Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PMH4

Protein Details
Accession B8PMH4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-87PASEEATSKRKRKGKKKASDQNVDSKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-78KRKRKGKKKA
Subcellular Location(s) pero 9, cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_101050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
Amino Acid Sequences MTWLGQIFDLGDKTWLETHIWHAKRMKMENILTRILWRPTCPFNEDPVGSLFQKPSDAAQPASEEATSKRKRKGKKKASDQNVDSKWPPNRTVWIRVHPAVTSEVHVALRTAASFALDTLGKITGRPECKVDIADLRGGVNVFEIMGPKSSQVIKGALKPVQHKWRGDFNKFWQALDQVQTTGSLPRGMVIGFAVQDPRLDPWRADWEVVLGLEDPPSPETDFISAQRETPVPPTEQAAEKKVRPWLLRGVGVPAMLQNLSSMFNPGAGLLDFINQARVKRGLDPLKTGTRTDELWQSALITVRVILCGRGNPEDLAMIYALDDAEAKKWHDAEARRQQGATSLLDEGEDDTQSSTSLPAPKSIIGYVTTGHYSLARGTGHAVGAIPVRQLFELWQQAERLHTGSSWLVKIRDRGDNICRVARIEMLGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.24
6 0.32
7 0.33
8 0.38
9 0.41
10 0.45
11 0.52
12 0.56
13 0.55
14 0.53
15 0.59
16 0.6
17 0.6
18 0.58
19 0.5
20 0.48
21 0.46
22 0.44
23 0.39
24 0.34
25 0.34
26 0.38
27 0.42
28 0.45
29 0.42
30 0.42
31 0.47
32 0.44
33 0.41
34 0.37
35 0.37
36 0.31
37 0.32
38 0.27
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.22
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.23
49 0.24
50 0.22
51 0.17
52 0.17
53 0.27
54 0.33
55 0.37
56 0.45
57 0.51
58 0.62
59 0.71
60 0.8
61 0.8
62 0.83
63 0.88
64 0.9
65 0.93
66 0.93
67 0.86
68 0.85
69 0.78
70 0.71
71 0.62
72 0.58
73 0.55
74 0.49
75 0.47
76 0.4
77 0.46
78 0.46
79 0.54
80 0.53
81 0.54
82 0.56
83 0.55
84 0.53
85 0.44
86 0.4
87 0.34
88 0.28
89 0.23
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.11
96 0.11
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.16
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.23
117 0.23
118 0.24
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.19
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.13
127 0.09
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.16
141 0.17
142 0.21
143 0.25
144 0.25
145 0.28
146 0.31
147 0.36
148 0.42
149 0.45
150 0.43
151 0.42
152 0.51
153 0.54
154 0.55
155 0.53
156 0.49
157 0.54
158 0.52
159 0.49
160 0.4
161 0.34
162 0.32
163 0.29
164 0.24
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.13
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.18
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.2
224 0.21
225 0.22
226 0.24
227 0.24
228 0.26
229 0.29
230 0.32
231 0.28
232 0.29
233 0.32
234 0.31
235 0.32
236 0.3
237 0.29
238 0.24
239 0.23
240 0.2
241 0.13
242 0.11
243 0.08
244 0.08
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.14
265 0.16
266 0.16
267 0.19
268 0.27
269 0.3
270 0.31
271 0.35
272 0.38
273 0.43
274 0.43
275 0.4
276 0.35
277 0.3
278 0.29
279 0.27
280 0.28
281 0.22
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.1
314 0.11
315 0.13
316 0.13
317 0.16
318 0.22
319 0.27
320 0.35
321 0.44
322 0.5
323 0.49
324 0.49
325 0.46
326 0.44
327 0.42
328 0.33
329 0.24
330 0.18
331 0.17
332 0.16
333 0.17
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.11
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.21
348 0.22
349 0.24
350 0.24
351 0.22
352 0.17
353 0.18
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.19
380 0.25
381 0.26
382 0.27
383 0.27
384 0.28
385 0.3
386 0.3
387 0.24
388 0.18
389 0.16
390 0.17
391 0.19
392 0.22
393 0.23
394 0.25
395 0.27
396 0.3
397 0.37
398 0.39
399 0.44
400 0.44
401 0.48
402 0.52
403 0.57
404 0.58
405 0.56
406 0.52
407 0.45
408 0.42
409 0.38