FuNGI

B8PE33

Protein Details

Accession

B8PE33

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
358-381	DDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
338-388	RGRGRGRNRHPPGRDGGGRRDDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGRDDRGPWA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	ppl:POSPLDRAFT_106661 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MTVRTATLTASGNAPPSVSATDSDSSSDSDVDSHDSDSDEKAKKAPPTSGKLEILLDDEDETGPAVISEAQTRTKNEIPETEAKVIIPDIEEVGSDEVLEKVGEVMSIFDKVVIVKGSAPEYTNRASERALDSDTLLVFEDRKVLGYIYETFGPTSQPLYQIKFNEKYPLNPERVQLSRPVFHVSQRSNFVFVGQLRRLKGSDASNVYDEEPADEELDFSDDEAEAAHKRALTERRRGQSVTSSRHATPTPSQMRDQDMADDSYGANPYDTSGPYNDMDFGAGPSRPAPIPYDDPYSDSYGVDDAQLPSVEGESRSPVTSRRREDDDDASIDGRINDRGRGRGRNRHPPGRDGGGRRDDRGRGRGRDRPRGNRGRGRGRGRDDRGPWAGHERGRQPSSFSDAQDAPAPRPLSPTSLAIARATGQYADGSAVGPDAQSQASGWSHPQYTADQQYNFSFGYQNQYVQPHINPRFASNFGMNFGFQQGNQYMPYGYNGVGYSGGGNPSWDQEYSRNTGAQRLNNEGGSPRTEEPTGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.15
3	0.15
4	0.16
5	0.15
6	0.14
7	0.16
8	0.18
9	0.18
10	0.2
11	0.19
12	0.18
13	0.18
14	0.17
15	0.13
16	0.12
17	0.13
18	0.15
19	0.15
20	0.15
21	0.14
22	0.15
23	0.16
24	0.19
25	0.26
26	0.26
27	0.26
28	0.29
29	0.34
30	0.39
31	0.42
32	0.47
33	0.48
34	0.51
35	0.57
36	0.6
37	0.56
38	0.51
39	0.48
40	0.4
41	0.34
42	0.27
43	0.21
44	0.15
45	0.14
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.08
50	0.07
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.07
55	0.1
56	0.13
57	0.18
58	0.21
59	0.24
60	0.3
61	0.33
62	0.36
63	0.36
64	0.38
65	0.39
66	0.43
67	0.46
68	0.43
69	0.39
70	0.35
71	0.33
72	0.29
73	0.23
74	0.16
75	0.11
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.05
92	0.06
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.12
104	0.13
105	0.14
106	0.15
107	0.15
108	0.18
109	0.2
110	0.21
111	0.21
112	0.2
113	0.2
114	0.23
115	0.24
116	0.23
117	0.22
118	0.2
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.15
123	0.12
124	0.1
125	0.09
126	0.09
127	0.11
128	0.09
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.12
134	0.14
135	0.13
136	0.14
137	0.14
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.15
145	0.17
146	0.21
147	0.25
148	0.27
149	0.34
150	0.35
151	0.35
152	0.38
153	0.36
154	0.37
155	0.4
156	0.43
157	0.41
158	0.4
159	0.41
160	0.38
161	0.39
162	0.36
163	0.36
164	0.33
165	0.29
166	0.29
167	0.32
168	0.27
169	0.29
170	0.35
171	0.32
172	0.32
173	0.36
174	0.35
175	0.33
176	0.32
177	0.29
178	0.25
179	0.24
180	0.26
181	0.24
182	0.27
183	0.26
184	0.27
185	0.27
186	0.25
187	0.27
188	0.23
189	0.26
190	0.25
191	0.26
192	0.25
193	0.26
194	0.25
195	0.22
196	0.18
197	0.13
198	0.11
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.07
203	0.06
204	0.08
205	0.07
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.14
218	0.22
219	0.27
220	0.36
221	0.42
222	0.45
223	0.48
224	0.48
225	0.44
226	0.44
227	0.46
228	0.42
229	0.39
230	0.39
231	0.36
232	0.38
233	0.37
234	0.31
235	0.26
236	0.3
237	0.33
238	0.31
239	0.33
240	0.32
241	0.35
242	0.34
243	0.31
244	0.23
245	0.18
246	0.17
247	0.15
248	0.13
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.07
253	0.06
254	0.05
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.08
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.11
277	0.15
278	0.18
279	0.22
280	0.21
281	0.23
282	0.24
283	0.25
284	0.23
285	0.18
286	0.16
287	0.12
288	0.12
289	0.1
290	0.1
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.15
305	0.23
306	0.31
307	0.35
308	0.37
309	0.41
310	0.45
311	0.48
312	0.47
313	0.42
314	0.36
315	0.33
316	0.29
317	0.23
318	0.2
319	0.16
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.15
324	0.16
325	0.22
326	0.26
327	0.35
328	0.41
329	0.47
330	0.54
331	0.62
332	0.68
333	0.71
334	0.69
335	0.64
336	0.63
337	0.6
338	0.58
339	0.51
340	0.51
341	0.51
342	0.5
343	0.48
344	0.48
345	0.46
346	0.45
347	0.49
348	0.49
349	0.47
350	0.52
351	0.58
352	0.62
353	0.67
354	0.71
355	0.72
356	0.75
357	0.78
358	0.8
359	0.81
360	0.81
361	0.81
362	0.81
363	0.79
364	0.77
365	0.75
366	0.76
367	0.73
368	0.73
369	0.65
370	0.63
371	0.59
372	0.51
373	0.45
374	0.42
375	0.4
376	0.36
377	0.38
378	0.36
379	0.4
380	0.42
381	0.4
382	0.37
383	0.35
384	0.39
385	0.36
386	0.32
387	0.29
388	0.27
389	0.28
390	0.31
391	0.3
392	0.24
393	0.27
394	0.27
395	0.22
396	0.26
397	0.25
398	0.23
399	0.24
400	0.25
401	0.2
402	0.22
403	0.23
404	0.19
405	0.18
406	0.16
407	0.14
408	0.13
409	0.11
410	0.1
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.09
426	0.1
427	0.11
428	0.13
429	0.15
430	0.16
431	0.17
432	0.19
433	0.19
434	0.25
435	0.31
436	0.35
437	0.33
438	0.34
439	0.35
440	0.36
441	0.33
442	0.27
443	0.21
444	0.16
445	0.23
446	0.22
447	0.23
448	0.24
449	0.26
450	0.28
451	0.29
452	0.32
453	0.34
454	0.37
455	0.41
456	0.38
457	0.39
458	0.41
459	0.4
460	0.41
461	0.34
462	0.31
463	0.28
464	0.29
465	0.25
466	0.22
467	0.23
468	0.2
469	0.15
470	0.19
471	0.18
472	0.18
473	0.19
474	0.19
475	0.17
476	0.16
477	0.19
478	0.15
479	0.14
480	0.15
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.13
485	0.12
486	0.13
487	0.14
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.15
492	0.17
493	0.16
494	0.17
495	0.21
496	0.27
497	0.31
498	0.33
499	0.34
500	0.32
501	0.4
502	0.44
503	0.45
504	0.44
505	0.46
506	0.47
507	0.44
508	0.45
509	0.4
510	0.36
511	0.33
512	0.33
513	0.27
514	0.28

B8PE33

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer