Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZTD5

Protein Details
Accession A0A1Y1ZTD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-145TAQSAKNRRSNHNRQRKGKGAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSSHPPKRQRLNGSFSPASPPYHQAVKPNDHHTKPIVHPNTPTSPPYMSTNPQPNGGFPATATAPSTEMTPPSSVSMSQQVSQLGASASNPLPFPTPSSTTGVAFANIDSDGDVAMAEDGNDDTAQSAKNRRSNHNRQRKGKGAVLFGERGPIDGLLFKLHENEHPNSRPHGSQNLFDLYGLNNVAATVARTDPVTGEKINKLRKSYEGHIKQLHISGRPKANKIEGALTDPLRMPDEEWQSQKITGKDMKNAFNDSGSALSKNFDSLLSGALTGTAPGALPNPETQRYRTYIGTDEVKPKPGGTEGMSAGRVLQPNPGTPFSSAPSPAPRSMRPERSGAKRSYQDTSFVGYSEGFADDADSTAGEEAGPKKKQKFGFGAAHPMGMVGGVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.63
3 0.61
4 0.52
5 0.48
6 0.42
7 0.39
8 0.34
9 0.39
10 0.4
11 0.41
12 0.47
13 0.52
14 0.56
15 0.62
16 0.67
17 0.61
18 0.64
19 0.59
20 0.59
21 0.55
22 0.59
23 0.55
24 0.5
25 0.51
26 0.53
27 0.56
28 0.52
29 0.48
30 0.41
31 0.37
32 0.35
33 0.37
34 0.36
35 0.33
36 0.38
37 0.46
38 0.43
39 0.47
40 0.45
41 0.41
42 0.42
43 0.39
44 0.31
45 0.21
46 0.23
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.12
55 0.12
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.14
62 0.15
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.23
67 0.21
68 0.21
69 0.2
70 0.19
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.15
80 0.14
81 0.18
82 0.18
83 0.21
84 0.23
85 0.27
86 0.27
87 0.26
88 0.27
89 0.24
90 0.2
91 0.17
92 0.14
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.15
115 0.21
116 0.27
117 0.32
118 0.41
119 0.5
120 0.61
121 0.69
122 0.74
123 0.78
124 0.81
125 0.85
126 0.84
127 0.79
128 0.73
129 0.66
130 0.59
131 0.52
132 0.47
133 0.4
134 0.32
135 0.29
136 0.23
137 0.19
138 0.16
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.25
152 0.28
153 0.3
154 0.31
155 0.32
156 0.3
157 0.28
158 0.33
159 0.28
160 0.26
161 0.28
162 0.27
163 0.25
164 0.23
165 0.21
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.15
186 0.21
187 0.27
188 0.29
189 0.3
190 0.3
191 0.34
192 0.37
193 0.39
194 0.43
195 0.42
196 0.45
197 0.45
198 0.45
199 0.41
200 0.39
201 0.36
202 0.3
203 0.28
204 0.28
205 0.33
206 0.35
207 0.36
208 0.35
209 0.36
210 0.32
211 0.31
212 0.3
213 0.23
214 0.23
215 0.24
216 0.22
217 0.2
218 0.18
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.15
224 0.21
225 0.23
226 0.24
227 0.26
228 0.25
229 0.27
230 0.31
231 0.25
232 0.25
233 0.28
234 0.28
235 0.33
236 0.37
237 0.4
238 0.39
239 0.41
240 0.36
241 0.3
242 0.28
243 0.22
244 0.19
245 0.15
246 0.13
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.11
270 0.15
271 0.2
272 0.22
273 0.24
274 0.28
275 0.31
276 0.33
277 0.31
278 0.3
279 0.29
280 0.31
281 0.33
282 0.32
283 0.36
284 0.35
285 0.38
286 0.35
287 0.32
288 0.29
289 0.26
290 0.25
291 0.2
292 0.22
293 0.2
294 0.23
295 0.23
296 0.21
297 0.2
298 0.21
299 0.19
300 0.15
301 0.19
302 0.18
303 0.22
304 0.26
305 0.27
306 0.26
307 0.26
308 0.28
309 0.24
310 0.27
311 0.24
312 0.23
313 0.29
314 0.32
315 0.35
316 0.38
317 0.39
318 0.43
319 0.51
320 0.57
321 0.52
322 0.56
323 0.59
324 0.63
325 0.68
326 0.64
327 0.64
328 0.61
329 0.62
330 0.6
331 0.54
332 0.49
333 0.42
334 0.43
335 0.35
336 0.28
337 0.26
338 0.19
339 0.19
340 0.16
341 0.14
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.09
354 0.14
355 0.22
356 0.28
357 0.34
358 0.39
359 0.47
360 0.52
361 0.57
362 0.6
363 0.6
364 0.64
365 0.62
366 0.67
367 0.6
368 0.55
369 0.46
370 0.38
371 0.29
372 0.2