Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2A1F2

Protein Details
Accession A0A1Y2A1F2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-33IENTRKQSSKPRDRLKTSTAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 9, cyto 9, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016487  Lsm6/sSmF  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MLSHVAFRPKMEGIENTRKQSSKPRDRLKTSTASTLENGDSPSEEITVSHPVGYLHELRGSIVRVKLNSGHMFKGLLHSVDGFMNVAIENCREFQNGEEVRHWGDAFLRGNTVTYIAADKDITSEAPVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.48
4 0.52
5 0.5
6 0.5
7 0.54
8 0.56
9 0.57
10 0.61
11 0.67
12 0.72
13 0.79
14 0.82
15 0.78
16 0.75
17 0.67
18 0.64
19 0.55
20 0.47
21 0.41
22 0.37
23 0.31
24 0.23
25 0.21
26 0.14
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.18
55 0.21
56 0.21
57 0.19
58 0.18
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.15
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.19
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.25
87 0.26
88 0.27
89 0.26
90 0.17
91 0.15
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.11
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.11