Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9DGI0

Protein Details
Accession A0A1S9DGI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-248NSKSNKKGGKGSKKSARQQDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-242APSGGNSKSNKKGGKGSKKS
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 12.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR039100  Sdo1/SBDS-like  
IPR046928  SDO1/SBDS_C  
IPR018978  SDO1/SBDS_central  
IPR037188  Sdo1/SBDS_central_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Gene Ontology GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF20268  SBDS_C  
PF09377  SBDS_domain_II  
Amino Acid Sequences MPIMQPRKKRFELACYKNKLLEYRSGAEKDLDNVLQVPTIFLSVSKAQTAPSAEIAKAFGANTPADEIRQEILRKGEVQVGERERKEIIERVEKEVLDIVSGRLVDPTTKRVYTPGMISKALDQLSSASGQMQQAQSQNNNGEASGARDESRPAQPRKPLWTGVTPNKSAKIQALEAMKALIAWQPIPVMRARMRLRVTCPVPLLKQTVKSAAPAGLNKEKEAPSGGNSKSNKKGGKGSKKSARQQDSDAEGGSDAEPSQPKAPTNVKDKILSFIESVESQEIAGDEWEVVGFAEPGAFKGLNEFVGNDTRGRGRVEVLDMAVTHED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.74
3 0.73
4 0.69
5 0.67
6 0.61
7 0.54
8 0.52
9 0.49
10 0.45
11 0.49
12 0.47
13 0.44
14 0.41
15 0.39
16 0.33
17 0.3
18 0.25
19 0.19
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.12
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.2
36 0.22
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.2
41 0.21
42 0.21
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.21
63 0.24
64 0.21
65 0.23
66 0.28
67 0.32
68 0.37
69 0.36
70 0.36
71 0.32
72 0.32
73 0.32
74 0.3
75 0.29
76 0.32
77 0.34
78 0.38
79 0.41
80 0.4
81 0.37
82 0.35
83 0.29
84 0.19
85 0.18
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.15
95 0.18
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.22
100 0.22
101 0.25
102 0.27
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.26
108 0.25
109 0.19
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.1
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.12
119 0.11
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.18
128 0.15
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.13
138 0.2
139 0.25
140 0.28
141 0.32
142 0.37
143 0.4
144 0.46
145 0.46
146 0.42
147 0.37
148 0.4
149 0.41
150 0.44
151 0.44
152 0.4
153 0.38
154 0.37
155 0.35
156 0.29
157 0.25
158 0.19
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.11
177 0.12
178 0.21
179 0.23
180 0.29
181 0.32
182 0.34
183 0.37
184 0.41
185 0.41
186 0.36
187 0.36
188 0.32
189 0.3
190 0.3
191 0.31
192 0.25
193 0.27
194 0.26
195 0.28
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.21
200 0.22
201 0.19
202 0.24
203 0.26
204 0.26
205 0.26
206 0.29
207 0.26
208 0.24
209 0.26
210 0.21
211 0.17
212 0.24
213 0.24
214 0.28
215 0.3
216 0.36
217 0.4
218 0.46
219 0.46
220 0.41
221 0.5
222 0.53
223 0.62
224 0.64
225 0.67
226 0.7
227 0.76
228 0.82
229 0.82
230 0.79
231 0.71
232 0.66
233 0.63
234 0.58
235 0.5
236 0.41
237 0.31
238 0.25
239 0.22
240 0.18
241 0.12
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.12
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.23
250 0.3
251 0.34
252 0.41
253 0.45
254 0.45
255 0.48
256 0.48
257 0.47
258 0.42
259 0.38
260 0.3
261 0.25
262 0.24
263 0.19
264 0.2
265 0.16
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.21
294 0.22
295 0.19
296 0.21
297 0.22
298 0.24
299 0.26
300 0.24
301 0.22
302 0.25
303 0.28
304 0.27
305 0.25
306 0.24
307 0.22