FuNGI

A0A1Y1ZVR8

Protein Details

Accession

A0A1Y1ZVR8

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-53	PAGPNGQPMRKPRRRPQTDPMRQPQRPLKKISRPPMSL	Hydrophilic
538-565	EASGNESSRKKHKKNKKHGDGSRKTSLV	Basic
586-605	MTDAGKKKKHTLKIKGLGGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-45	PAGPNGQPMRKPRRRPQTDPMRQPQRPLKK
432-452	KREREEKKKLEKSLRKALTKR
527-534	KKKRPGSP
540-560	SGNESSRKKHKKNKKHGDGSR
591-600	KKKKHTLKIK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNTLGNSPAPRPPGAPAGPNGQPMRKPRRRPQTDPMRQPQRPLKKISRPPMSLTQMNERTGQGRPTDATSSTAEAARHVSLQDARNEYLRKGAQVVPLMLTKRDLKELRHHVMRLQYNQAKDGSDILNPEHFTPPLRLHRRDPRAPPSGAGAHFVEDDTAEDLEESKERERLEILKEERRKIREENQAKIAPSATKKTPAFQKKTEQKYRPDDTPEAEKRRLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSETHIMLSGATDEHRGMYMQMVPLERWYRFSAKGKVKGYTADEADVVWKKTEDKVPQFMAKLEANSVKAEKQERQRLLKGGPAPTKMRTRIGGGADDEGALPQQRRGDDDAPIIKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGDEADIKDAAEKLKRDHLAASVFELRNEEEVYREEEQEKREREEKKKLEKSLRKALTKREKNYDFESSDSNPYESSSESDTDSETERQRAKEEEERKAAEQNGKATEGDKPASGTSTKGTTTPSGSHKPVDLNKKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKNKKHGDGSRKTSLVHLSSSADLSRRGAASGSDSEMTDAGKKKKHTLKIKGLGGSPSGSPGGSRAGSPAASQVNGSRAGSPAAQPSQTRLPSATEIYKALPAEGMTIQGLINIFKDRVDKSNTQLFIRLVKAVSSFDKQRSWLIPLPQMPSDEQIQSVMKVSKPPAKSAAASPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.37
3	0.34
4	0.37
5	0.39
6	0.45
7	0.45
8	0.41
9	0.44
10	0.5
11	0.58
12	0.62
13	0.69
14	0.72
15	0.79
16	0.84
17	0.86
18	0.88
19	0.88
20	0.89
21	0.9
22	0.9
23	0.9
24	0.82
25	0.82
26	0.82
27	0.81
28	0.77
29	0.76
30	0.76
31	0.76
32	0.84
33	0.85
34	0.85
35	0.78
36	0.77
37	0.78
38	0.74
39	0.68
40	0.62
41	0.62
42	0.57
43	0.55
44	0.51
45	0.43
46	0.38
47	0.37
48	0.37
49	0.28
50	0.26
51	0.25
52	0.27
53	0.29
54	0.27
55	0.27
56	0.25
57	0.26
58	0.25
59	0.26
60	0.22
61	0.2
62	0.21
63	0.19
64	0.18
65	0.15
66	0.18
67	0.21
68	0.25
69	0.3
70	0.31
71	0.32
72	0.37
73	0.39
74	0.35
75	0.37
76	0.35
77	0.3
78	0.3
79	0.33
80	0.32
81	0.34
82	0.34
83	0.29
84	0.31
85	0.31
86	0.28
87	0.27
88	0.27
89	0.25
90	0.32
91	0.33
92	0.34
93	0.43
94	0.52
95	0.56
96	0.58
97	0.57
98	0.52
99	0.58
100	0.6
101	0.54
102	0.55
103	0.52
104	0.47
105	0.49
106	0.46
107	0.38
108	0.32
109	0.31
110	0.22
111	0.19
112	0.19
113	0.18
114	0.21
115	0.21
116	0.22
117	0.21
118	0.2
119	0.2
120	0.22
121	0.28
122	0.34
123	0.42
124	0.44
125	0.51
126	0.61
127	0.68
128	0.73
129	0.74
130	0.72
131	0.71
132	0.68
133	0.6
134	0.55
135	0.52
136	0.43
137	0.38
138	0.3
139	0.23
140	0.22
141	0.21
142	0.16
143	0.1
144	0.11
145	0.09
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.14
155	0.15
156	0.16
157	0.17
158	0.2
159	0.23
160	0.3
161	0.34
162	0.4
163	0.46
164	0.52
165	0.56
166	0.56
167	0.56
168	0.54
169	0.58
170	0.59
171	0.6
172	0.59
173	0.6
174	0.61
175	0.57
176	0.51
177	0.44
178	0.38
179	0.34
180	0.34
181	0.28
182	0.32
183	0.32
184	0.36
185	0.44
186	0.5
187	0.53
188	0.54
189	0.62
190	0.64
191	0.74
192	0.79
193	0.75
194	0.74
195	0.77
196	0.76
197	0.71
198	0.68
199	0.6
200	0.53
201	0.57
202	0.56
203	0.54
204	0.5
205	0.48
206	0.44
207	0.48
208	0.49
209	0.43
210	0.39
211	0.38
212	0.43
213	0.45
214	0.46
215	0.42
216	0.39
217	0.35
218	0.31
219	0.26
220	0.2
221	0.19
222	0.19
223	0.22
224	0.22
225	0.21
226	0.21
227	0.2
228	0.2
229	0.19
230	0.15
231	0.1
232	0.1
233	0.13
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.12
259	0.11
260	0.15
261	0.17
262	0.16
263	0.18
264	0.19
265	0.21
266	0.25
267	0.31
268	0.37
269	0.42
270	0.5
271	0.5
272	0.49
273	0.46
274	0.45
275	0.42
276	0.36
277	0.29
278	0.21
279	0.19
280	0.17
281	0.19
282	0.18
283	0.15
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.15
288	0.21
289	0.25
290	0.27
291	0.31
292	0.34
293	0.36
294	0.36
295	0.33
296	0.31
297	0.25
298	0.21
299	0.18
300	0.17
301	0.15
302	0.16
303	0.16
304	0.13
305	0.16
306	0.18
307	0.22
308	0.28
309	0.36
310	0.4
311	0.45
312	0.47
313	0.47
314	0.45
315	0.44
316	0.4
317	0.38
318	0.36
319	0.34
320	0.33
321	0.34
322	0.38
323	0.36
324	0.34
325	0.29
326	0.28
327	0.29
328	0.28
329	0.26
330	0.21
331	0.2
332	0.17
333	0.16
334	0.13
335	0.09
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.11
343	0.15
344	0.16
345	0.17
346	0.2
347	0.25
348	0.24
349	0.24
350	0.23
351	0.18
352	0.17
353	0.16
354	0.13
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.02
379	0.02
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.11
391	0.11
392	0.13
393	0.19
394	0.21
395	0.21
396	0.21
397	0.22
398	0.21
399	0.21
400	0.22
401	0.22
402	0.21
403	0.21
404	0.21
405	0.18
406	0.17
407	0.17
408	0.14
409	0.08
410	0.1
411	0.14
412	0.15
413	0.15
414	0.16
415	0.18
416	0.22
417	0.28
418	0.3
419	0.29
420	0.34
421	0.41
422	0.46
423	0.54
424	0.59
425	0.63
426	0.68
427	0.72
428	0.76
429	0.77
430	0.77
431	0.77
432	0.76
433	0.72
434	0.68
435	0.71
436	0.71
437	0.72
438	0.7
439	0.69
440	0.66
441	0.62
442	0.64
443	0.6
444	0.5
445	0.43
446	0.41
447	0.34
448	0.34
449	0.3
450	0.26
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.14
455	0.13
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.15
463	0.17
464	0.16
465	0.2
466	0.23
467	0.23
468	0.25
469	0.26
470	0.29
471	0.34
472	0.4
473	0.42
474	0.45
475	0.46
476	0.45
477	0.47
478	0.45
479	0.42
480	0.38
481	0.34
482	0.31
483	0.29
484	0.28
485	0.25
486	0.25
487	0.23
488	0.21
489	0.17
490	0.16
491	0.15
492	0.17
493	0.16
494	0.13
495	0.12
496	0.14
497	0.14
498	0.13
499	0.15
500	0.15
501	0.18
502	0.21
503	0.26
504	0.29
505	0.31
506	0.31
507	0.31
508	0.35
509	0.39
510	0.46
511	0.5
512	0.54
513	0.61
514	0.69
515	0.72
516	0.73
517	0.74
518	0.73
519	0.72
520	0.69
521	0.67
522	0.6
523	0.57
524	0.5
525	0.42
526	0.39
527	0.32
528	0.26
529	0.24
530	0.25
531	0.27
532	0.37
533	0.48
534	0.5
535	0.58
536	0.68
537	0.75
538	0.83
539	0.91
540	0.92
541	0.92
542	0.92
543	0.93
544	0.92
545	0.88
546	0.84
547	0.74
548	0.63
549	0.55
550	0.51
551	0.42
552	0.34
553	0.28
554	0.22
555	0.22
556	0.23
557	0.21
558	0.17
559	0.16
560	0.16
561	0.16
562	0.15
563	0.14
564	0.13
565	0.13
566	0.15
567	0.16
568	0.17
569	0.16
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.15
574	0.16
575	0.21
576	0.24
577	0.28
578	0.31
579	0.4
580	0.48
581	0.57
582	0.63
583	0.67
584	0.73
585	0.77
586	0.81
587	0.75
588	0.69
589	0.62
590	0.53
591	0.44
592	0.33
593	0.25
594	0.19
595	0.15
596	0.12
597	0.12
598	0.14
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.14
603	0.15
604	0.15
605	0.18
606	0.16
607	0.16
608	0.17
609	0.17
610	0.18
611	0.2
612	0.2
613	0.17
614	0.16
615	0.17
616	0.18
617	0.18
618	0.21
619	0.22
620	0.24
621	0.23
622	0.28
623	0.35
624	0.35
625	0.35
626	0.3
627	0.31
628	0.31
629	0.36
630	0.34
631	0.28
632	0.28
633	0.28
634	0.3
635	0.26
636	0.23
637	0.19
638	0.15
639	0.16
640	0.15
641	0.15
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.12
647	0.09
648	0.11
649	0.12
650	0.12
651	0.13
652	0.17
653	0.18
654	0.24
655	0.31
656	0.33
657	0.36
658	0.44
659	0.46
660	0.43
661	0.45
662	0.41
663	0.39
664	0.38
665	0.35
666	0.27
667	0.25
668	0.25
669	0.24
670	0.27
671	0.28
672	0.31
673	0.33
674	0.37
675	0.37
676	0.41
677	0.42
678	0.44
679	0.44
680	0.45
681	0.47
682	0.49
683	0.51
684	0.48
685	0.46
686	0.41
687	0.38
688	0.36
689	0.29
690	0.25
691	0.24
692	0.23
693	0.21
694	0.25
695	0.25
696	0.23
697	0.28
698	0.33
699	0.37
700	0.38
701	0.43
702	0.44
703	0.45
704	0.46

A0A1Y1ZVR8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer