Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2A622

Protein Details
Accession A0A1Y2A622    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-150EGEGEPAKKKKKKDSRRDKPRRKKNQDDEVSATBasic
152-171DTGGRGSRKRKEGRARRASPBasic
196-215VLKSSKTSSRRRKKGDIDLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-141HKRKRAEGEGEPAKKKKKKDSRRDKPRRKK
155-169GRGSRKRKEGRARRA
204-209SRRRKK
439-451KRIKAKTGGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDPQFLSDHSNSPLPEAGNDPGDPLRPEIDEENSTPNPPLGAPHQDTEVAEDYEGMPDQDNVDEAGLSDDESGLSELDEQQFDEFNAEDIAIEERPAQLIDETNVSLIGVHKRKRAEGEGEPAKKKKKKDSRRDKPRRKKNQDDEVSATEDTGGRGSRKRKEGRARRASPDSAEDENLTPEERRKRALDRSIDQVLKSSKTSSRRRKKGDIDLDQMADQEIEEMRRRMAAAAEADNEGRKRGEPAAHKLKLLPEVVALLNKNTLKESIVDPEINLLEAVRFFLEPLSDGSLPAYSIQRELFAALAKLPITKDTLVASGIGKVIMFYVKSKRPELVIKRQAERLFTDWTRPILRRTDDYRKKEFSQAEFDPTQLPVRSAPVNNQAAIARAKALEAPRAFQRARMEAGPTTYTIVPKSNVQIGSEQVKRAPGAGGDELLKRIKAKTGGRGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.21
14 0.18
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.31
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.26
25 0.22
26 0.19
27 0.2
28 0.18
29 0.26
30 0.27
31 0.28
32 0.3
33 0.3
34 0.3
35 0.32
36 0.3
37 0.22
38 0.19
39 0.18
40 0.16
41 0.16
42 0.16
43 0.12
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.17
97 0.22
98 0.26
99 0.3
100 0.32
101 0.35
102 0.4
103 0.43
104 0.41
105 0.39
106 0.46
107 0.51
108 0.55
109 0.58
110 0.58
111 0.63
112 0.61
113 0.63
114 0.64
115 0.66
116 0.7
117 0.76
118 0.82
119 0.84
120 0.91
121 0.96
122 0.96
123 0.96
124 0.97
125 0.97
126 0.96
127 0.95
128 0.94
129 0.94
130 0.9
131 0.85
132 0.79
133 0.7
134 0.63
135 0.51
136 0.4
137 0.3
138 0.23
139 0.17
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.15
144 0.22
145 0.28
146 0.37
147 0.44
148 0.52
149 0.62
150 0.7
151 0.76
152 0.81
153 0.8
154 0.78
155 0.77
156 0.7
157 0.6
158 0.54
159 0.47
160 0.37
161 0.32
162 0.26
163 0.2
164 0.19
165 0.18
166 0.14
167 0.11
168 0.15
169 0.21
170 0.21
171 0.24
172 0.26
173 0.32
174 0.39
175 0.47
176 0.48
177 0.44
178 0.48
179 0.51
180 0.49
181 0.43
182 0.38
183 0.32
184 0.27
185 0.25
186 0.22
187 0.21
188 0.29
189 0.39
190 0.47
191 0.55
192 0.63
193 0.7
194 0.76
195 0.79
196 0.8
197 0.8
198 0.76
199 0.7
200 0.62
201 0.56
202 0.47
203 0.39
204 0.28
205 0.18
206 0.11
207 0.07
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.17
231 0.2
232 0.29
233 0.38
234 0.39
235 0.39
236 0.38
237 0.38
238 0.36
239 0.32
240 0.24
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.09
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.08
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.16
315 0.22
316 0.26
317 0.28
318 0.29
319 0.32
320 0.41
321 0.46
322 0.51
323 0.54
324 0.56
325 0.58
326 0.63
327 0.61
328 0.54
329 0.49
330 0.41
331 0.39
332 0.34
333 0.36
334 0.32
335 0.34
336 0.37
337 0.35
338 0.36
339 0.36
340 0.39
341 0.4
342 0.46
343 0.53
344 0.58
345 0.64
346 0.68
347 0.66
348 0.66
349 0.68
350 0.66
351 0.59
352 0.57
353 0.52
354 0.51
355 0.45
356 0.43
357 0.36
358 0.31
359 0.31
360 0.23
361 0.22
362 0.16
363 0.19
364 0.23
365 0.23
366 0.27
367 0.32
368 0.35
369 0.34
370 0.34
371 0.31
372 0.29
373 0.29
374 0.24
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.16
379 0.18
380 0.23
381 0.22
382 0.25
383 0.28
384 0.35
385 0.35
386 0.36
387 0.4
388 0.36
389 0.39
390 0.38
391 0.37
392 0.32
393 0.36
394 0.33
395 0.27
396 0.26
397 0.24
398 0.24
399 0.22
400 0.23
401 0.21
402 0.24
403 0.27
404 0.3
405 0.29
406 0.3
407 0.3
408 0.31
409 0.37
410 0.37
411 0.34
412 0.3
413 0.31
414 0.3
415 0.29
416 0.26
417 0.2
418 0.22
419 0.22
420 0.22
421 0.22
422 0.23
423 0.25
424 0.25
425 0.25
426 0.22
427 0.22
428 0.26
429 0.32
430 0.37
431 0.43