FuNGI

B8PCV1

Protein Details

Accession

B8PCV1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1072-1094	LMTSSERRMKKDRTYRMRDDTTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, plas 6, cyto 5.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	ppl:POSPLDRAFT_103190 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MQMHIYGIDYNATKHEVKKAIADALHDEYFFDAMDPSTRQINFKVTLEMDDARGLRNTGQGTLMLPSLRSYNLYNRFKRWLAIDSNEIIVHNRPLRFRRSEADARRTDADYLKHEGAREEKVDAVREHIRADRVQFGVLFYPSGTGPRDLAFSSEWEYRRKHLVQPWIVVDYDNKKVRIELGDFSAGNLEAYIIINFAEIEKIGVGHDFGNVLMQFATHLRLIFPNEQELQHFRHHCQVVGLPTFSARLEAFTTSFFSRDKLQRLNALLLNGQLNTEELRRLRPHIEELHKPMPHQAADILRYFRLALSSDRTLNSNLEQCLARVAGERVSLFDHRNPKSVFFACQHVTFTPTRMILEGPTRVQSNSVIRKYWPHRDHFIRVDFLDENLSQYRFDREVDGPAFLHDHVGKVLKGGFEVAGSPFDYSPDSEMQPAVRMTADRIRGALGDLSEIKIPAKYAARIGQAFTSTMCSMPISRDQWEEIDEIWEDRENPRSHTDGVGRLSQALMDRIWDIVCNLYPDYGVYGVKPSAVQFRFLGKSFNTIVQKITHSSSPLGYKGVLAVDPQLSGERICFRPEMRKFKPLICPYCREGNLDFCPHENDQNLHIADIFDSPKRAYLTRDLVSILEDRGVHLKAFMDLQQEAKMKTYQARDSVTQFMDILQTHHMGFQFRLPRLLERLDSLGVDATRNQEADDFTRRVREHAIQHVLCDMKNRARIPVPRSYLLVGVADEGPAYTKQGYENVFQLGANQIFGPYILYTCSQALTARRGHHDFLQPAFNKVQMQNHSGSVAIVLLRGALRYILVMVRGASSWYFSYRELTVFLSAARCCYWETIPNRRADLPIRSYEERSCASFRCDLYYVFQYYQLLPTIHIAPASYNDIKPPGRPFDWTDVCDFITEYMHSDALHGSHDPRCMRLAELCSDAVDYPKTGRPVDMRTAPGKLMQYNPDWYADEDTNANPLADSYQSDRVLGHLYRGIKLGVIEPSERTPGISPEISLSTQRLNDSTSRVILPLVRGHLDGIPAALTGYQDVLPTFKVYLAELRCIAFTHSLSLKAGSFITEEEIVLGVILMTSSERRMKKDRTYRMRDDTTDLVQQIRRSLLSISGDTPSVDELRAGLRKAWAAWGLSVQNRKLYGAHSFGFIALGVIFDCLDKLAATTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.31
3	0.33
4	0.34
5	0.39
6	0.4
7	0.42
8	0.41
9	0.4
10	0.36
11	0.37
12	0.36
13	0.3
14	0.26
15	0.21
16	0.2
17	0.18
18	0.13
19	0.08
20	0.08
21	0.12
22	0.13
23	0.14
24	0.2
25	0.21
26	0.23
27	0.25
28	0.31
29	0.32
30	0.32
31	0.35
32	0.3
33	0.31
34	0.33
35	0.31
36	0.26
37	0.27
38	0.25
39	0.22
40	0.22
41	0.21
42	0.18
43	0.22
44	0.22
45	0.19
46	0.2
47	0.18
48	0.18
49	0.19
50	0.19
51	0.15
52	0.14
53	0.13
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.18
58	0.25
59	0.35
60	0.45
61	0.49
62	0.52
63	0.58
64	0.57
65	0.57
66	0.52
67	0.48
68	0.45
69	0.45
70	0.45
71	0.39
72	0.4
73	0.37
74	0.33
75	0.28
76	0.24
77	0.26
78	0.27
79	0.28
80	0.33
81	0.38
82	0.45
83	0.49
84	0.51
85	0.5
86	0.53
87	0.6
88	0.63
89	0.68
90	0.64
91	0.62
92	0.61
93	0.57
94	0.52
95	0.46
96	0.42
97	0.36
98	0.39
99	0.38
100	0.37
101	0.36
102	0.36
103	0.35
104	0.35
105	0.32
106	0.28
107	0.28
108	0.29
109	0.33
110	0.29
111	0.31
112	0.31
113	0.31
114	0.32
115	0.32
116	0.33
117	0.31
118	0.34
119	0.34
120	0.3
121	0.3
122	0.28
123	0.25
124	0.25
125	0.22
126	0.2
127	0.13
128	0.13
129	0.12
130	0.15
131	0.15
132	0.13
133	0.14
134	0.14
135	0.16
136	0.15
137	0.17
138	0.15
139	0.15
140	0.19
141	0.24
142	0.26
143	0.29
144	0.31
145	0.32
146	0.4
147	0.41
148	0.44
149	0.45
150	0.53
151	0.54
152	0.57
153	0.57
154	0.51
155	0.47
156	0.4
157	0.38
158	0.32
159	0.35
160	0.35
161	0.32
162	0.31
163	0.31
164	0.34
165	0.35
166	0.33
167	0.27
168	0.26
169	0.3
170	0.29
171	0.29
172	0.27
173	0.21
174	0.18
175	0.15
176	0.1
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.11
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.13
209	0.18
210	0.22
211	0.22
212	0.25
213	0.26
214	0.26
215	0.28
216	0.29
217	0.28
218	0.31
219	0.33
220	0.3
221	0.37
222	0.37
223	0.35
224	0.34
225	0.34
226	0.33
227	0.33
228	0.32
229	0.23
230	0.22
231	0.23
232	0.2
233	0.18
234	0.11
235	0.1
236	0.11
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.16
241	0.15
242	0.16
243	0.15
244	0.15
245	0.21
246	0.26
247	0.32
248	0.34
249	0.37
250	0.41
251	0.44
252	0.47
253	0.42
254	0.37
255	0.31
256	0.27
257	0.25
258	0.19
259	0.16
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.12
265	0.12
266	0.18
267	0.2
268	0.24
269	0.26
270	0.28
271	0.33
272	0.38
273	0.43
274	0.44
275	0.5
276	0.55
277	0.52
278	0.5
279	0.49
280	0.44
281	0.38
282	0.32
283	0.28
284	0.24
285	0.26
286	0.29
287	0.26
288	0.22
289	0.22
290	0.21
291	0.17
292	0.15
293	0.14
294	0.13
295	0.16
296	0.2
297	0.21
298	0.22
299	0.23
300	0.23
301	0.23
302	0.24
303	0.23
304	0.2
305	0.2
306	0.19
307	0.18
308	0.18
309	0.17
310	0.14
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.13
316	0.12
317	0.15
318	0.17
319	0.17
320	0.22
321	0.29
322	0.29
323	0.36
324	0.36
325	0.36
326	0.39
327	0.39
328	0.37
329	0.3
330	0.34
331	0.29
332	0.29
333	0.29
334	0.23
335	0.25
336	0.22
337	0.22
338	0.2
339	0.18
340	0.17
341	0.16
342	0.16
343	0.14
344	0.18
345	0.18
346	0.16
347	0.18
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.2
352	0.24
353	0.3
354	0.31
355	0.31
356	0.31
357	0.39
358	0.44
359	0.52
360	0.49
361	0.46
362	0.51
363	0.56
364	0.62
365	0.6
366	0.57
367	0.5
368	0.44
369	0.42
370	0.34
371	0.28
372	0.25
373	0.18
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.13
378	0.13
379	0.17
380	0.15
381	0.15
382	0.17
383	0.16
384	0.21
385	0.22
386	0.22
387	0.19
388	0.18
389	0.19
390	0.15
391	0.16
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.12
396	0.11
397	0.11
398	0.12
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.07
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.12
418	0.11
419	0.13
420	0.13
421	0.11
422	0.09
423	0.09
424	0.11
425	0.16
426	0.18
427	0.16
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.16
432	0.14
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.09
443	0.11
444	0.11
445	0.13
446	0.17
447	0.2
448	0.21
449	0.21
450	0.19
451	0.18
452	0.17
453	0.15
454	0.14
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.11
461	0.16
462	0.15
463	0.16
464	0.17
465	0.18
466	0.18
467	0.19
468	0.18
469	0.12
470	0.12
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.09
477	0.16
478	0.15
479	0.18
480	0.2
481	0.22
482	0.23
483	0.25
484	0.26
485	0.23
486	0.24
487	0.24
488	0.21
489	0.19
490	0.18
491	0.15
492	0.14
493	0.1
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.14
518	0.15
519	0.17
520	0.16
521	0.2
522	0.22
523	0.22
524	0.24
525	0.16
526	0.19
527	0.18
528	0.23
529	0.21
530	0.19
531	0.2
532	0.19
533	0.21
534	0.19
535	0.19
536	0.15
537	0.14
538	0.14
539	0.15
540	0.15
541	0.14
542	0.13
543	0.12
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.08
548	0.06
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.09
558	0.09
559	0.11
560	0.12
561	0.12
562	0.22
563	0.29
564	0.38
565	0.38
566	0.45
567	0.45
568	0.49
569	0.57
570	0.55
571	0.56
572	0.5
573	0.5
574	0.46
575	0.51
576	0.47
577	0.4
578	0.34
579	0.32
580	0.31
581	0.29
582	0.26
583	0.2
584	0.23
585	0.21
586	0.22
587	0.17
588	0.16
589	0.15
590	0.19
591	0.18
592	0.15
593	0.15
594	0.12
595	0.12
596	0.12
597	0.12
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.11
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.18
606	0.23
607	0.23
608	0.24
609	0.22
610	0.2
611	0.21
612	0.19
613	0.14
614	0.09
615	0.09
616	0.08
617	0.1
618	0.1
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.08
623	0.09
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.11
628	0.15
629	0.16
630	0.15
631	0.16
632	0.16
633	0.15
634	0.19
635	0.22
636	0.21
637	0.23
638	0.26
639	0.26
640	0.28
641	0.31
642	0.26
643	0.22
644	0.19
645	0.16
646	0.15
647	0.14
648	0.12
649	0.09
650	0.1
651	0.1
652	0.11
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.15
657	0.19
658	0.19
659	0.22
660	0.21
661	0.22
662	0.24
663	0.26
664	0.21
665	0.17
666	0.18
667	0.15
668	0.15
669	0.13
670	0.12
671	0.1
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.1
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.14
681	0.18
682	0.18
683	0.17
684	0.24
685	0.24
686	0.24
687	0.27
688	0.29
689	0.28
690	0.34
691	0.42
692	0.35
693	0.35
694	0.37
695	0.34
696	0.29
697	0.28
698	0.23
699	0.19
700	0.25
701	0.25
702	0.26
703	0.31
704	0.37
705	0.38
706	0.44
707	0.43
708	0.39
709	0.4
710	0.37
711	0.32
712	0.27
713	0.23
714	0.14
715	0.11
716	0.1
717	0.08
718	0.07
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.07
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.11
727	0.14
728	0.14
729	0.16
730	0.15
731	0.16
732	0.15
733	0.15
734	0.14
735	0.12
736	0.11
737	0.09
738	0.08
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.1
751	0.12
752	0.16
753	0.2
754	0.22
755	0.27
756	0.29
757	0.3
758	0.33
759	0.37
760	0.35
761	0.33
762	0.38
763	0.34
764	0.34
765	0.33
766	0.29
767	0.26
768	0.26
769	0.3
770	0.25
771	0.28
772	0.27
773	0.27
774	0.26
775	0.23
776	0.2
777	0.14
778	0.11
779	0.07
780	0.06
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.06
793	0.06
794	0.07
795	0.07
796	0.08
797	0.07
798	0.08
799	0.08
800	0.1
801	0.11
802	0.11
803	0.14
804	0.14
805	0.15
806	0.15
807	0.15
808	0.14
809	0.13
810	0.13
811	0.14
812	0.13
813	0.13
814	0.12
815	0.12
816	0.11
817	0.14
818	0.15
819	0.19
820	0.25
821	0.35
822	0.4
823	0.42
824	0.44
825	0.43
826	0.44
827	0.41
828	0.43
829	0.37
830	0.37
831	0.4
832	0.4
833	0.41
834	0.4
835	0.39
836	0.34
837	0.32
838	0.29
839	0.25
840	0.26
841	0.28
842	0.27
843	0.27
844	0.27
845	0.24
846	0.26
847	0.29
848	0.29
849	0.24
850	0.25
851	0.22
852	0.21
853	0.22
854	0.21
855	0.17
856	0.14
857	0.16
858	0.17
859	0.15
860	0.15
861	0.13
862	0.11
863	0.13
864	0.18
865	0.18
866	0.16
867	0.17
868	0.23
869	0.23
870	0.26
871	0.29
872	0.3
873	0.29
874	0.32
875	0.35
876	0.39
877	0.44
878	0.42
879	0.39
880	0.34
881	0.33
882	0.3
883	0.26
884	0.17
885	0.13
886	0.12
887	0.12
888	0.11
889	0.12
890	0.11
891	0.12
892	0.12
893	0.11
894	0.12
895	0.1
896	0.12
897	0.14
898	0.2
899	0.2
900	0.21
901	0.23
902	0.22
903	0.23
904	0.25
905	0.26
906	0.23
907	0.25
908	0.24
909	0.22
910	0.22
911	0.21
912	0.17
913	0.15
914	0.12
915	0.13
916	0.17
917	0.19
918	0.19
919	0.22
920	0.25
921	0.29
922	0.35
923	0.38
924	0.38
925	0.37
926	0.39
927	0.37
928	0.36
929	0.33
930	0.29
931	0.28
932	0.28
933	0.29
934	0.31
935	0.31
936	0.3
937	0.29
938	0.27
939	0.28
940	0.24
941	0.22
942	0.2
943	0.19
944	0.18
945	0.17
946	0.16
947	0.11
948	0.1
949	0.1
950	0.1
951	0.11
952	0.13
953	0.2
954	0.2
955	0.21
956	0.21
957	0.2
958	0.25
959	0.23
960	0.21
961	0.19
962	0.2
963	0.21
964	0.23
965	0.21
966	0.17
967	0.17
968	0.18
969	0.17
970	0.17
971	0.17
972	0.18
973	0.2
974	0.22
975	0.21
976	0.2
977	0.18
978	0.18
979	0.22
980	0.2
981	0.19
982	0.19
983	0.22
984	0.21
985	0.21
986	0.2
987	0.19
988	0.21
989	0.22
990	0.2
991	0.2
992	0.22
993	0.25
994	0.26
995	0.25
996	0.23
997	0.22
998	0.23
999	0.22
1000	0.22
1001	0.22
1002	0.22
1003	0.21
1004	0.2
1005	0.22
1006	0.22
1007	0.2
1008	0.17
1009	0.13
1010	0.1
1011	0.09
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.06
1015	0.06
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.11
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.19
1028	0.2
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.24
1032	0.22
1033	0.22
1034	0.24
1035	0.2
1036	0.18
1037	0.2
1038	0.2
1039	0.21
1040	0.22
1041	0.23
1042	0.21
1043	0.19
1044	0.19
1045	0.14
1046	0.13
1047	0.12
1048	0.14
1049	0.13
1050	0.12
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.08
1056	0.05
1057	0.04
1058	0.04
1059	0.03
1060	0.04
1061	0.06
1062	0.09
1063	0.17
1064	0.2
1065	0.27
1066	0.36
1067	0.44
1068	0.54
1069	0.63
1070	0.71
1071	0.74
1072	0.81
1073	0.84
1074	0.85
1075	0.84
1076	0.76
1077	0.72
1078	0.65
1079	0.59
1080	0.54
1081	0.46
1082	0.41
1083	0.37
1084	0.36
1085	0.33
1086	0.31
1087	0.27
1088	0.23
1089	0.24
1090	0.24
1091	0.25
1092	0.26
1093	0.24
1094	0.23
1095	0.24
1096	0.22
1097	0.22
1098	0.19
1099	0.15
1100	0.13
1101	0.11
1102	0.11
1103	0.17
1104	0.2
1105	0.21
1106	0.21
1107	0.23
1108	0.25
1109	0.25
1110	0.29
1111	0.26
1112	0.24
1113	0.24
1114	0.26
1115	0.28
1116	0.33
1117	0.38
1118	0.35
1119	0.37
1120	0.36
1121	0.37
1122	0.33
1123	0.31
1124	0.31
1125	0.3
1126	0.29
1127	0.27
1128	0.26
1129	0.25
1130	0.24
1131	0.2
1132	0.15
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.07
1136	0.06
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.07
1142	0.06

B8PCV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer