Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1ZPZ3

Protein Details
Accession A0A1Y1ZPZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-517RVQSGKSSKPPPNKRRRVRGGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
500-515KSSKPPPNKRRRVRGG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MPSDEKAPVKLSLPLEFQQDIFKELREEDELVLIARGLGVLRIVTNLLHSYDAAGNNLILLVGADERENVWIGEALAEHAAISMAPKARGLSLVNTDLMSVGTREKMYAQGGIFSITSRILIVDFLSGLMNPETVTGVVVLHAERVIATSLEAFILRIYRQKNKAGFLKAFSDQPEPFTTGFAPLHNMMKNLFLQKPALYPRFHVAVAKSLEGRKKAEVIELEVPMTDAMRDIQNAVLECVEVSISELRKANTGIEMEDWTLDSALHRNFDTIIRRQLDPVWHRTSFKTRQVVRDLTLLRTILHALLTYDAVNFNKYLDTVLAASQPPPGSTRHNQSPWLFLDAADTIFTTAKRRVYTGKVSNADLADNLNAVPDSLEPVLEEFPKWNQLAEILQEIEQDAYLNPTPNDTSNGSILIMCGDQGTCRQLREYLQTMYVRPEGIAEDEDAVEKDPSASFMMRRKLRNYLAWKRDFSKVSAALFSENQKAINGSTEQRVQSGKSSKPPPNKRRRVRGGGAVPGSTRADTGAVRTAGDRDAHIASLMAELQPTEIEAMQKTEIGLDPLENMEDYYDLFDMNEVIVIHPYEGDMDEHVLEETKPRYVIMYEPDAAFIRRIEVYRSSHTDRTVKVFFMYYGGSVEEQRYLSAVRREKDAFTKLIRERGNMAITLTAAALDPQESFLRTINTRIAGGGRLAATTQPPRVVVDVREFRSSLPSLLHGRGIVIVPCMLTVGDYVVTPDICIERKSVRDLIGSFSNGRLYNQVESMMEHYKSPMLLIEFDQNKSFTLEPFSDLSVPTTTAGLAVAPDLQGKIVMLTLAFPRLKIIWSSSPYQTAEIFSELKKQQDEPDPLKAVQLGLDPAMAGDEMRTFNQVPQDMLRAVPGMNEKILTTLSLEIESIQELANMEERDIAKLVGTDAARRIYRFFNKSLYETADIGLPTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.35
4 0.33
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.26
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.25
13 0.23
14 0.24
15 0.21
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.14
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.12
37 0.15
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.11
46 0.07
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.09
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.18
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.25
81 0.25
82 0.24
83 0.23
84 0.2
85 0.19
86 0.15
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.09
144 0.14
145 0.19
146 0.28
147 0.33
148 0.41
149 0.45
150 0.5
151 0.57
152 0.59
153 0.57
154 0.52
155 0.51
156 0.45
157 0.44
158 0.4
159 0.37
160 0.3
161 0.3
162 0.3
163 0.28
164 0.26
165 0.24
166 0.22
167 0.21
168 0.21
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.18
176 0.21
177 0.23
178 0.25
179 0.24
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.27
184 0.32
185 0.34
186 0.3
187 0.31
188 0.33
189 0.34
190 0.33
191 0.3
192 0.24
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.26
197 0.28
198 0.32
199 0.33
200 0.34
201 0.29
202 0.3
203 0.29
204 0.31
205 0.28
206 0.28
207 0.3
208 0.27
209 0.26
210 0.22
211 0.21
212 0.16
213 0.15
214 0.09
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.05
230 0.06
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.1
252 0.11
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.18
258 0.23
259 0.23
260 0.3
261 0.31
262 0.31
263 0.32
264 0.34
265 0.38
266 0.38
267 0.41
268 0.39
269 0.39
270 0.4
271 0.42
272 0.48
273 0.47
274 0.5
275 0.52
276 0.5
277 0.55
278 0.6
279 0.59
280 0.52
281 0.52
282 0.45
283 0.38
284 0.36
285 0.29
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.18
318 0.23
319 0.29
320 0.35
321 0.37
322 0.42
323 0.42
324 0.45
325 0.4
326 0.39
327 0.32
328 0.24
329 0.23
330 0.18
331 0.17
332 0.13
333 0.11
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.21
343 0.26
344 0.35
345 0.38
346 0.43
347 0.42
348 0.42
349 0.43
350 0.39
351 0.34
352 0.25
353 0.19
354 0.11
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.14
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.08
404 0.07
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.13
416 0.18
417 0.2
418 0.19
419 0.22
420 0.23
421 0.23
422 0.24
423 0.23
424 0.18
425 0.14
426 0.14
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.09
444 0.15
445 0.22
446 0.27
447 0.3
448 0.31
449 0.36
450 0.39
451 0.44
452 0.48
453 0.51
454 0.54
455 0.56
456 0.56
457 0.52
458 0.55
459 0.48
460 0.4
461 0.36
462 0.3
463 0.27
464 0.25
465 0.23
466 0.18
467 0.18
468 0.19
469 0.16
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.15
484 0.19
485 0.23
486 0.23
487 0.28
488 0.35
489 0.4
490 0.5
491 0.6
492 0.66
493 0.71
494 0.8
495 0.81
496 0.84
497 0.87
498 0.85
499 0.78
500 0.75
501 0.69
502 0.64
503 0.56
504 0.46
505 0.37
506 0.3
507 0.27
508 0.18
509 0.13
510 0.08
511 0.08
512 0.07
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.09
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.05
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.06
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.13
590 0.14
591 0.17
592 0.17
593 0.17
594 0.19
595 0.18
596 0.18
597 0.16
598 0.13
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.13
603 0.17
604 0.2
605 0.24
606 0.3
607 0.33
608 0.34
609 0.38
610 0.39
611 0.36
612 0.38
613 0.35
614 0.3
615 0.26
616 0.24
617 0.2
618 0.18
619 0.16
620 0.11
621 0.09
622 0.1
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.13
632 0.2
633 0.25
634 0.24
635 0.29
636 0.31
637 0.32
638 0.37
639 0.37
640 0.34
641 0.31
642 0.39
643 0.36
644 0.42
645 0.41
646 0.37
647 0.36
648 0.37
649 0.36
650 0.27
651 0.25
652 0.18
653 0.17
654 0.16
655 0.12
656 0.07
657 0.06
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.09
666 0.11
667 0.14
668 0.14
669 0.17
670 0.18
671 0.19
672 0.18
673 0.17
674 0.17
675 0.15
676 0.14
677 0.14
678 0.11
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.12
683 0.14
684 0.16
685 0.15
686 0.16
687 0.17
688 0.19
689 0.2
690 0.19
691 0.25
692 0.31
693 0.32
694 0.34
695 0.33
696 0.31
697 0.34
698 0.33
699 0.25
700 0.19
701 0.2
702 0.22
703 0.23
704 0.23
705 0.18
706 0.17
707 0.18
708 0.17
709 0.14
710 0.11
711 0.1
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.08
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.13
730 0.16
731 0.19
732 0.24
733 0.26
734 0.26
735 0.29
736 0.29
737 0.31
738 0.31
739 0.31
740 0.26
741 0.24
742 0.26
743 0.23
744 0.23
745 0.21
746 0.2
747 0.19
748 0.19
749 0.2
750 0.16
751 0.16
752 0.19
753 0.21
754 0.19
755 0.17
756 0.18
757 0.17
758 0.17
759 0.16
760 0.15
761 0.12
762 0.13
763 0.14
764 0.22
765 0.23
766 0.25
767 0.27
768 0.24
769 0.24
770 0.25
771 0.24
772 0.16
773 0.19
774 0.18
775 0.19
776 0.2
777 0.21
778 0.19
779 0.19
780 0.2
781 0.16
782 0.16
783 0.14
784 0.13
785 0.11
786 0.1
787 0.09
788 0.07
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.07
797 0.07
798 0.07
799 0.06
800 0.06
801 0.05
802 0.07
803 0.08
804 0.14
805 0.15
806 0.14
807 0.16
808 0.17
809 0.18
810 0.19
811 0.23
812 0.24
813 0.28
814 0.32
815 0.33
816 0.37
817 0.37
818 0.37
819 0.32
820 0.27
821 0.25
822 0.24
823 0.23
824 0.19
825 0.27
826 0.27
827 0.3
828 0.3
829 0.3
830 0.34
831 0.41
832 0.49
833 0.45
834 0.52
835 0.52
836 0.5
837 0.49
838 0.43
839 0.34
840 0.27
841 0.24
842 0.17
843 0.13
844 0.13
845 0.11
846 0.1
847 0.1
848 0.08
849 0.06
850 0.05
851 0.08
852 0.1
853 0.11
854 0.14
855 0.14
856 0.17
857 0.24
858 0.24
859 0.24
860 0.25
861 0.29
862 0.26
863 0.26
864 0.25
865 0.19
866 0.18
867 0.19
868 0.21
869 0.19
870 0.19
871 0.19
872 0.18
873 0.18
874 0.19
875 0.15
876 0.13
877 0.13
878 0.13
879 0.13
880 0.13
881 0.12
882 0.12
883 0.12
884 0.11
885 0.09
886 0.09
887 0.09
888 0.1
889 0.15
890 0.15
891 0.14
892 0.19
893 0.19
894 0.21
895 0.21
896 0.2
897 0.15
898 0.15
899 0.16
900 0.16
901 0.16
902 0.17
903 0.2
904 0.26
905 0.28
906 0.28
907 0.31
908 0.34
909 0.43
910 0.45
911 0.46
912 0.47
913 0.5
914 0.52
915 0.54
916 0.5
917 0.45
918 0.4
919 0.37
920 0.32