Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Y3H8

Protein Details
Accession A0A1Y1Y3H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66RESHSHKHGDSSRRRRKSSGBasic
93-124SDMSRPSDKPGRRSKRRTLRRALSKAKRICIRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-63RRRRK
100-120DKPGRRSKRRTLRRALSKAKR
Subcellular Location(s) plas 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MTSAATCTLSPTSFPRRNIAVPIFTMTAQPGLEPFPPLNVSHNFVRRESHSHKHGDSSRRRRKSSGLGGELPGDSDVAAFATLAQSSPPLTPSDMSRPSDKPGRRSKRRTLRRALSKAKRICIRHTWVGPLVLGLTVISLYLIYPYPSNPVSAALFLSYEIPQPPGSTGPIQYGKGARDFAFVGFYIILLSFTREFIMQRILRPLALHYGIKSRAKQARFMEQYYTAIYFAFLGPFGMWVMSRTPIWYFNTRAMYEGFPHRTHDAAFKAYYLVQASYWAQQMIVLMLMLEKPRKDFKELVAHHFITLSLIWLSYRFHFTYMGLAVYITHDVSDFFLATSKVLNYIDSSIVGPYFFIFMCVWGYLRHFINLRILTSIITQMPYIGPFELNWETQQYKCTLAQYITFSLLAALQAVNIFWSFLILRIAWRFVKSWGEDELEDDRSEYGESDLEDEFEYQERKERQAVHMEDIKEERESSESPQAKAKANGAAKLNGSANGKVNGTAKPNGTPKVTVNGRTPNPSPSVASGAEPRSSSRIQARKGGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.46
4 0.49
5 0.55
6 0.54
7 0.47
8 0.42
9 0.44
10 0.39
11 0.34
12 0.32
13 0.25
14 0.21
15 0.17
16 0.15
17 0.12
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.19
24 0.2
25 0.24
26 0.24
27 0.27
28 0.32
29 0.39
30 0.39
31 0.38
32 0.42
33 0.4
34 0.47
35 0.49
36 0.51
37 0.51
38 0.55
39 0.55
40 0.6
41 0.63
42 0.65
43 0.69
44 0.71
45 0.75
46 0.78
47 0.8
48 0.75
49 0.75
50 0.75
51 0.75
52 0.74
53 0.7
54 0.64
55 0.61
56 0.59
57 0.51
58 0.41
59 0.3
60 0.2
61 0.12
62 0.08
63 0.07
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.13
79 0.17
80 0.25
81 0.3
82 0.32
83 0.36
84 0.36
85 0.41
86 0.49
87 0.49
88 0.49
89 0.54
90 0.63
91 0.69
92 0.76
93 0.81
94 0.84
95 0.9
96 0.91
97 0.9
98 0.9
99 0.9
100 0.91
101 0.91
102 0.9
103 0.89
104 0.85
105 0.82
106 0.79
107 0.72
108 0.69
109 0.67
110 0.65
111 0.63
112 0.58
113 0.55
114 0.5
115 0.47
116 0.4
117 0.31
118 0.23
119 0.15
120 0.13
121 0.08
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.18
157 0.21
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.22
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.18
197 0.23
198 0.26
199 0.26
200 0.29
201 0.34
202 0.35
203 0.41
204 0.39
205 0.45
206 0.45
207 0.45
208 0.41
209 0.35
210 0.35
211 0.3
212 0.27
213 0.17
214 0.13
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.11
233 0.15
234 0.17
235 0.18
236 0.22
237 0.26
238 0.25
239 0.25
240 0.24
241 0.21
242 0.2
243 0.24
244 0.23
245 0.19
246 0.21
247 0.21
248 0.2
249 0.2
250 0.21
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.09
279 0.14
280 0.16
281 0.2
282 0.21
283 0.25
284 0.35
285 0.37
286 0.41
287 0.42
288 0.4
289 0.36
290 0.34
291 0.29
292 0.19
293 0.17
294 0.11
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.23
356 0.23
357 0.22
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.18
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.21
381 0.18
382 0.19
383 0.2
384 0.21
385 0.2
386 0.19
387 0.22
388 0.23
389 0.23
390 0.22
391 0.2
392 0.18
393 0.15
394 0.14
395 0.11
396 0.08
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.08
409 0.08
410 0.11
411 0.12
412 0.16
413 0.17
414 0.18
415 0.18
416 0.19
417 0.25
418 0.24
419 0.26
420 0.25
421 0.26
422 0.25
423 0.27
424 0.28
425 0.24
426 0.22
427 0.2
428 0.17
429 0.15
430 0.15
431 0.12
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.13
442 0.14
443 0.12
444 0.2
445 0.22
446 0.25
447 0.3
448 0.33
449 0.35
450 0.44
451 0.46
452 0.45
453 0.48
454 0.46
455 0.44
456 0.42
457 0.39
458 0.3
459 0.27
460 0.22
461 0.19
462 0.2
463 0.21
464 0.3
465 0.32
466 0.32
467 0.38
468 0.41
469 0.42
470 0.44
471 0.42
472 0.41
473 0.4
474 0.44
475 0.4
476 0.4
477 0.37
478 0.37
479 0.35
480 0.31
481 0.31
482 0.29
483 0.29
484 0.28
485 0.27
486 0.26
487 0.28
488 0.27
489 0.29
490 0.31
491 0.29
492 0.33
493 0.39
494 0.4
495 0.41
496 0.4
497 0.38
498 0.43
499 0.46
500 0.44
501 0.45
502 0.5
503 0.52
504 0.55
505 0.54
506 0.5
507 0.49
508 0.46
509 0.42
510 0.35
511 0.36
512 0.31
513 0.31
514 0.32
515 0.32
516 0.32
517 0.3
518 0.3
519 0.31
520 0.3
521 0.34
522 0.37
523 0.42
524 0.44