Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YGF5

Protein Details
Accession A0A1Y1YGF5    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-103HSTSSKSKSKSKSKSRAEDENEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-96RKRKRATHSHSHSTSSKSKSKSKSKS
253-265RDKEGRRERRAGK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences ALFHEERIVQYVSLPPASLSTPLPSLCASLFSPLLLTYFPPARGIVLAYRDVELSSEPPSPASSQDAQPSRKRKRATHSHSHSTSSKSKSKSKSKSRAEDENEEGKPLLCAIHDEYSSPFLWASASFLIFRPVAHAIIPCHIVHQFSSHVALSYLNSFPVSVLKTQVPKSWTWNTYSNTSTSHTNKYNGTQEGGSEGEGYWTDSDGMPIPNVLEIRIRDFEVKSGGGRAGKGHFGIEGSLINREEELAREQARDKEGRRERRAGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.14
20 0.12
21 0.13
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.27
53 0.32
54 0.36
55 0.43
56 0.52
57 0.56
58 0.6
59 0.64
60 0.63
61 0.67
62 0.73
63 0.74
64 0.75
65 0.75
66 0.77
67 0.73
68 0.71
69 0.64
70 0.58
71 0.57
72 0.52
73 0.5
74 0.45
75 0.51
76 0.56
77 0.64
78 0.68
79 0.72
80 0.76
81 0.79
82 0.84
83 0.82
84 0.82
85 0.77
86 0.73
87 0.67
88 0.63
89 0.54
90 0.45
91 0.39
92 0.29
93 0.23
94 0.17
95 0.12
96 0.05
97 0.07
98 0.08
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.13
106 0.1
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.08
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.08
149 0.1
150 0.13
151 0.17
152 0.18
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.28
157 0.33
158 0.32
159 0.32
160 0.38
161 0.37
162 0.39
163 0.39
164 0.34
165 0.28
166 0.29
167 0.3
168 0.27
169 0.31
170 0.3
171 0.32
172 0.32
173 0.35
174 0.39
175 0.34
176 0.33
177 0.27
178 0.23
179 0.23
180 0.22
181 0.17
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.19
204 0.2
205 0.21
206 0.22
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.17
234 0.19
235 0.2
236 0.22
237 0.26
238 0.3
239 0.35
240 0.4
241 0.4
242 0.45
243 0.54
244 0.62
245 0.67