Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZQ20

Protein Details
Accession A0A1Y1ZQ20    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-345SSGRSYSRSRSRSPRSERSYRRGGRDRSRSRTRSRSRSYRSGESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-337KTRSLGSERSGRGRGYREGSESSGRSYSRSRSRSPRSERSYRRGGRDRSRSRTRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPSYSSHKADASKLLDDRGYGGRLIRGQNPAILFESGVRNRIIQSYYWKEQCFGLNEATLCDRAAQLKYIGGTTGVNGKPTPFLCLAFKLCQLVPEEGVVREMLNFEVDEDEDDENDNGEHGKREAEAEGNGGIENDETEEGAPPTALANIPLPLDPEATGRRGAFKYLRCLAAFYIRLAWEPVAIHQTLEPLLSDYRKIKRKTKEGYAMTYIDQFVDDLLTKERVCATSLWRMPPRSQLEDLDLLEQRVSPLQGEVDMLDGSDGEGVEEVGGRSRSKTRSLGSERSGRGRGYREGSESSGRSYSRSRSRSPRSERSYRRGGRDRSRSRTRSRSRSYRSGESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.42
4 0.35
5 0.32
6 0.32
7 0.28
8 0.25
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.25
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.31
17 0.34
18 0.33
19 0.31
20 0.29
21 0.26
22 0.21
23 0.19
24 0.26
25 0.24
26 0.26
27 0.24
28 0.22
29 0.23
30 0.26
31 0.25
32 0.19
33 0.27
34 0.33
35 0.4
36 0.45
37 0.44
38 0.42
39 0.43
40 0.45
41 0.4
42 0.34
43 0.29
44 0.26
45 0.26
46 0.27
47 0.26
48 0.21
49 0.17
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.2
69 0.2
70 0.24
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.23
75 0.26
76 0.24
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.23
81 0.24
82 0.22
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.15
87 0.16
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.15
152 0.14
153 0.17
154 0.19
155 0.2
156 0.25
157 0.26
158 0.29
159 0.25
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.23
164 0.17
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.14
186 0.21
187 0.29
188 0.34
189 0.41
190 0.48
191 0.57
192 0.62
193 0.67
194 0.69
195 0.65
196 0.65
197 0.6
198 0.53
199 0.44
200 0.39
201 0.3
202 0.2
203 0.16
204 0.11
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.23
219 0.26
220 0.32
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.45
225 0.47
226 0.43
227 0.42
228 0.37
229 0.36
230 0.37
231 0.36
232 0.31
233 0.25
234 0.21
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.11
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.19
265 0.22
266 0.27
267 0.32
268 0.32
269 0.41
270 0.48
271 0.53
272 0.53
273 0.59
274 0.56
275 0.57
276 0.58
277 0.49
278 0.46
279 0.43
280 0.44
281 0.4
282 0.4
283 0.38
284 0.38
285 0.4
286 0.41
287 0.38
288 0.35
289 0.34
290 0.31
291 0.3
292 0.31
293 0.36
294 0.4
295 0.45
296 0.5
297 0.56
298 0.66
299 0.74
300 0.79
301 0.81
302 0.8
303 0.85
304 0.86
305 0.84
306 0.85
307 0.81
308 0.82
309 0.81
310 0.82
311 0.82
312 0.84
313 0.86
314 0.85
315 0.88
316 0.86
317 0.86
318 0.88
319 0.88
320 0.87
321 0.88
322 0.89
323 0.87
324 0.89
325 0.87