Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YG27

Protein Details
Accession A0A1Y1YG27    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-100AEQPRRGARKTKPAKKRNTDEPLDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-92RRGARKTKPAKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00570  HRDC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
Amino Acid Sequences MNAKRVAMIPPPPLPILADKYLSGTISSGKSWLRPIHLEPTEEGGMVTTPVEFFGVKGEPKDKGEEDATVDGQLTAEQPRRGARKTKPAKKRNTDEPLDALSKELYGRLSARRLTLASSESVPAYVIANNSVLEGLARKRPIDEKGLLTIRGIGPVKQEKYGAHWLEVITKFCAERDIGPSEQTEESRELTTSKLRARRRKIVTADKGSGSPPSSPTFGSPLVRTPQLHTGLSFQLEGTNLESQGSIDGSEDENAEVIDEEEYSGEDQDHFEEGEEDGESQEHFVTPAESSSQLKRKRDMSGHRYREESSSLKRRSASPCVRESPALPLPQPPLSPRSKMFQNKLVAFTRLVARTIGLDPLDPLLSEDTLRHIVMNPPKTSDELQRIPGITKLVGACVVAEKDLLKNIVKFAPVRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.32
4 0.3
5 0.28
6 0.25
7 0.27
8 0.28
9 0.26
10 0.21
11 0.16
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.2
18 0.26
19 0.3
20 0.31
21 0.33
22 0.37
23 0.44
24 0.46
25 0.45
26 0.4
27 0.42
28 0.38
29 0.33
30 0.28
31 0.19
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.1
42 0.13
43 0.14
44 0.18
45 0.21
46 0.23
47 0.25
48 0.31
49 0.28
50 0.29
51 0.29
52 0.28
53 0.28
54 0.28
55 0.26
56 0.21
57 0.2
58 0.16
59 0.14
60 0.13
61 0.1
62 0.12
63 0.17
64 0.17
65 0.19
66 0.25
67 0.31
68 0.35
69 0.43
70 0.46
71 0.52
72 0.62
73 0.7
74 0.75
75 0.8
76 0.86
77 0.88
78 0.88
79 0.88
80 0.86
81 0.8
82 0.73
83 0.67
84 0.61
85 0.52
86 0.44
87 0.34
88 0.25
89 0.2
90 0.17
91 0.14
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.14
108 0.14
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.16
127 0.2
128 0.23
129 0.27
130 0.28
131 0.26
132 0.31
133 0.34
134 0.32
135 0.28
136 0.28
137 0.22
138 0.23
139 0.21
140 0.16
141 0.19
142 0.25
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.21
147 0.27
148 0.35
149 0.31
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.29
154 0.31
155 0.26
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.17
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.11
177 0.12
178 0.15
179 0.16
180 0.2
181 0.27
182 0.34
183 0.43
184 0.5
185 0.58
186 0.61
187 0.66
188 0.68
189 0.71
190 0.71
191 0.68
192 0.63
193 0.54
194 0.48
195 0.4
196 0.35
197 0.25
198 0.18
199 0.14
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.2
211 0.19
212 0.18
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.21
217 0.22
218 0.2
219 0.21
220 0.18
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.12
278 0.18
279 0.26
280 0.32
281 0.36
282 0.4
283 0.43
284 0.49
285 0.55
286 0.59
287 0.61
288 0.65
289 0.7
290 0.68
291 0.66
292 0.6
293 0.54
294 0.48
295 0.43
296 0.41
297 0.43
298 0.44
299 0.45
300 0.45
301 0.48
302 0.5
303 0.56
304 0.56
305 0.53
306 0.57
307 0.58
308 0.59
309 0.54
310 0.48
311 0.46
312 0.41
313 0.37
314 0.31
315 0.3
316 0.32
317 0.33
318 0.33
319 0.28
320 0.29
321 0.31
322 0.35
323 0.33
324 0.35
325 0.42
326 0.49
327 0.52
328 0.54
329 0.58
330 0.57
331 0.6
332 0.58
333 0.5
334 0.42
335 0.39
336 0.37
337 0.3
338 0.28
339 0.22
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.21
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.14
349 0.11
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.15
360 0.22
361 0.31
362 0.38
363 0.35
364 0.36
365 0.38
366 0.41
367 0.42
368 0.43
369 0.44
370 0.4
371 0.43
372 0.43
373 0.43
374 0.41
375 0.4
376 0.35
377 0.26
378 0.25
379 0.22
380 0.18
381 0.18
382 0.17
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.18
391 0.2
392 0.2
393 0.21
394 0.25
395 0.27
396 0.3