FuNGI

A0A1Y1YVC2

Protein Details

Accession

A0A1Y1YVC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-137	RNRETDYQKRRFERRLSPERVD	Basic
191-217	VPNGGKTPPVDKKRKRRWGDSTEDNEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
201-207	DKKRKRR

Subcellular Location(s)

plas 16, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MSDADSLAVQRLQRERKDAKAGSSKSSSRPNGSTKQSLTEAFDKDLYHGNGAEKFAGYNTSIAANDDEDMEDAGEINGRRLVGQYTATKAQLNEFAHGDTEEPDILTSREEQAQIRNRETDYQKRRFERRLSPERVDPFAEGDGMSYKEVMKARDIEREEARVKRLIEEREAKGETGPLEYQGTLRDKDEVPNGGKTPPVDKKRKRRWGDSTEDNEAEPEKATTPEVKKSRWEKAEAPAAPAVRSRWDTATGPANAPRANGAAAVGATPAPAAGLQTPAHPSMPAPTTFAFGTDISSRNMPLSDEMLDMILPSEGYKILDPPPGYEPVRTAVGIPAQLPAGYQGFVMQESESGGMLGQQLPTAIPGVGELQFFKQEDMKYFGKLVDGADENELNMEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDGARQFGAGPLFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDMVRPYVHKLLVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRPDLDHQDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWHARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLRGLVEAIGDNLNDDQPKVRMVTALALAALAEAATPYGIESFDNILNPLWTGARRQRGKALATFLKAVGFIIPLMDEEYSNYYTGQIMEIVLREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCARTSGVTPTFLKNNVLNEFFKNFWVRRMAMDKRNYRQVVETTVDLAQKAGVSEIVGRIVLNMKDESENYRKMTVETIDKIISTLGAADVDDRLQDQLVDGILVAFQDQSIEDPIVLDGFATIINALGAERTKQYFPQICHVILARLNNKSATVRQQAADLISRITYVMNACGDHQLMNKLGGTLYEFLGEEYPEVLGSILGALRSIVAVVGLTSMEPPIRDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRVADRGADLVPPREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGYIAKAIGPQDVLATLLGNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKALSFMFEYIGEMAKDYVYAITPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGCVGLDCEDAMIHLLNLLWPNLFETSPHVIDRIIEAIDAIRNAVGTPLIMNYLLAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVQSADAMVPAYPAFDAPGEDKHGNRLPDLRRHELEIFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.52
3	0.58
4	0.67
5	0.64
6	0.65
7	0.67
8	0.65
9	0.62
10	0.64
11	0.61
12	0.57
13	0.64
14	0.61
15	0.57
16	0.6
17	0.61
18	0.62
19	0.65
20	0.67
21	0.59
22	0.59
23	0.56
24	0.52
25	0.5
26	0.48
27	0.43
28	0.37
29	0.37
30	0.32
31	0.31
32	0.36
33	0.32
34	0.27
35	0.26
36	0.27
37	0.28
38	0.29
39	0.28
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.18
44	0.16
45	0.13
46	0.12
47	0.14
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.11
56	0.11
57	0.1
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.15
69	0.14
70	0.19
71	0.22
72	0.25
73	0.29
74	0.3
75	0.31
76	0.3
77	0.31
78	0.33
79	0.32
80	0.29
81	0.27
82	0.26
83	0.24
84	0.24
85	0.21
86	0.15
87	0.15
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.14
96	0.17
97	0.19
98	0.2
99	0.28
100	0.37
101	0.42
102	0.44
103	0.45
104	0.43
105	0.5
106	0.55
107	0.57
108	0.57
109	0.61
110	0.66
111	0.71
112	0.78
113	0.78
114	0.8
115	0.8
116	0.8
117	0.81
118	0.8
119	0.77
120	0.77
121	0.73
122	0.68
123	0.59
124	0.49
125	0.41
126	0.34
127	0.29
128	0.2
129	0.16
130	0.15
131	0.14
132	0.14
133	0.12
134	0.11
135	0.15
136	0.18
137	0.19
138	0.21
139	0.26
140	0.28
141	0.36
142	0.39
143	0.4
144	0.4
145	0.46
146	0.46
147	0.44
148	0.45
149	0.41
150	0.39
151	0.4
152	0.43
153	0.41
154	0.45
155	0.48
156	0.48
157	0.5
158	0.51
159	0.45
160	0.38
161	0.37
162	0.29
163	0.25
164	0.22
165	0.16
166	0.17
167	0.16
168	0.16
169	0.2
170	0.23
171	0.2
172	0.21
173	0.23
174	0.23
175	0.26
176	0.31
177	0.31
178	0.3
179	0.33
180	0.34
181	0.31
182	0.32
183	0.29
184	0.33
185	0.36
186	0.43
187	0.49
188	0.58
189	0.68
190	0.77
191	0.87
192	0.87
193	0.87
194	0.88
195	0.86
196	0.86
197	0.84
198	0.8
199	0.76
200	0.69
201	0.59
202	0.49
203	0.41
204	0.32
205	0.23
206	0.17
207	0.11
208	0.11
209	0.13
210	0.2
211	0.22
212	0.31
213	0.35
214	0.36
215	0.44
216	0.5
217	0.58
218	0.56
219	0.58
220	0.53
221	0.56
222	0.64
223	0.55
224	0.52
225	0.46
226	0.41
227	0.37
228	0.34
229	0.28
230	0.23
231	0.24
232	0.23
233	0.22
234	0.25
235	0.25
236	0.27
237	0.33
238	0.3
239	0.3
240	0.31
241	0.32
242	0.28
243	0.27
244	0.25
245	0.18
246	0.17
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.08
262	0.08
263	0.1
264	0.13
265	0.14
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.15
270	0.18
271	0.17
272	0.18
273	0.17
274	0.19
275	0.19
276	0.19
277	0.16
278	0.13
279	0.15
280	0.15
281	0.16
282	0.16
283	0.17
284	0.16
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.08
297	0.06
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.07
304	0.09
305	0.11
306	0.16
307	0.16
308	0.18
309	0.2
310	0.25
311	0.26
312	0.24
313	0.23
314	0.21
315	0.23
316	0.2
317	0.18
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.14
322	0.12
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.08
328	0.08
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.11
359	0.12
360	0.12
361	0.15
362	0.15
363	0.17
364	0.23
365	0.23
366	0.22
367	0.22
368	0.22
369	0.19
370	0.18
371	0.15
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.08
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.08
385	0.1
386	0.13
387	0.14
388	0.15
389	0.19
390	0.24
391	0.27
392	0.35
393	0.41
394	0.44
395	0.49
396	0.5
397	0.47
398	0.49
399	0.49
400	0.46
401	0.45
402	0.43
403	0.43
404	0.45
405	0.45
406	0.42
407	0.48
408	0.51
409	0.45
410	0.42
411	0.4
412	0.39
413	0.43
414	0.41
415	0.32
416	0.23
417	0.21
418	0.21
419	0.2
420	0.17
421	0.12
422	0.1
423	0.11
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.09
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.13
444	0.14
445	0.13
446	0.17
447	0.19
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.17
460	0.16
461	0.17
462	0.18
463	0.19
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.14
468	0.14
469	0.14
470	0.12
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.06
476	0.04
477	0.03
478	0.04
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.09
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.14
490	0.14
491	0.15
492	0.14
493	0.12
494	0.1
495	0.08
496	0.07
497	0.05
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.09
510	0.14
511	0.14
512	0.15
513	0.19
514	0.2
515	0.22
516	0.23
517	0.2
518	0.15
519	0.16
520	0.16
521	0.14
522	0.13
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.04
532	0.04
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.02
538	0.03
539	0.03
540	0.04
541	0.06
542	0.08
543	0.11
544	0.16
545	0.2
546	0.22
547	0.26
548	0.36
549	0.45
550	0.52
551	0.57
552	0.58
553	0.6
554	0.65
555	0.64
556	0.61
557	0.52
558	0.46
559	0.44
560	0.38
561	0.34
562	0.27
563	0.24
564	0.18
565	0.16
566	0.13
567	0.08
568	0.06
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.04
605	0.03
606	0.02
607	0.02
608	0.02
609	0.02
610	0.02
611	0.02
612	0.02
613	0.03
614	0.03
615	0.04
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.06
626	0.09
627	0.14
628	0.23
629	0.25
630	0.26
631	0.31
632	0.35
633	0.37
634	0.36
635	0.37
636	0.31
637	0.3
638	0.3
639	0.25
640	0.21
641	0.18
642	0.15
643	0.09
644	0.06
645	0.05
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.05
653	0.08
654	0.08
655	0.09
656	0.09
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.08
661	0.06
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.11
674	0.13
675	0.13
676	0.13
677	0.14
678	0.16
679	0.14
680	0.16
681	0.14
682	0.13
683	0.16
684	0.23
685	0.25
686	0.24
687	0.24
688	0.23
689	0.24
690	0.23
691	0.22
692	0.19
693	0.17
694	0.19
695	0.21
696	0.21
697	0.21
698	0.21
699	0.22
700	0.19
701	0.21
702	0.21
703	0.22
704	0.22
705	0.22
706	0.23
707	0.21
708	0.22
709	0.22
710	0.2
711	0.2
712	0.23
713	0.22
714	0.23
715	0.3
716	0.34
717	0.38
718	0.46
719	0.5
720	0.5
721	0.58
722	0.56
723	0.49
724	0.46
725	0.4
726	0.36
727	0.3
728	0.26
729	0.19
730	0.21
731	0.2
732	0.16
733	0.15
734	0.1
735	0.09
736	0.08
737	0.06
738	0.05
739	0.04
740	0.05
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.05
745	0.06
746	0.08
747	0.09
748	0.1
749	0.09
750	0.1
751	0.11
752	0.12
753	0.18
754	0.2
755	0.22
756	0.22
757	0.24
758	0.23
759	0.23
760	0.25
761	0.22
762	0.22
763	0.21
764	0.22
765	0.2
766	0.2
767	0.19
768	0.16
769	0.13
770	0.08
771	0.06
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.03
793	0.03
794	0.03
795	0.03
796	0.04
