Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S9D5L3

Protein Details
Accession A0A1S9D5L3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-71MVKECRNLRKAAKSQRKLQLNDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7, cyto_nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MPRLRNTAEKTKLFGPSHWMYTAEKIASDQIDSQNMDISIVDMKADLADMVKECRNLRKAAKSQRKLQLNDPVPDLLSTFPERHVCDELASAYIRTFEKMYRVVHIPSFWKEYYQFWEAPHASSTSFLIKLGLIFSIGTTFYPILGESERLRHLAQTWIYAAQWWLVGPSEKSTRNLDGIQVFCLLLVSRKTNTIGSSPWLSTGSLLRMAMTMGLHRDPRVFPGLAPFQAEMRSRLWTTILELVVHGSIDSSSMPLMISPQDFDNHVPHNINDADLWPATQEFSTPKPLKQFTESSIQLLMRQSLPIRMEAAKLINSSNLEQSYNAYSGETDLHRKFLDMQIRRYILLLHRPYMLQAQHNPRFYLSRKICGESAMIIASYAESLQLPSQNLDDLSRLMVMSTGPFCGALHLDIITVLGLEVTSQLKETATGSSEPGQLTMDPLAEMSKAQREPMIRILEHINDQMLQVVALGIARFKRYIFLSVVLCQIRALESGTRDIRPLMIKAVQESVKNCYMAVQSSQSVSTPQGPIETLICTESPPGLDFNLMDPNLDFSAFFAHFSGGGGDGICIGNNSPTVKIAVNEGDKELWMAFYASGIKKALHILPYATAIVSPAHWNSASTSNFDTILVYDLLSDCQAVLTSRRAHIIRYTTLHLPTELISSVTKPKSRATRHLSAAEFKFRLQRSESSARSDSQDAKIYVLASPSHNICDVHQARHRADAAIYRYHSQPHLSLTLRSTSTGDYCDVYLTHDSMSVRKAHNAGRNHLRNVLEYYQQIGQEKAQSVIDSITSSYAAEGQAVPNPAMAPPGAFPPPFPFPGRPGQLPPPPFGFPPPGGPNGAPGMPPPPGAKGLPFPPPFPQASGAPGSLPPLPNMPAGNVPFPPPPGGFPPNFQIPAPGAPGFPPMPGAIPGQPGFSPSSTPGISGPPGQEGGYAPPPGAGSAGLPGPPPGLGEPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.45
4 0.46
5 0.43
6 0.39
7 0.32
8 0.35
9 0.39
10 0.31
11 0.26
12 0.23
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.22
18 0.27
19 0.27
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.23
24 0.19
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.08
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.06
35 0.08
36 0.09
37 0.14
38 0.17
39 0.21
40 0.23
41 0.32
42 0.36
43 0.41
44 0.47
45 0.54
46 0.61
47 0.68
48 0.77
49 0.76
50 0.81
51 0.84
52 0.85
53 0.78
54 0.76
55 0.76
56 0.72
57 0.67
58 0.6
59 0.52
60 0.44
61 0.4
62 0.33
63 0.23
64 0.2
65 0.2
66 0.18
67 0.2
68 0.25
69 0.26
70 0.3
71 0.33
72 0.29
73 0.27
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.21
78 0.17
79 0.13
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.2
86 0.25
87 0.27
88 0.28
89 0.31
90 0.33
91 0.34
92 0.36
93 0.35
94 0.34
95 0.39
96 0.34
97 0.34
98 0.32
99 0.33
100 0.36
101 0.36
102 0.33
103 0.28
104 0.37
105 0.35
106 0.35
107 0.33
108 0.28
109 0.23
110 0.22
111 0.23
112 0.17
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.14
134 0.13
135 0.18
136 0.19
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.21
141 0.25
142 0.25
143 0.23
144 0.24
145 0.23
146 0.22
147 0.22
148 0.2
149 0.14
150 0.13
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.15
157 0.21
158 0.23
159 0.27
160 0.3
161 0.32
162 0.33
163 0.33
164 0.33
165 0.32
166 0.3
167 0.28
168 0.25
169 0.22
170 0.18
171 0.18
172 0.13
173 0.11
174 0.13
175 0.15
176 0.15
177 0.18
178 0.2
179 0.21
180 0.23
181 0.22
182 0.21
183 0.21
184 0.24
185 0.22
186 0.22
187 0.21
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.24
208 0.21
209 0.19
210 0.25
211 0.29
212 0.27
213 0.28
214 0.25
215 0.21
216 0.25
217 0.26
218 0.21
219 0.18
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.16
225 0.18
226 0.2
227 0.19
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.1
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.14
251 0.17
252 0.17
253 0.19
254 0.2
255 0.19
256 0.22
257 0.21
258 0.2
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.21
272 0.23
273 0.25
274 0.32
275 0.35
276 0.37
277 0.39
278 0.4
279 0.33
280 0.39
281 0.37
282 0.32
283 0.32
284 0.29
285 0.26
286 0.24
287 0.23
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.15
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.13
317 0.12
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.22
325 0.3
326 0.29
327 0.33
328 0.37
329 0.38
330 0.38
331 0.36
332 0.33
333 0.27
334 0.31
335 0.29
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.25
340 0.27
341 0.25
342 0.2
343 0.25
344 0.33
345 0.38
346 0.4
347 0.4
348 0.36
349 0.38
350 0.37
351 0.4
352 0.33
353 0.35
354 0.35
355 0.37
356 0.36
357 0.33
358 0.32
359 0.22
360 0.2
361 0.13
362 0.1
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.03
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.03
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.06
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.11
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.12
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.13
438 0.13
439 0.16
440 0.22
441 0.24
442 0.19
443 0.21
444 0.22
445 0.21
446 0.21
447 0.19
448 0.13
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.07
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.11
467 0.12
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.2
472 0.18
473 0.17
474 0.14
475 0.13
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.07
480 0.08
481 0.12
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.12
490 0.14
491 0.13
492 0.14
493 0.18
494 0.17
495 0.18
496 0.18
497 0.2
498 0.19
499 0.19
500 0.18
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.15
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.12
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.05
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.11
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.15
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.11
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.05
581 0.1
582 0.09
583 0.11
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.15
588 0.16
589 0.14
590 0.14
591 0.13
592 0.13
593 0.15
594 0.14
595 0.11
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.11
606 0.17
607 0.18
608 0.18
609 0.19
610 0.19
611 0.19
612 0.19
613 0.17
614 0.1
615 0.12
616 0.09
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.04
624 0.04
625 0.05
626 0.05
627 0.07
628 0.11
629 0.14
630 0.15
631 0.2
632 0.2
633 0.21
634 0.25
635 0.28
636 0.27
637 0.28
638 0.31
639 0.29
640 0.31
641 0.3
642 0.26
643 0.22
644 0.18
645 0.17
646 0.13
647 0.11
648 0.1
649 0.11
650 0.17
651 0.21
652 0.23
653 0.23
654 0.28
655 0.37
656 0.43
657 0.51
658 0.52
659 0.56
660 0.58
661 0.63
662 0.59
663 0.56
664 0.53
665 0.5
666 0.43
667 0.36
668 0.38
669 0.32
670 0.34
671 0.31
672 0.31
673 0.33
674 0.41
675 0.41
676 0.41
677 0.42
678 0.4
679 0.4
680 0.4
681 0.35
682 0.3
683 0.35
684 0.28
685 0.27
686 0.27
687 0.25
688 0.22
689 0.2
690 0.18
691 0.13
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.14
698 0.24
699 0.25
700 0.29
701 0.33
702 0.37
703 0.37
704 0.42
705 0.42
706 0.32
707 0.31
708 0.31
709 0.3
710 0.31
711 0.31
712 0.28
713 0.29
714 0.3
715 0.3
716 0.26
717 0.24
718 0.21
719 0.26
720 0.25
721 0.26
722 0.25
723 0.29
724 0.27
725 0.26
726 0.24
727 0.19
728 0.19
729 0.19
730 0.18
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.12
735 0.14
736 0.14
737 0.13
738 0.12
739 0.14
740 0.14
741 0.15
742 0.18
743 0.2
744 0.2
745 0.23
746 0.26
747 0.3
748 0.37
749 0.4
750 0.46
751 0.51
752 0.56
753 0.55
754 0.57
755 0.51
756 0.46
757 0.47
758 0.42
759 0.35
760 0.29
761 0.29
762 0.27
763 0.28
764 0.26
765 0.22
766 0.21
767 0.22
768 0.23
769 0.22
770 0.2
771 0.18
772 0.17
773 0.17
774 0.16
775 0.11
776 0.1
777 0.1
778 0.09
779 0.09
780 0.08
781 0.09
782 0.08
783 0.09
784 0.09
785 0.09
786 0.12
787 0.14
788 0.14
789 0.13
790 0.13
791 0.12
792 0.13
793 0.11
794 0.09
795 0.08
796 0.12
797 0.15
798 0.14
799 0.15
800 0.19
801 0.24
802 0.26
803 0.29
804 0.28
805 0.29
806 0.39
807 0.43
808 0.41
809 0.42
810 0.47
811 0.51
812 0.5
813 0.49
814 0.45
815 0.42
816 0.4
817 0.38
818 0.35
819 0.29
820 0.34
821 0.35
822 0.33
823 0.33
824 0.32
825 0.32
826 0.29
827 0.29
828 0.21
829 0.18
830 0.19
831 0.17
832 0.19
833 0.17
834 0.17
835 0.19
836 0.2
837 0.22
838 0.24
839 0.26
840 0.34
841 0.35
842 0.34
843 0.36
844 0.4
845 0.39
846 0.36
847 0.36
848 0.28
849 0.3
850 0.31
851 0.27
852 0.23
853 0.22
854 0.22
855 0.22
856 0.21
857 0.18
858 0.18
859 0.2
860 0.21
861 0.21
862 0.21
863 0.23
864 0.25
865 0.27
866 0.25
867 0.27
868 0.26
869 0.27
870 0.29
871 0.23
872 0.24
873 0.28
874 0.34
875 0.32
876 0.33
877 0.37
878 0.4
879 0.41
880 0.37
881 0.34
882 0.3
883 0.32
884 0.32
885 0.28
886 0.21
887 0.2
888 0.25
889 0.22
890 0.2
891 0.18
892 0.14
893 0.15
894 0.17
895 0.19
896 0.17
897 0.21
898 0.22
899 0.23
900 0.22
901 0.22
902 0.24
903 0.21
904 0.22
905 0.19
906 0.24
907 0.22
908 0.23
909 0.22
910 0.23
911 0.24
912 0.25
913 0.24
914 0.21
915 0.22
916 0.21
917 0.21
918 0.19
919 0.23
920 0.25
921 0.24
922 0.2
923 0.21
924 0.21
925 0.2
926 0.19
927 0.13
928 0.08
929 0.1
930 0.12
931 0.11
932 0.12
933 0.12
934 0.12
935 0.12
936 0.13