Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YDP0

Protein Details
Accession A0A1Y1YDP0    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MADDSKKRKLPVNNGPPPKRPRFPGKPQHKISATHydrophilic
90-114AHNPQRVPTRFRARTKKEAREDNVTHydrophilic
124-159IGKGPKKWLRQEVIDKKKKSREKRAKKSREDVDITVBasic
176-219ASDSGKPTTSKKQRQKQTALTVPNRPPAKFRKRQVHKTWLPTHLHydrophilic
600-625VAERAEREKEWRKRPRGKRIEWTTIDBasic
731-755LMPCPKPSSTTKRDQNRPRNGNTKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28KKRKLPVNNGPPPKRPRFPGKPQ
92-110NPQRVPTRFRARTKKEARE
115-152ITKSKSGSGIGKGPKKWLRQEVIDKKKKSREKRAKKSR
606-618REKEWRKRPRGKR
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MADDSKKRKLPVNNGPPPKRPRFPGKPQHKISATPASDAYPNGELNVSRFVHVHENEIKALESAMKVAKKGLMRRTFQDVPRDLRRRTAAHNPQRVPTRFRARTKKEAREDNVTITKSKSGSGIGKGPKKWLRQEVIDKKKKSREKRAKKSREDVDITVTMDVDTDKDNLPDKPAASDSGKPTTSKKQRQKQTALTVPNRPPAKFRKRQVHKTWLPTHLYHTKRAQITPPNEPLWRFAIPLSPATKSYRLTHRAATLRGAVAWDMSYISTIGLEGTEGSLVGLLKALRYAEEDAEEIWDERGKAKKWRAGLRTWEGWIHGREGEIPKKIAQVTVIWRARGSADEKTRQILIRVHPSAFLQLWNEVIRVSKVQKPAVVVEDLRFEIGSIEVTGPAATEALTSVLHPSPFGEAGANPALSVWPSLAPVTDLRTLPPNVLLHFPIVDPRLRCPPRPAKMSQDEVSHSHLLETLAYWPIDEHPSAAEVFDRDAILAASRSLPSQQSINRRKSAAAPGEYPDARPSDARIPILAYVSEHGKTWTILLPWKCVAPVWRSLMFYPVSTGGNPRFGGLLEKRQLHFERSVACFPFDCPGTDAGWAWEVAERAEREKEWRKRPRGKRIEWTTIDMGHGRKGEVGDPWACEWERLLPNSNDPAATEKKESSGKPATPLLQLSLQAASDLVAGRSSPKTFLSAPYIFAVKITMVQRGVPTTCARLYRLPTDNPDLREKWLSLMPCPKPSSTTKRDQNRPRNGNTKNVPQHIRNRRLAASLLERKDQTQDHMKAGDAEYPVVPNESSLIGFVTTGNYNLAEGKPSAIANLVLHRVFGVHDADAGIARKPLGKEDRVCIVREAGSTLGRLAVWDVAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.84
3 0.86
4 0.86
5 0.84
6 0.8
7 0.77
8 0.77
9 0.77
10 0.81
11 0.83
12 0.84
13 0.86
14 0.85
15 0.87
16 0.79
17 0.74
18 0.7
19 0.69
20 0.6
21 0.52
22 0.46
23 0.39
24 0.37
25 0.33
26 0.3
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.17
32 0.18
33 0.25
34 0.22
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.29
39 0.3
40 0.34
41 0.33
42 0.35
43 0.35
44 0.35
45 0.33
46 0.24
47 0.24
48 0.19
49 0.14
50 0.14
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.25
56 0.29
57 0.36
58 0.43
59 0.46
60 0.49
61 0.53
62 0.59
63 0.62
64 0.61
65 0.64
66 0.6
67 0.59
68 0.65
69 0.69
70 0.61
71 0.61
72 0.63
73 0.57
74 0.58
75 0.61
76 0.61
77 0.64
78 0.73
79 0.68
80 0.69
81 0.74
82 0.72
83 0.68
84 0.67
85 0.68
86 0.66
87 0.73
88 0.78
89 0.76
90 0.83
91 0.86
92 0.87
93 0.85
94 0.86
95 0.82
96 0.8
97 0.74
98 0.71
99 0.67
100 0.59
101 0.51
102 0.43
103 0.41
104 0.32
105 0.31
106 0.24
107 0.22
108 0.25
109 0.27
110 0.33
111 0.38
112 0.44
113 0.45
114 0.53
115 0.55
116 0.58
117 0.62
118 0.63
119 0.61
120 0.62
121 0.72
122 0.74
123 0.78
124 0.8
125 0.77
126 0.77
127 0.8
128 0.81
129 0.81
130 0.81
131 0.82
132 0.84
133 0.9
134 0.93
135 0.94
136 0.94
137 0.93
138 0.89
139 0.87
140 0.81
141 0.72
142 0.67
143 0.58
144 0.49
145 0.4
146 0.32
147 0.22
148 0.17
149 0.15
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.12
155 0.14
156 0.15
157 0.19
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.23
163 0.24
164 0.28
165 0.29
166 0.32
167 0.33
168 0.32
169 0.35
170 0.42
171 0.49
172 0.55
173 0.61
174 0.64
175 0.73
176 0.82
177 0.86
178 0.85
179 0.84
180 0.82
181 0.81
182 0.77
183 0.76
184 0.7
185 0.68
186 0.62
187 0.52
188 0.51
189 0.52
190 0.57
191 0.58
192 0.63
193 0.66
194 0.73
195 0.84
196 0.87
197 0.87
198 0.84
199 0.85
200 0.83
201 0.79
202 0.74
203 0.64
204 0.61
205 0.59
206 0.54
207 0.51
208 0.48
209 0.48
210 0.47
211 0.48
212 0.48
213 0.48
214 0.5
215 0.51
216 0.53
217 0.49
218 0.47
219 0.46
220 0.41
221 0.37
222 0.33
223 0.25
224 0.2
225 0.21
226 0.21
227 0.25
228 0.24
229 0.21
230 0.23
231 0.26
232 0.29
233 0.27
234 0.3
235 0.35
236 0.38
237 0.4
238 0.41
239 0.44
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.34
244 0.29
245 0.26
246 0.24
247 0.16
248 0.12
249 0.1
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.08
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.11
288 0.17
289 0.19
290 0.26
291 0.32
292 0.36
293 0.42
294 0.5
295 0.51
296 0.52
297 0.57
298 0.55
299 0.52
300 0.49
301 0.43
302 0.36
303 0.35
304 0.3
305 0.23
306 0.17
307 0.15
308 0.17
309 0.21
310 0.24
311 0.23
312 0.23
313 0.22
314 0.25
315 0.25
316 0.21
317 0.17
318 0.17
319 0.19
320 0.28
321 0.29
322 0.26
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.22
328 0.19
329 0.23
330 0.28
331 0.29
332 0.3
333 0.31
334 0.29
335 0.29
336 0.27
337 0.25
338 0.3
339 0.31
340 0.3
341 0.28
342 0.28
343 0.27
344 0.23
345 0.2
346 0.12
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.13
356 0.16
357 0.19
358 0.21
359 0.22
360 0.23
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.18
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.06
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.17
421 0.15
422 0.13
423 0.14
424 0.14
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.23
434 0.25
435 0.26
436 0.32
437 0.4
438 0.45
439 0.49
440 0.5
441 0.48
442 0.52
443 0.56
444 0.5
445 0.43
446 0.38
447 0.35
448 0.36
449 0.29
450 0.23
451 0.17
452 0.16
453 0.14
454 0.12
455 0.1
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.12
487 0.16
488 0.26
489 0.35
490 0.4
491 0.42
492 0.42
493 0.43
494 0.43
495 0.46
496 0.42
497 0.36
498 0.32
499 0.31
500 0.34
501 0.33
502 0.3
503 0.24
504 0.18
505 0.16
506 0.15
507 0.16
508 0.17
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.18
515 0.16
516 0.1
517 0.08
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.12
526 0.11
527 0.16
528 0.17
529 0.19
530 0.19
531 0.2
532 0.18
533 0.17
534 0.19
535 0.17
536 0.21
537 0.23
538 0.25
539 0.26
540 0.26
541 0.29
542 0.26
543 0.22
544 0.18
545 0.15
546 0.14
547 0.13
548 0.16
549 0.14
550 0.17
551 0.17
552 0.16
553 0.15
554 0.14
555 0.19
556 0.19
557 0.25
558 0.26
559 0.3
560 0.3
561 0.36
562 0.37
563 0.35
564 0.35
565 0.29
566 0.3
567 0.3
568 0.34
569 0.28
570 0.28
571 0.24
572 0.23
573 0.24
574 0.2
575 0.17
576 0.14
577 0.15
578 0.14
579 0.15
580 0.14
581 0.12
582 0.12
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.08
588 0.12
589 0.12
590 0.14
591 0.16
592 0.16
593 0.22
594 0.33
595 0.41
596 0.48
597 0.58
598 0.66
599 0.75
600 0.84
601 0.88
602 0.89
603 0.88
604 0.88
605 0.86
606 0.86
607 0.78
608 0.73
609 0.64
610 0.54
611 0.47
612 0.39
613 0.31
614 0.25
615 0.23
616 0.17
617 0.17
618 0.16
619 0.16
620 0.15
621 0.18
622 0.16
623 0.17
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.17
628 0.16
629 0.2
630 0.22
631 0.23
632 0.28
633 0.26
634 0.29
635 0.33
636 0.33
637 0.25
638 0.22
639 0.25
640 0.24
641 0.25
642 0.25
643 0.22
644 0.25
645 0.3
646 0.3
647 0.33
648 0.36
649 0.35
650 0.36
651 0.39
652 0.38
653 0.35
654 0.35
655 0.3
656 0.24
657 0.23
658 0.2
659 0.17
660 0.15
661 0.12
662 0.11
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.09
670 0.12
671 0.13
672 0.13
673 0.14
674 0.17
675 0.18
676 0.22
677 0.27
678 0.25
679 0.26
680 0.26
681 0.26
682 0.23
683 0.21
684 0.19
685 0.11
686 0.15
687 0.15
688 0.17
689 0.16
690 0.18
691 0.19
692 0.21
693 0.22
694 0.2
695 0.2
696 0.21
697 0.24
698 0.25
699 0.26
700 0.29
701 0.32
702 0.37
703 0.41
704 0.41
705 0.43
706 0.49
707 0.52
708 0.5
709 0.53
710 0.46
711 0.45
712 0.44
713 0.39
714 0.34
715 0.33
716 0.31
717 0.3
718 0.38
719 0.38
720 0.41
721 0.44
722 0.41
723 0.42
724 0.49
725 0.53
726 0.5
727 0.57
728 0.59
729 0.67
730 0.76
731 0.83
732 0.85
733 0.86
734 0.87
735 0.86
736 0.86
737 0.79
738 0.79
739 0.75
740 0.75
741 0.72
742 0.72
743 0.7
744 0.67
745 0.74
746 0.74
747 0.77
748 0.73
749 0.7
750 0.64
751 0.61
752 0.56
753 0.51
754 0.5
755 0.5
756 0.47
757 0.46
758 0.45
759 0.43
760 0.46
761 0.42
762 0.38
763 0.39
764 0.4
765 0.39
766 0.4
767 0.39
768 0.37
769 0.36
770 0.35
771 0.25
772 0.23
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.17
777 0.16
778 0.11
779 0.11
780 0.11
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.08
785 0.09
786 0.09
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.14
794 0.14
795 0.14
796 0.13
797 0.14
798 0.15
799 0.15
800 0.15
801 0.14
802 0.15
803 0.14
804 0.18
805 0.21
806 0.19
807 0.19
808 0.18
809 0.17
810 0.16
811 0.17
812 0.15
813 0.11
814 0.12
815 0.12
816 0.13
817 0.15
818 0.15
819 0.14
820 0.12
821 0.13
822 0.17
823 0.17
824 0.26
825 0.31
826 0.37
827 0.41
828 0.45
829 0.54
830 0.52
831 0.53
832 0.47
833 0.43
834 0.38
835 0.34
836 0.32
837 0.24
838 0.23
839 0.22
840 0.2
841 0.18
842 0.15
843 0.14
844 0.13