FuNGI

A0A1Y2A0X0

Protein Details

Accession

A0A1Y2A0X0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-294	SSPTNGTCKKSKKKEPVERTDPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
353-359	GRKKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKLFDKKNAQNFHLVYRAQNDPRIHDADAPDMVFKEVGAPNMRQASEPATGPAASQYSAASRRTKIKSRHELEEEFAAAVRKNEGEAANYGIFYDDTEYDYMQHMRDLGTGGGEAYFVEAPAQKKGKGKDKMDLADALRATSLDDRQSDAGLSMSSTGSRSASDFFGEDMAPSEFVRKTTYQDQQNIPDAIGGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDDDIFEKLAEDVVEVDPREWKASDWEDQDPMDRYLEGDEDAGWETDDTIKASSPTNGTCKKSKKKEPVERTDPDTLPAPDAAPALADEEDNAWLDEFDKFKKDSKAGKAPKPAAPSDLQSSILTGASALTAGGRKKKRKGAMTSTSGYSMTSSALHRTEGLTLLDHRFDKIEKEYADRIREEDEDEDFPDDASMMSGMSKMSGFSKMSGMSGMSNMSEAPQLRSDFDSIMDDFLGGHSMAGKRRVKKGGYQTGLEQLEEVRKGLGPARVKTQKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.64
3	0.6
4	0.51
5	0.43
6	0.41
7	0.46
8	0.41
9	0.47
10	0.44
11	0.42
12	0.47
13	0.47
14	0.44
15	0.4
16	0.38
17	0.35
18	0.35
19	0.3
20	0.25
21	0.22
22	0.21
23	0.17
24	0.14
25	0.16
26	0.15
27	0.19
28	0.22
29	0.22
30	0.27
31	0.32
32	0.33
33	0.27
34	0.28
35	0.28
36	0.27
37	0.26
38	0.23
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.19
43	0.16
44	0.13
45	0.13
46	0.12
47	0.16
48	0.2
49	0.24
50	0.26
51	0.29
52	0.38
53	0.45
54	0.53
55	0.57
56	0.64
57	0.71
58	0.72
59	0.77
60	0.75
61	0.7
62	0.64
63	0.58
64	0.48
65	0.37
66	0.32
67	0.25
68	0.18
69	0.17
70	0.15
71	0.11
72	0.11
73	0.14
74	0.14
75	0.15
76	0.15
77	0.19
78	0.18
79	0.18
80	0.17
81	0.14
82	0.13
83	0.11
84	0.13
85	0.09
86	0.1
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.15
92	0.13
93	0.13
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.07
103	0.07
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.07
109	0.1
110	0.11
111	0.18
112	0.2
113	0.22
114	0.28
115	0.35
116	0.43
117	0.49
118	0.51
119	0.52
120	0.57
121	0.56
122	0.53
123	0.51
124	0.42
125	0.37
126	0.34
127	0.27
128	0.19
129	0.17
130	0.15
131	0.14
132	0.15
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.16
138	0.15
139	0.13
140	0.11
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.11
164	0.1
165	0.11
166	0.14
167	0.13
168	0.17
169	0.24
170	0.32
171	0.35
172	0.41
173	0.43
174	0.44
175	0.48
176	0.44
177	0.37
178	0.3
179	0.24
180	0.19
181	0.16
182	0.12
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.12
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.03
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.05
219	0.06
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.12
229	0.14
230	0.18
231	0.2
232	0.21
233	0.21
234	0.21
235	0.22
236	0.2
237	0.18
238	0.14
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.09
260	0.1
261	0.12
262	0.18
263	0.23
264	0.26
265	0.32
266	0.41
267	0.49
268	0.57
269	0.65
270	0.69
271	0.75
272	0.83
273	0.86
274	0.86
275	0.85
276	0.79
277	0.75
278	0.71
279	0.6
280	0.5
281	0.43
282	0.33
283	0.26
284	0.23
285	0.17
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.1
305	0.13
306	0.14
307	0.19
308	0.24
309	0.29
310	0.34
311	0.42
312	0.51
313	0.56
314	0.62
315	0.67
316	0.67
317	0.65
318	0.62
319	0.54
320	0.47
321	0.41
322	0.36
323	0.31
324	0.28
325	0.25
326	0.21
327	0.2
328	0.17
329	0.15
330	0.12
331	0.08
332	0.07
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.07
338	0.1
339	0.18
340	0.26
341	0.33
342	0.41
343	0.5
344	0.57
345	0.63
346	0.7
347	0.72
348	0.73
349	0.73
350	0.68
351	0.61
352	0.54
353	0.45
354	0.36
355	0.27
356	0.18
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.13
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.15
366	0.15
367	0.15
368	0.13
369	0.15
370	0.17
371	0.2
372	0.19
373	0.18
374	0.18
375	0.18
376	0.2
377	0.21
378	0.26
379	0.24
380	0.29
381	0.35
382	0.4
383	0.43
384	0.4
385	0.38
386	0.34
387	0.34
388	0.31
389	0.26
390	0.23
391	0.21
392	0.21
393	0.21
394	0.18
395	0.17
396	0.14
397	0.12
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.08
409	0.12
410	0.13
411	0.14
412	0.17
413	0.17
414	0.17
415	0.17
416	0.16
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.1
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.12
425	0.12
426	0.15
427	0.19
428	0.2
429	0.22
430	0.24
431	0.25
432	0.22
433	0.22
434	0.22
435	0.18
436	0.18
437	0.16
438	0.13
439	0.12
440	0.11
441	0.12
442	0.08
443	0.07
444	0.1
445	0.13
446	0.18
447	0.26
448	0.33
449	0.38
450	0.46
451	0.54
452	0.54
453	0.6
454	0.67
455	0.69
456	0.67
457	0.64
458	0.59
459	0.6
460	0.58
461	0.48
462	0.38
463	0.3
464	0.3
465	0.28
466	0.26
467	0.18
468	0.17
469	0.19
470	0.23
471	0.28
472	0.29
473	0.31
474	0.41

A0A1Y2A0X0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer