Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z1H6

Protein Details
Accession A0A1Y1Z1H6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
407-426ASIFKKRKEENDRRDKRQAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-415KRKE
419-421RRD
869-879GRGRGRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8, cyto 7.5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAMFRWLSQKYPKIVSRVIEERAKEIDGQTIPVDYTKPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEDKPAPKNEVEMMEAIFEYTERVVGMVRPRKLLYLAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKDMDKAEFAKMLRTQQINKGEDITVDDEAVAEKTWDSNAITPGTPFMHLLAKSLQFWCAKKLNTDPAWANMKVIISDASVPGEGEHKMMNFIRSQRAMPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFYDSKKERGCAKCGRKDHNTQICPYPDNAEKVDPNDEDLPSGKPFIWLHVNVLREYLIGEMDAPGRKFTYDQERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRDKGIDLLLEIWRGLVPTMDDYITLNGYPDMKQVQQIMEGLAKQEASIFKKRKEENDRRDKRQAERDSYGNRGGRGGNNNGNSGPPPFKRVKEDTSTYLNAGIPFFSPGDAQSKEVRNVHQDMMASRGQSNKSAAAQLKAIMKAKADGTTGEAQEEDSTSAPDSPVALGKRKADAIDDSDVGTPGRNTPIPHSSGGQENAPPVDSVRLWEDGYEERYYEQKFHVKPDDFEFRHTVARAYAEGLCWVLRYYMQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFKDIDKMVVKFNKGKPFKPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRDLMENPDSPIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVAILPFIDEKRLLDAMNTKYPELSDIENERNSTGREILMFSGEHKLTTAVEESFYSRKAGDIPALTLDPDHSDALHGKVEPYPGFIPNSALLPPWEEFDEFSHQAPGNEAGEEIYDSSTKVAYEMPHVDSKLAHKSVLLDGVKLPPKVVTEEEARNARNYRGGFNGRGRGRGGRGGGGGPRNYNNNGNNYNNGGNYNNGGNYNGGNSYNNARPPAFPYGDPRAAAGFNPAAPRWQGPPGVTQQSGLHGMPTPTQILGSLPPPPPGWVPPQHTLPSAGGYGGGNLDSYRPNDQRGGYGGYGGPPPPRDGGYGGGYGGQSGRGGGGYGGSYGVNDGGRGGSYGNVNQGYQARQHSGRGGGGGGGGGRGRGGYGGNSGYRGRGNPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.57
3 0.59
4 0.6
5 0.56
6 0.55
7 0.54
8 0.55
9 0.52
10 0.48
11 0.45
12 0.43
13 0.41
14 0.34
15 0.29
16 0.3
17 0.25
18 0.26
19 0.23
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.15
25 0.2
26 0.27
27 0.31
28 0.33
29 0.36
30 0.38
31 0.41
32 0.42
33 0.43
34 0.36
35 0.35
36 0.32
37 0.29
38 0.27
39 0.22
40 0.19
41 0.13
42 0.1
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.13
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.29
53 0.38
54 0.46
55 0.55
56 0.58
57 0.58
58 0.55
59 0.57
60 0.54
61 0.47
62 0.39
63 0.32
64 0.26
65 0.22
66 0.2
67 0.17
68 0.12
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.11
77 0.21
78 0.28
79 0.3
80 0.34
81 0.35
82 0.37
83 0.38
84 0.38
85 0.32
86 0.32
87 0.3
88 0.27
89 0.27
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.12
95 0.15
96 0.21
97 0.29
98 0.39
99 0.47
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.79
104 0.81
105 0.78
106 0.74
107 0.75
108 0.75
109 0.73
110 0.76
111 0.71
112 0.66
113 0.67
114 0.62
115 0.53
116 0.5
117 0.42
118 0.34
119 0.34
120 0.32
121 0.3
122 0.29
123 0.33
124 0.29
125 0.33
126 0.37
127 0.37
128 0.4
129 0.44
130 0.53
131 0.49
132 0.47
133 0.45
134 0.38
135 0.34
136 0.33
137 0.28
138 0.19
139 0.17
140 0.15
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.16
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.17
162 0.17
163 0.19
164 0.21
165 0.22
166 0.23
167 0.24
168 0.27
169 0.26
170 0.28
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.36
175 0.41
176 0.46
177 0.43
178 0.48
179 0.44
180 0.44
181 0.48
182 0.43
183 0.37
184 0.29
185 0.28
186 0.22
187 0.21
188 0.15
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.21
206 0.27
207 0.28
208 0.29
209 0.3
210 0.34
211 0.38
212 0.4
213 0.44
214 0.45
215 0.49
216 0.51
217 0.49
218 0.52
219 0.47
220 0.42
221 0.35
222 0.28
223 0.23
224 0.23
225 0.2
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.18
244 0.2
245 0.23
246 0.24
247 0.25
248 0.26
249 0.29
250 0.29
251 0.3
252 0.28
253 0.29
254 0.28
255 0.29
256 0.34
257 0.34
258 0.41
259 0.47
260 0.55
261 0.6
262 0.66
263 0.72
264 0.7
265 0.74
266 0.77
267 0.77
268 0.7
269 0.64
270 0.63
271 0.59
272 0.53
273 0.45
274 0.39
275 0.33
276 0.33
277 0.31
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.31
282 0.26
283 0.26
284 0.25
285 0.23
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.16
290 0.17
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.22
296 0.2
297 0.24
298 0.26
299 0.28
300 0.24
301 0.25
302 0.21
303 0.15
304 0.15
305 0.11
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.16
318 0.24
319 0.27
320 0.29
321 0.31
322 0.33
323 0.33
324 0.34
325 0.3
326 0.2
327 0.14
328 0.13
329 0.1
330 0.08
331 0.08
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.13
346 0.18
347 0.18
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.18
353 0.12
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.12
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.07
392 0.09
393 0.12
394 0.15
395 0.24
396 0.28
397 0.32
398 0.4
399 0.43
400 0.51
401 0.59
402 0.65
403 0.67
404 0.74
405 0.78
406 0.78
407 0.83
408 0.79
409 0.75
410 0.74
411 0.71
412 0.66
413 0.61
414 0.6
415 0.54
416 0.53
417 0.52
418 0.43
419 0.36
420 0.3
421 0.28
422 0.26
423 0.27
424 0.29
425 0.28
426 0.27
427 0.28
428 0.27
429 0.26
430 0.22
431 0.2
432 0.2
433 0.15
434 0.19
435 0.22
436 0.24
437 0.3
438 0.34
439 0.37
440 0.38
441 0.41
442 0.4
443 0.41
444 0.4
445 0.34
446 0.31
447 0.26
448 0.21
449 0.18
450 0.14
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.11
458 0.11
459 0.13
460 0.17
461 0.2
462 0.23
463 0.25
464 0.25
465 0.25
466 0.27
467 0.26
468 0.23
469 0.21
470 0.18
471 0.2
472 0.19
473 0.16
474 0.14
475 0.17
476 0.16
477 0.17
478 0.18
479 0.15
480 0.15
481 0.19
482 0.19
483 0.16
484 0.16
485 0.17
486 0.18
487 0.19
488 0.2
489 0.16
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.13
495 0.1
496 0.12
497 0.15
498 0.14
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.08
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.09
514 0.1
515 0.12
516 0.14
517 0.15
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.14
529 0.12
530 0.11
531 0.08
532 0.06
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.12
537 0.16
538 0.18
539 0.19
540 0.19
541 0.18
542 0.2
543 0.2
544 0.18
545 0.15
546 0.13
547 0.12
548 0.12
549 0.1
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.14
561 0.13
562 0.11
563 0.1
564 0.14
565 0.14
566 0.14
567 0.15
568 0.2
569 0.2
570 0.25
571 0.32
572 0.31
573 0.32
574 0.35
575 0.42
576 0.36
577 0.38
578 0.36
579 0.3
580 0.3
581 0.29
582 0.25
583 0.15
584 0.16
585 0.13
586 0.12
587 0.11
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.09
598 0.11
599 0.14
600 0.14
601 0.15
602 0.16
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.19
607 0.19
608 0.23
609 0.25
610 0.26
611 0.24
612 0.23
613 0.22
614 0.19
615 0.21
616 0.17
617 0.15
618 0.13
619 0.11
620 0.12
621 0.14
622 0.14
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.18
627 0.21
628 0.22
629 0.27
630 0.32
631 0.42
632 0.42
633 0.44
634 0.45
635 0.5
636 0.52
637 0.51
638 0.48
639 0.41
640 0.4
641 0.38
642 0.31
643 0.25
644 0.2
645 0.14
646 0.12
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.06
651 0.05
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.11
656 0.13
657 0.13
658 0.13
659 0.14
660 0.14
661 0.18
662 0.23
663 0.19
664 0.17
665 0.18
666 0.18
667 0.16
668 0.17
669 0.12
670 0.09
671 0.09
672 0.1
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.12
679 0.15
680 0.15
681 0.13
682 0.15
683 0.14
684 0.16
685 0.17
686 0.15
687 0.14
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.16
692 0.14
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.08
699 0.07
700 0.1
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.17
705 0.2
706 0.26
707 0.27
708 0.24
709 0.23
710 0.23
711 0.23
712 0.19
713 0.16
714 0.14
715 0.18
716 0.22
717 0.23
718 0.23
719 0.22
720 0.22
721 0.21
722 0.18
723 0.15
724 0.12
725 0.11
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.11
730 0.11
731 0.15
732 0.15
733 0.14
734 0.13
735 0.13
736 0.12
737 0.13
738 0.14
739 0.08
740 0.09
741 0.1
742 0.13
743 0.14
744 0.14
745 0.14
746 0.12
747 0.12
748 0.13
749 0.14
750 0.15
751 0.14
752 0.14
753 0.15
754 0.15
755 0.15
756 0.13
757 0.12
758 0.1
759 0.11
760 0.1
761 0.08
762 0.1
763 0.11
764 0.13
765 0.14
766 0.12
767 0.12
768 0.13
769 0.17
770 0.15
771 0.18
772 0.18
773 0.18
774 0.19
775 0.19
776 0.19
777 0.16
778 0.18
779 0.14
780 0.13
781 0.11
782 0.13
783 0.13
784 0.12
785 0.13
786 0.12
787 0.12
788 0.15
789 0.21
790 0.2
791 0.2
792 0.23
793 0.22
794 0.22
795 0.23
796 0.22
797 0.16
798 0.15
799 0.14
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.09
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.08
809 0.07
810 0.07
811 0.09
812 0.09
813 0.13
814 0.17
815 0.2
816 0.22
817 0.23
818 0.23
819 0.22
820 0.25
821 0.29
822 0.27
823 0.23
824 0.2
825 0.23
826 0.24
827 0.3
828 0.27
829 0.19
830 0.2
831 0.27
832 0.31
833 0.28
834 0.27
835 0.2
836 0.22
837 0.23
838 0.24
839 0.2
840 0.21
841 0.25
842 0.3
843 0.33
844 0.33
845 0.34
846 0.35
847 0.32
848 0.32
849 0.3
850 0.27
851 0.31
852 0.34
853 0.36
854 0.4
855 0.48
856 0.44
857 0.45
858 0.45
859 0.41
860 0.39
861 0.39
862 0.34
863 0.28
864 0.27
865 0.27
866 0.29
867 0.3
868 0.29
869 0.27
870 0.28
871 0.29
872 0.31
873 0.36
874 0.35
875 0.37
876 0.42
877 0.41
878 0.42
879 0.41
880 0.4
881 0.34
882 0.32
883 0.26
884 0.21
885 0.2
886 0.19
887 0.17
888 0.16
889 0.16
890 0.14
891 0.14
892 0.14
893 0.14
894 0.13
895 0.13
896 0.14
897 0.18
898 0.22
899 0.25
900 0.26
901 0.25
902 0.25
903 0.3
904 0.36
905 0.33
906 0.3
907 0.34
908 0.4
909 0.42
910 0.41
911 0.37
912 0.31
913 0.29
914 0.28
915 0.25
916 0.18
917 0.17
918 0.2
919 0.19
920 0.19
921 0.2
922 0.22
923 0.21
924 0.24
925 0.25
926 0.23
927 0.29
928 0.33
929 0.37
930 0.36
931 0.34
932 0.3
933 0.31
934 0.33
935 0.27
936 0.22
937 0.19
938 0.19
939 0.2
940 0.21
941 0.18
942 0.15
943 0.15
944 0.14
945 0.13
946 0.14
947 0.14
948 0.18
949 0.19
950 0.21
951 0.22
952 0.24
953 0.25
954 0.26
955 0.32
956 0.33
957 0.38
958 0.41
959 0.46
960 0.47
961 0.45
962 0.45
963 0.39
964 0.33
965 0.27
966 0.22
967 0.17
968 0.14
969 0.14
970 0.11
971 0.1
972 0.08
973 0.07
974 0.09
975 0.11
976 0.14
977 0.21
978 0.23
979 0.26
980 0.3
981 0.31
982 0.33
983 0.34
984 0.37
985 0.29
986 0.29
987 0.27
988 0.24
989 0.26
990 0.24
991 0.24
992 0.2
993 0.22
994 0.22
995 0.23
996 0.23
997 0.22
998 0.25
999 0.24
1000 0.24
1001 0.21
1002 0.21
1003 0.19
1004 0.18
1005 0.16
1006 0.12
1007 0.09
1008 0.08
1009 0.09
1010 0.07
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.08
1016 0.08
1017 0.07
1018 0.07
1019 0.07
1020 0.1
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.09
1026 0.09
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.12
1030 0.14
1031 0.19
1032 0.2
1033 0.19
1034 0.22
1035 0.26
1036 0.26
1037 0.28
1038 0.31
1039 0.32
1040 0.32
1041 0.35
1042 0.36
1043 0.36
1044 0.35
1045 0.31
1046 0.27
1047 0.21
1048 0.19
1049 0.17
1050 0.13
1051 0.1
1052 0.09
1053 0.08
1054 0.07
1055 0.07
1056 0.07
1057 0.07
1058 0.08
1059 0.08
1060 0.12
1061 0.16
1062 0.17
1063 0.2
1064 0.2
1065 0.22
1066 0.24