122 0.28
123 0.3
124 0.33
125 0.36
126 0.3
127 0.26
128 0.23
129 0.24
130 0.22
131 0.19
132 0.17
133 0.15
134 0.19
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.22
140 0.22
141 0.21
142 0.24
143 0.25
144 0.25
145 0.25
146 0.28
147 0.28
148 0.3
149 0.31
150 0.26
151 0.24
152 0.26
153 0.27
154 0.25
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.25
161 0.24
162 0.23
163 0.23
164 0.21
165 0.21
166 0.16
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.08
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.24
237 0.26
238 0.24
239 0.21
240 0.24
241 0.27
242 0.26
243 0.23
244 0.19
245 0.24
246 0.3
247 0.38
248 0.34
249 0.33
250 0.34
251 0.34
252 0.38
253 0.32
254 0.26
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.11
260 0.07
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.1
269 0.13
270 0.18
271 0.23
272 0.3
273 0.36
274 0.46
275 0.53
276 0.57
277 0.63
278 0.67
279 0.69
280 0.64
281 0.61
282 0.56
283 0.48
284 0.43
285 0.38
286 0.35
287 0.29
288 0.28
289 0.26
290 0.22
291 0.22
292 0.2
293 0.15
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.13
319 0.19
320 0.26
321 0.35
322 0.42
323 0.48
324 0.57
325 0.64
326 0.72
327 0.75
328 0.78
329 0.79
330 0.77
331 0.77
332 0.7
333 0.61
334 0.51
335 0.42
336 0.32
337 0.26
338 0.2
339 0.12
340 0.2
341 0.26
342 0.32
343 0.42
344 0.52
345 0.58
346 0.69
347 0.79
348 0.81
349 0.86
350 0.92
351 0.93
352 0.93
353 0.93
354 0.94
355 0.94
356 0.92
357 0.93
358 0.93
359 0.92
360 0.94
361 0.95
362 0.95
363 0.94