Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8P308

Protein Details
Accession B8P308    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-43MLVVDHRKRKHARDMKDHPWLABasic
551-572SSEAPTRYRRRSQSPPPRSSTGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 9, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_97085  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MVEKYAWAEEDAAALCEFLEPMLVVDHRKRKHARDMKDHPWLAVDMDSEELWKWRAISTVAFKISGVNASLVCAPGVCFAGAGDRRAEFDWLNFAGPRAFSESHSTVAMAASPLADSGDAHPQEKWNAMDEQSHDVAMAAPADADANGGHHPSKDRAASQAADNADYARGGSAAGDVADAALSSKSDVGYRGEKQVKLLARRLAFVTHSLTASALMAPVTTAPPPTRPVQPNKVYIGGLPEHTRREDLESCFGKIGSIVNIELKVGYGFVEFETREAAEESVAKYHEGYFMGNKIRVELSHGGGRTAKYSGDPGACFKCGQLGHWARECPNHLSTSRRSSHHPSDAPLIDRIQPPRDYPAPPRDYPPYRDEYRYPPAPPRDARYGYDYPPPPPPGRDYRRPPTPPREYRDYPPPPARSARDYDDYRMRGPPPPPLPPPARYESRPGYYAPDADVPPPGYPPRGYPPPPPRDYYDRYDRRAAPPADRYASYPPPPAARPRTPPGGPSARSRDDYERPPRDYVAPAADVRGRPASPPPPTSSRYAEYPARAGSSEAPTRYRRRSQSPPPRSSTGAYEAGYSGSGGAPYNGNSSGGYAGAGGGYTNGSSAAPPRGSGSGRDYPARSSRDVEPSASYRRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.06
6 0.07
7 0.05
8 0.06
9 0.09
10 0.1
11 0.14
12 0.23
13 0.32
14 0.34
15 0.44
16 0.51
17 0.56
18 0.66
19 0.71
20 0.73
21 0.75
22 0.82
23 0.81
24 0.84
25 0.78
26 0.66
27 0.6
28 0.5
29 0.4
30 0.33
31 0.24
32 0.14
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.15
43 0.16
44 0.22
45 0.27
46 0.33
47 0.34
48 0.33
49 0.32
50 0.31
51 0.31
52 0.26
53 0.2
54 0.14
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.13
59 0.12
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.16
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.21
73 0.22
74 0.24
75 0.17
76 0.16
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.26
89 0.27
90 0.26
91 0.27
92 0.25
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.1
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.07
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.21
110 0.23
111 0.26
112 0.25
113 0.19
114 0.21
115 0.21
116 0.24
117 0.25
118 0.28
119 0.25
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.12
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.12
139 0.15
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.23
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.28
148 0.24
149 0.22
150 0.21
151 0.18
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.11
176 0.16
177 0.18
178 0.27
179 0.31
180 0.31
181 0.32
182 0.36
183 0.39
184 0.38
185 0.42
186 0.39
187 0.35
188 0.36
189 0.35
190 0.31
191 0.26
192 0.24
193 0.22
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.23
214 0.28
215 0.36
216 0.44
217 0.48
218 0.51
219 0.51
220 0.51
221 0.43
222 0.37
223 0.33
224 0.25
225 0.21
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.17
232 0.21
233 0.24
234 0.24
235 0.3
236 0.29
237 0.3
238 0.29
239 0.28
240 0.22
241 0.18
242 0.16
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.13
278 0.15
279 0.16
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.18
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.14
293 0.13
294 0.11
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.13
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.21
309 0.24
310 0.26
311 0.29
312 0.3
313 0.26
314 0.29
315 0.31
316 0.25
317 0.22
318 0.22
319 0.2
320 0.24
321 0.27
322 0.32
323 0.34
324 0.32
325 0.35
326 0.39
327 0.45
328 0.48
329 0.45
330 0.39
331 0.41
332 0.41
333 0.38
334 0.32
335 0.26
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.22
340 0.22
341 0.21
342 0.25
343 0.27
344 0.26
345 0.29
346 0.37
347 0.39
348 0.39
349 0.41
350 0.44
351 0.45
352 0.46
353 0.45
354 0.41
355 0.38
356 0.41
357 0.4
358 0.39
359 0.42
360 0.41
361 0.39
362 0.4
363 0.41
364 0.45
365 0.44
366 0.43
367 0.44
368 0.43
369 0.42
370 0.43
371 0.41
372 0.37
373 0.42
374 0.39
375 0.33
376 0.36
377 0.38
378 0.31
379 0.3
380 0.33
381 0.36
382 0.41
383 0.49
384 0.51
385 0.55
386 0.64
387 0.69
388 0.71
389 0.71
390 0.75
391 0.74
392 0.72
393 0.73
394 0.67
395 0.65
396 0.69
397 0.64
398 0.61
399 0.6
400 0.57
401 0.52
402 0.54
403 0.52
404 0.46
405 0.44
406 0.42
407 0.41
408 0.4
409 0.41
410 0.43
411 0.42
412 0.4
413 0.39
414 0.36
415 0.34
416 0.34
417 0.38
418 0.35
419 0.39
420 0.4
421 0.42
422 0.45
423 0.43
424 0.47
425 0.44
426 0.44
427 0.4
428 0.44
429 0.43
430 0.42
431 0.4
432 0.35
433 0.35
434 0.31
435 0.3
436 0.25
437 0.23
438 0.21
439 0.2
440 0.22
441 0.18
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.16
446 0.16
447 0.19
448 0.24
449 0.31
450 0.34
451 0.41
452 0.5
453 0.57
454 0.6
455 0.6
456 0.58
457 0.58
458 0.6
459 0.58
460 0.58
461 0.56
462 0.58
463 0.62
464 0.6
465 0.57
466 0.61
467 0.56
468 0.52
469 0.51
470 0.52
471 0.48
472 0.45
473 0.43
474 0.4
475 0.44
476 0.4
477 0.37
478 0.33
479 0.34
480 0.36
481 0.42
482 0.44
483 0.44
484 0.48
485 0.5
486 0.56
487 0.52
488 0.51
489 0.51
490 0.51
491 0.47
492 0.48
493 0.5
494 0.47
495 0.49
496 0.52
497 0.51
498 0.49
499 0.56
500 0.59
501 0.59
502 0.58
503 0.58
504 0.55
505 0.51
506 0.48
507 0.42
508 0.36
509 0.31
510 0.27
511 0.28
512 0.3
513 0.27
514 0.27
515 0.27
516 0.23
517 0.21
518 0.27
519 0.32
520 0.34
521 0.38
522 0.41
523 0.43
524 0.46
525 0.5
526 0.48
527 0.44
528 0.42
529 0.43
530 0.43
531 0.39
532 0.4
533 0.36
534 0.32
535 0.29
536 0.27
537 0.26
538 0.27
539 0.3
540 0.29
541 0.33
542 0.38
543 0.45
544 0.52
545 0.57
546 0.57
547 0.61
548 0.69
549 0.75
550 0.79
551 0.83
552 0.83
553 0.81
554 0.78
555 0.73
556 0.65
557 0.59
558 0.54
559 0.48
560 0.39
561 0.34
562 0.3
563 0.27
564 0.24
565 0.18
566 0.13
567 0.08
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.1
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.13
579 0.12
580 0.11
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.1
594 0.16
595 0.16
596 0.17
597 0.2
598 0.24
599 0.25
600 0.28
601 0.33
602 0.34
603 0.37
604 0.42
605 0.41
606 0.43
607 0.49
608 0.5
609 0.45
610 0.41
611 0.44
612 0.48
613 0.49
614 0.45
615 0.43
616 0.44