Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YCT8

Protein Details
Accession A0A1Y1YCT8    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128APSQQRAQPQHQHQHQPPKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 7, nucl 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDATLPRDRGHSAHAPGFGQTPDAFAGLGGGAAADDDDAIDFDDTYDGLGDRLDEADDAFNDDTFGRGPASQQSIGKDFDFAGQTSKISNTIQEEQMLYQARQAPSQQRAQPQHQHQHQPPKPSKPSRTGYESYHDPNYIPQLEARADIWGLKPKQPTAPTRPPENQAPPPEPQPARKIVSLEEVEAMIRAQTLQQERAAMQMQQQQQQQAQQSQPPHVPAYPQQQVPHGQLHFPGIPGQGQFVPHILQRPQQVQQQAQQQPPQQRSGSRPQQVHAELPAHSVQTPPTQHPTILQRQRPPPNDPAIQQQRNAQPQSAPQRPPSQPRQILQNPSRLSGQGQSMVQPGMQAPQGPRGSGHNRGPSYPGMVVTNPEQLLHLSKEDREAFLAEDAKRAKRNHKIAQLSKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLMTATGNLDEQSPETVLAEDFYYQVFSQIRGAPRQTPHQPASQFAQTYLFQTNNRYGAGRRQGRGADNHMQRMEQQVQRAVEAAKAKPKAKQLTIEGSLGKISFSNSKTPRPLLSMKRPVSHDQHPHKPKVSVADRKETLRNIENVYMTLMRMEDHERTIPGQLSQDSSPEVIQKHMEWRTKIEALHKQLWEDIKIMEPINPASLTPHPFIAILSHAKGKKAIPRIFRHIDEQERITILTMVVVHLDKLNVVSHGVATPEQPLSPAMRDEIELFLHSVVPPLYAHIFESPLNIIIGLLGLILERTNVHIVARTKVGMSLLIMLISRAELLKEPPEINVVDWENWTTLYNRLFDSVEPVLPAIFPGSINDTDDMYVWQFLAAMGVGASPEQQQRLVLGVKDRVMETVGVSKALPPEMASARLANVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.34
4 0.34
5 0.38
6 0.4
7 0.38
8 0.37
9 0.38
10 0.31
11 0.26
12 0.2
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.11
18 0.11
19 0.08
20 0.08
21 0.05
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.04
26 0.03
27 0.03
28 0.03
29 0.03
30 0.04
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.1
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.17
62 0.22
63 0.25
64 0.27
65 0.3
66 0.32
67 0.35
68 0.33
69 0.28
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.16
81 0.2
82 0.22
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.25
88 0.3
89 0.3
90 0.24
91 0.24
92 0.29
93 0.28
94 0.29
95 0.33
96 0.36
97 0.38
98 0.47
99 0.48
100 0.51
101 0.57
102 0.63
103 0.68
104 0.7
105 0.75
106 0.75
107 0.79
108 0.77
109 0.81
110 0.77
111 0.78
112 0.76
113 0.77
114 0.79
115 0.79
116 0.79
117 0.77
118 0.79
119 0.75
120 0.75
121 0.69
122 0.63
123 0.59
124 0.57
125 0.52
126 0.48
127 0.42
128 0.34
129 0.33
130 0.36
131 0.31
132 0.26
133 0.22
134 0.22
135 0.22
136 0.23
137 0.21
138 0.16
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.22
143 0.24
144 0.27
145 0.31
146 0.32
147 0.39
148 0.44
149 0.5
150 0.51
151 0.59
152 0.59
153 0.64
154 0.66
155 0.63
156 0.66
157 0.65
158 0.63
159 0.59
160 0.58
161 0.53
162 0.52
163 0.56
164 0.5
165 0.47
166 0.45
167 0.45
168 0.45
169 0.43
170 0.41
171 0.34
172 0.39
173 0.35
174 0.3
175 0.24
176 0.21
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.11
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.22
191 0.23
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.28
196 0.32
197 0.34
198 0.34
199 0.34
200 0.38
201 0.38
202 0.37
203 0.35
204 0.34
205 0.35
206 0.36
207 0.37
208 0.35
209 0.32
210 0.27
211 0.27
212 0.28
213 0.34
214 0.35
215 0.36
216 0.34
217 0.36
218 0.39
219 0.39
220 0.39
221 0.32
222 0.27
223 0.25
224 0.28
225 0.24
226 0.21
227 0.2
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.17
239 0.16
240 0.19
241 0.22
242 0.26
243 0.29
244 0.32
245 0.36
246 0.34
247 0.38
248 0.44
249 0.46
250 0.46
251 0.47
252 0.48
253 0.51
254 0.51
255 0.51
256 0.43
257 0.41
258 0.43
259 0.48
260 0.52
261 0.51
262 0.5
263 0.46
264 0.51
265 0.49
266 0.45
267 0.37
268 0.3
269 0.23
270 0.25
271 0.24
272 0.17
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.17
277 0.19
278 0.19
279 0.24
280 0.24
281 0.24
282 0.27
283 0.33
284 0.37
285 0.43
286 0.46
287 0.48
288 0.55
289 0.64
290 0.65
291 0.64
292 0.6
293 0.58
294 0.56
295 0.5
296 0.51
297 0.53
298 0.51
299 0.47
300 0.47
301 0.47
302 0.5
303 0.5
304 0.41
305 0.32
306 0.36
307 0.44
308 0.45
309 0.41
310 0.38
311 0.45
312 0.47
313 0.54
314 0.55
315 0.56
316 0.54
317 0.52
318 0.58
319 0.56
320 0.62
321 0.58
322 0.58
323 0.49
324 0.45
325 0.45
326 0.36
327 0.31
328 0.24
329 0.22
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.11
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.16
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.21
347 0.25
348 0.3
349 0.35
350 0.34
351 0.34
352 0.35
353 0.37
354 0.32
355 0.31
356 0.24
357 0.2
358 0.14
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.1
371 0.11
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.18
380 0.13
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.25
385 0.27
386 0.32
387 0.37
388 0.45
389 0.49
390 0.55
391 0.62
392 0.62
393 0.68
394 0.67
395 0.6
396 0.53
397 0.47
398 0.39
399 0.3
400 0.25
401 0.18
402 0.12
403 0.15
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.18
411 0.19
412 0.21
413 0.21
414 0.24
415 0.23
416 0.23
417 0.22
418 0.21
419 0.15
420 0.13
421 0.1
422 0.07
423 0.08
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.05
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.13
446 0.15
447 0.17
448 0.19
449 0.21
450 0.22
451 0.28
452 0.3
453 0.33
454 0.34
455 0.37
456 0.36
457 0.33
458 0.35
459 0.32
460 0.27
461 0.22
462 0.22
463 0.17
464 0.19
465 0.19
466 0.17
467 0.14
468 0.16
469 0.19
470 0.17
471 0.17
472 0.16
473 0.15
474 0.21
475 0.29
476 0.32
477 0.3
478 0.32
479 0.34
480 0.36
481 0.38
482 0.37
483 0.37
484 0.35
485 0.38
486 0.35
487 0.32
488 0.3
489 0.33
490 0.32
491 0.25
492 0.24
493 0.25
494 0.25
495 0.25
496 0.25
497 0.2
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.2
502 0.24
503 0.25
504 0.28
505 0.36
506 0.38
507 0.38
508 0.41
509 0.39
510 0.41
511 0.43
512 0.4
513 0.33
514 0.28
515 0.25
516 0.2
517 0.16
518 0.09
519 0.08
520 0.12
521 0.13
522 0.22
523 0.24
524 0.29
525 0.33
526 0.35
527 0.35
528 0.35
529 0.41
530 0.4
531 0.48
532 0.53
533 0.52
534 0.55
535 0.57
536 0.57
537 0.55
538 0.55
539 0.54
540 0.52
541 0.59
542 0.62
543 0.63
544 0.61
545 0.56
546 0.5
547 0.5
548 0.51
549 0.5
550 0.47
551 0.51
552 0.5
553 0.52
554 0.54
555 0.47
556 0.42
557 0.37
558 0.36
559 0.3
560 0.31
561 0.28
562 0.25
563 0.25
564 0.2
565 0.16
566 0.13
567 0.11
568 0.08
569 0.09
570 0.12
571 0.11
572 0.13
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.17
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.14
581 0.16
582 0.16
583 0.16
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.15
588 0.14
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.21
593 0.27
594 0.32
595 0.3
596 0.33
597 0.38
598 0.39
599 0.4
600 0.4
601 0.41
602 0.42
603 0.48
604 0.44
605 0.4
606 0.4
607 0.4
608 0.34
609 0.27
610 0.21
611 0.17
612 0.18
613 0.18
614 0.17
615 0.16
616 0.15
617 0.16
618 0.15
619 0.13
620 0.14
621 0.17
622 0.19
623 0.19
624 0.18
625 0.17
626 0.17
627 0.17
628 0.15
629 0.15
630 0.14
631 0.14
632 0.2
633 0.21
634 0.21
635 0.24
636 0.26
637 0.29
638 0.37
639 0.42
640 0.44
641 0.5
642 0.58
643 0.62
644 0.61
645 0.6
646 0.56
647 0.57
648 0.52
649 0.47
650 0.4
651 0.35
652 0.33
653 0.27
654 0.21
655 0.14
656 0.12
657 0.1
658 0.08
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.11
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.14
682 0.15
683 0.13
684 0.13
685 0.14
686 0.15
687 0.15
688 0.14
689 0.13
690 0.13
691 0.12
692 0.12
693 0.11
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.1
699 0.11
700 0.11
701 0.12
702 0.12
703 0.14
704 0.13
705 0.15
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.11
710 0.1
711 0.08
712 0.08
713 0.05
714 0.04
715 0.03
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.04
720 0.04
721 0.06
722 0.08
723 0.09
724 0.09
725 0.15
726 0.17
727 0.2
728 0.22
729 0.21
730 0.19
731 0.2
732 0.2
733 0.15
734 0.14
735 0.14
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.1
740 0.09
741 0.08
742 0.08
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.1
747 0.14
748 0.17
749 0.18
750 0.18
751 0.21
752 0.21
753 0.2
754 0.24
755 0.23
756 0.2
757 0.21
758 0.21
759 0.19
760 0.19
761 0.19
762 0.15
763 0.17
764 0.19
765 0.2
766 0.19
767 0.21
768 0.21
769 0.2
770 0.25
771 0.22
772 0.2
773 0.19
774 0.18
775 0.16
776 0.15
777 0.15
778 0.1
779 0.08
780 0.07
781 0.08
782 0.13
783 0.14
784 0.16
785 0.17
786 0.16
787 0.16
788 0.16
789 0.16
790 0.13
791 0.13
792 0.11
793 0.1
794 0.09
795 0.08
796 0.09
797 0.07
798 0.05
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.05
803 0.06
804 0.09
805 0.12
806 0.13
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.19
811 0.22
812 0.21
813 0.24
814 0.27
815 0.29
816 0.3
817 0.3
818 0.26
819 0.25
820 0.22
821 0.19
822 0.21
823 0.19
824 0.18
825 0.18
826 0.2
827 0.21
828 0.21
829 0.2
830 0.14
831 0.19
832 0.21
833 0.23
834 0.22
835 0.21
836 0.21
837 0.24
838 0.23
839 0.18
840 0.2
841 0.19
842 0.18
843 0.18
844 0.16
845 0.13
846 0.13
847 0.13
848 0.09
849 0.08