Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Y3E2

Protein Details
Accession A0A1Y1Y3E2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-260VTPTGKKADKRNKVIKLAHDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.333, nucl 6.5, mito 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039226  Ski3/TTC37  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR040962  TPR_22  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0055087  C:Ski complex  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF18833  TPR_22  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSTKAGLKAAKAAIDVKKWDEVKEQANGVLEKDPQNYFAKLFLGRAFDGLGKFEDSAKAYEDATKIKPDDAQAWLGLRSMYEKQSGAKVDENTRVGLRLAEIYVGLDDAHRSQSAIDKLVDFARKHGTPLQYSRALATQLPTSPVYSFLEGRLPNPSAVYTRIAETNEAYENERINRLIGERKTRLGATLTDVTEDVKREIYETSELESIYESVIDWTNDDDLRREYEEKLLMRAYDSLLVTPTGKKADKRNKVIKLAHDMVVIKHPFMLAWEIELEWRHAME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.33
4 0.38
5 0.37
6 0.38
7 0.38
8 0.39
9 0.39
10 0.4
11 0.39
12 0.33
13 0.36
14 0.34
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.25
19 0.27
20 0.25
21 0.25
22 0.28
23 0.28
24 0.26
25 0.24
26 0.24
27 0.21
28 0.22
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.23
56 0.24
57 0.23
58 0.23
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.17
63 0.15
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.2
72 0.22
73 0.21
74 0.24
75 0.25
76 0.27
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.27
81 0.25
82 0.21
83 0.18
84 0.14
85 0.1
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.18
107 0.22
108 0.17
109 0.18
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.25
115 0.24
116 0.28
117 0.3
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.23
122 0.21
123 0.18
124 0.15
125 0.12
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.15
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.19
166 0.21
167 0.28
168 0.29
169 0.3
170 0.32
171 0.31
172 0.3
173 0.25
174 0.22
175 0.19
176 0.22
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.17
211 0.2
212 0.21
213 0.2
214 0.24
215 0.29
216 0.28
217 0.29
218 0.27
219 0.24
220 0.23
221 0.23
222 0.19
223 0.18
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.22
233 0.27
234 0.36
235 0.46
236 0.55
237 0.64
238 0.71
239 0.74
240 0.8
241 0.81
242 0.77
243 0.76
244 0.7
245 0.62
246 0.56
247 0.48
248 0.41
249 0.43
250 0.37
251 0.27
252 0.24
253 0.22
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.16
262 0.17
263 0.17