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.06
804	0.05
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.03
813	0.03
814	0.04
815	0.04
816	0.05
817	0.07
818	0.1
819	0.11
820	0.12
821	0.2
822	0.24
823	0.26
824	0.33
825	0.35
826	0.33
827	0.33
828	0.33
829	0.28
830	0.25
831	0.28
832	0.25
833	0.23
834	0.24
835	0.23
836	0.24
837	0.24
838	0.25
839	0.26
840	0.27
841	0.27
842	0.27
843	0.28
844	0.27
845	0.27
846	0.26
847	0.19
848	0.15
849	0.12
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.07
855	0.09
856	0.09
857	0.1
858	0.1
859	0.12
860	0.12
861	0.12
862	0.13
863	0.14
864	0.14
865	0.14
866	0.14
867	0.12
868	0.12
869	0.11
870	0.11
871	0.1
872	0.1
873	0.09
874	0.09
875	0.09
876	0.1
877	0.1
878	0.08
879	0.07
880	0.07
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.03
895	0.03
896	0.03
897	0.03
898	0.03
899	0.03
900	0.03
901	0.04
902	0.05
903	0.05
904	0.05
905	0.06
906	0.08
907	0.09
908	0.1
909	0.12
910	0.17
911	0.2
912	0.22
913	0.24
914	0.24
915	0.29
916	0.35
917	0.44
918	0.45
919	0.49
920	0.51
921	0.57
922	0.61
923	0.63
924	0.61
925	0.6
926	0.57
927	0.52
928	0.5
929	0.42
930	0.35
931	0.27
932	0.23
933	0.14
934	0.11
935	0.08
936	0.07
937	0.06
938	0.05
939	0.07
940	0.06
941	0.09
942	0.1
943	0.13
944	0.13
945	0.16
946	0.18
947	0.21
948	0.21
949	0.21
950	0.27
951	0.26
952	0.27
953	0.24
954	0.23
955	0.24
956	0.24
957	0.24
958	0.17
959	0.18
960	0.22
961	0.21
962	0.24
963	0.21
964	0.27
965	0.33
966	0.43
967	0.49
968	0.5
969	0.59
970	0.65
971	0.71
972	0.67
973	0.59
974	0.51
975	0.41
976	0.38
977	0.29
978	0.21
979	0.13
980	0.14
981	0.14
982	0.13
983	0.13
984	0.11
985	0.11
986	0.1
987	0.09
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.09
993	0.09
994	0.09
995	0.11
996	0.13
997	0.14
998	0.21
999	0.24
1000	0.3
1001	0.33
1002	0.37
1003	0.37
1004	0.35
1005	0.34
1006	0.28
1007	0.25
1008	0.19
1009	0.15
1010	0.11
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.07
1014	0.06
1015	0.04
1016	0.04
1017	0.04
1018	0.05
1019	0.05
1020	0.06
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.11
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.18
1028	0.17
1029	0.17
1030	0.17
1031	0.18
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.23
1035	0.25
1036	0.26
1037	0.24
1038	0.25
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.17
1042	0.14
1043	0.11
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.11
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.1
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.07
1061	0.08
1062	0.07
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.14
1075	0.18
1076	0.21
1077	0.22
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.22
1081	0.27
1082	0.3
1083	0.26
1084	0.27
1085	0.26
1086	0.25
1087	0.26
1088	0.25
1089	0.19
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.1
1093	0.09
1094	0.08
1095	0.07
1096	0.07
1097	0.06
1098	0.06
1099	0.06
1100	0.05
1101	0.06
1102	0.06
1103	0.06
1104	0.06
1105	0.06
1106	0.08
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.09
1110	0.09
1111	0.11
1112	0.12
1113	0.12
1114	0.11
1115	0.16
1116	0.21
1117	0.23
1118	0.24
1119	0.22
1120	0.21
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.2
1124	0.14
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.12
1128	0.13
1129	0.13
1130	0.11
1131	0.09
1132	0.09
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.08
1136	0.06
1137	0.07
1138	0.07
1139	0.08
1140	0.08
1141	0.08
1142	0.08
1143	0.08
1144	0.08
1145	0.07
1146	0.07
1147	0.09
1148	0.12
1149	0.14
1150	0.18
1151	0.21
1152	0.27
1153	0.36
1154	0.44
1155	0.48
1156	0.55
1157	0.62
1158	0.67
1159	0.74
1160	0.74
1161	0.7
1162	0.65
1163	0.66
1164	0.6
1165	0.56
1166	0.48
1167	0.38
1168	0.33
1169	0.28
1170	0.25
1171	0.17
1172	0.12
1173	0.09
1174	0.08
1175	0.08
1176	0.07
1177	0.07
1178	0.07
1179	0.07
1180	0.08
1181	0.08
1182	0.1
1183	0.12
1184	0.16
1185	0.22
1186	0.24
1187	0.25
1188	0.32
1189	0.37
1190	0.36
1191	0.37
1192	0.42
1193	0.43
1194	0.5
1195	0.57
1196	0.58
1197	0.55
1198	0.59

A0A1Y1YVC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer