Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YBT8

Protein Details
Accession A0A1Y1YBT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAKTKPQDHSRKSKKNGKNGASNGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-30SRKSKKNGKNGASNGTPKKPK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MAKTKPQDHSRKSKKNGKNGASNGTPKKPKASPETLLIQAAALLQTSQPEEALVLAKRALGLLRPTSEPTLAALPALNLLGEINVELGEPETAREAFLAAVQLDEDGEEDGAEKFLWLAQLCEEGGAESVQWFEKGIEVLKREIGEMEGKLKKAEVTEALEEKKTKVANALCGIAEVYMTDLSWEEDAEARCEAAATEALLMAPNNPEPLQTLASIRISQLRTEDAKAALRRSVDLWKNLDPDDPKVPDFSTRISLSRLLMEAEMEEEAIEVLERLVGENDSSVEAWYLGGWCLHLLAEKRKADDESDIAASLMRASRDWLDNCLKLYSMLEYEDERLKEHADELLKGLNDTLGPSTREDEEEWEDEDEDGAGEDEDEDMEGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.9
4 0.87
5 0.86
6 0.81
7 0.79
8 0.75
9 0.75
10 0.72
11 0.71
12 0.7
13 0.61
14 0.63
15 0.6
16 0.6
17 0.61
18 0.61
19 0.56
20 0.55
21 0.58
22 0.53
23 0.49
24 0.41
25 0.32
26 0.24
27 0.2
28 0.14
29 0.09
30 0.07
31 0.06
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.15
49 0.18
50 0.2
51 0.22
52 0.25
53 0.26
54 0.26
55 0.23
56 0.2
57 0.19
58 0.16
59 0.15
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.1
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.11
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.17
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.21
151 0.17
152 0.15
153 0.18
154 0.18
155 0.21
156 0.22
157 0.23
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.12
162 0.11
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.16
213 0.2
214 0.22
215 0.22
216 0.21
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.26
221 0.24
222 0.27
223 0.29
224 0.3
225 0.32
226 0.32
227 0.34
228 0.27
229 0.27
230 0.28
231 0.26
232 0.24
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.21
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.23
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.09
283 0.12
284 0.19
285 0.27
286 0.29
287 0.31
288 0.33
289 0.35
290 0.33
291 0.33
292 0.29
293 0.24
294 0.23
295 0.21
296 0.19
297 0.18
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.1
302 0.09
303 0.11
304 0.15
305 0.21
306 0.22
307 0.27
308 0.31
309 0.32
310 0.34
311 0.32
312 0.29
313 0.24
314 0.24
315 0.2
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.18
321 0.22
322 0.22
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.2
328 0.22
329 0.19
330 0.19
331 0.2
332 0.23
333 0.22
334 0.21
335 0.2
336 0.16
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.18
343 0.2
344 0.21
345 0.23
346 0.23
347 0.25
348 0.27
349 0.27
350 0.28
351 0.26
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.17
356 0.12
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06